孙中山举帽从人丛中穿行，频频向人们致意。然后乘袁世凯的双马车由正阳门入城，进中华门。
孙中山的马车前呼后拥，沿途军警林立，军警背后更是人山人海。
在代理内务总长赵智庵等政府官员的陪同下，孙中山来到石大人胡同外交大楼下榻。
袁世凯在事先就命令对孙中山的接待仪式要十分隆重，供奉要十分丰盛。
为接孙中山来京，袁世凯筹划甚久，用心颇深，他把孙中山的馆舍选在石大人胡同外交大楼。即袁世凯的总统府。
这里的建筑既宽敞轩朗，铺陈亦富丽堂皇，这便于警卫，而他自己却搬到铁狮子胡同国务院去办公，故意把总统府腾出来，加以修缮，让给孙中山居住。
当晚，孙中山按“行客拜坐客”的老规矩，去铁狮子胡同袁世凯的办公处拜访袁世凯。
袁世凯早已迎于厅下，互相礼毕。手拉手来到大厅。
晚上，袁世凯设宴为孙中山接风洗尘，并亲自执盏于孙中山，致词道：“我盼望先生与克强久矣，今克强未与同行，未及共聆伟论，深引为憾。所幸先生惠然肯来，殊为欣慰。刻下时事日非，边警迭至，世凯识薄能鲜，深望先生有以教我，以固邦基，世凯多负国民付托，谨代表四万万同胞，求购宏论，以匡不逮，财政、外交，甚为棘手，尤望先生不时匡助。”
孙中山见袁世凯如此说。便道：“文久居海外，于国内情形或有未尽详悉之处，如有所知。自当贡献。惟自军兴以来，各处商务凋敝，民不聊生，金融滞塞，为患甚巨，挽救之术，惟有兴办实业，注意拓殖。然皆恃交通为发达之媒介，故当赶筑全国铁路，尚望大总统力为赞助，早日观成，则我民国前途受惠实多。”
“极是，极是！”袁世凯忙道。
于是，袁世凯与孙中山边筵边谈改革振兴大计，尽欢而散。
袁世凯为了表示竭诚招待，特派唐在礼和大礼官黄开文在石大人胡同孙中山的行邸照料，并派有侍从多人听从孙中山等人的支派使唤。
孙中山如外出，即有人安排车马，预备休憩餐膳之所。
同时，袁世凯又特别命令巡警总厅：凡孙先生出入除派车马侍从外，沿途均派军警护卫，并断绝交通。
孙中山每次外出，见途中总无一人，甚为诧异，得知是袁世凯特意安排之后，说：“鄙人虽系退位总统，不过国民一分子。若如此尊严，既非所以开诚见心，且受之甚觉不安，应即将随从马队及沿途军警一律撤去，俾得出入自由。如大总统坚执不肯，则鄙人小住一二日即他去矣！”
袁世凯得知孙中山的心思，忙将军警撤除了。
孙中山住进袁世凯的总统府后，一时石大人胡同车水马龙，前往谒孙的人很多，有新旧政府成员、有前清遗老、有广东同乡、有日本人、有新闻记者。
孙中山自然应酬不暇。
再说宋教仁为了实现以政党为基础的责任内阁制，征得孙中山、黄兴等人同意后。他在北京着手把共和党、国民公党、国民共进会、共和实进会与同盟会统一合并起来，改组为国民党。
早在8月13日，孙中山、黄兴就在上海通电国内外同盟会各支部，通告同盟会改组为国民党。
8月25日，国民党在北京湖广会馆召开成立大会，选出孙中山、黄兴、宋教仁、王芝祥等理事9人；选出参议张继、于佑任、马君武、田桐、柏文蔚、胡汉民、李烈钧、唐绍仪等29人。
孙中山来到会场，全体与会代表起立，脱帽向孙中山致敬。
然后，孙中山发表演讲，他说：“五党合并，从此成一伟大政党，或处于行政地位，或处于监督地位，总以国利民福为前提，则我中华民国将可日进富强。故兄弟于五党合并，有无穷之希望。……同盟会素所主张者有三民主义，一民族主义，二民权主义，三民生主义。今民族、民权已达目的，惟民生问题尚待解决。……男女平权本同盟会之党纲。此次欲组织坚强之大政党，既据五大党之政见，以此条可置缓图，则吾人以国家为前提，自不得不暂从多数取决。然苟能将共和巩固完全。男女自有平权之一日。”
孙中山讲演完，群情振奋，欢声雷动，在奏乐声中，孙中山退出会场。
袁世凯在总统府大宴孙中山及其随行人员。
宴席中。袁世凯与孙中山对坐，酒至半酣，袁世凯站起来讲话，他很动感情地道：孙先生游历海外廿余年，此次来京，与我所商者，大有造于民国前途。各项政见，潮有端倪……一时间殊难叙及。先是谣传南北有种种意见。今见孙先生来京，与我所谈者。极其诚恳，可见前此谣传，尽属误会。民国由此益加巩固。
最后，袁世凯高呼：“中山先生万岁！”
在万岁声中，孙中山也站起来，致答词：“袁总统富于政治经验，担任国事，可为中国得人庆……袁总统善于练兵，以中国之力，练兵数百万，保全我五大族领土。……以我五大族人民既庶且富，又能使人人受教育，与列强各文明国，并驾齐驱，又有强兵以为盾，十年后，当可为世界第一强国。”
答词致毕，孙中山也举杯高呼：“袁大总统万岁！”
这时，孙中山对袁世凯已“绝无可疑之余地”了，遂给黄兴发电：“到北京后，与项城接谈两次，关于实业各事，彼亦尚有计划，大致不甚相远，至国防、外交所见略同，以弟所见，项城实陷于可悲之境遇，而绝无可疑之余地。振武案实迫于黎之急电，非将顺其意，无以负黎之望。弟到此以来，大消北京意见，兄当速来，则南方风潮亦可止息。统一当有圆满之结果。”
孙中山要求黄兴也北上北京，与袁世凯会晤，表示对袁世凯的支持。
实际上，黄兴早就对袁世凯产生了怀疑，尤其是张振武案发生，他更不想北上进京与袁世凯会谈。
孙中山的电文，消除了黄兴对袁世凯的疑虑，于是他来到北京。
黄兴一到北京，一心一意扩大政党，他在北京逢人便动员其加入国民党，上至袁世凯，下至一般君主立宪派分子、旧官僚以及前清遗老，都是黄兴动员的对象。
而孙中山却不太过问政治，他一心扑在中国的实业上。在他的心目中，头一件大事，就是把中国的铁路搞上去。他到张家口视察了詹天佑设计修建的铁路，并游览了长城。
因此，袁世凯以总统的名义，发布命令：“特授孙文以筹划全国铁路之全权”。
黄兴来京后，袁世凯任命他为川粤汉铁路督办。
于是，孙中山与黄兴相约，两人皆放弃正式总统的竞选，安心地搞实业，让袁世凯做总统10年，把中国建设成强大之邦。
黄兴到京后，总统举行了欢迎黄兴的公宴，袁世凯再一次亲自到场主持。
因为有孙夫人参加，所以政府方面除了国务院各总长、次长及总统府各重要大员七八十人为陪宾外，袁夫人和府院大员的夫人及各部总长、次长的夫人也都参加了。
晚宴在居仁堂大殿举行。宴会开始，袁世凯讲了几句欢迎词，无非客套一番，继而，孙、黄答谢，话也简短，态度毫无拘束，内容无政治因素。
接下来，便是陪宾们依次致辞。
军事处副处长傅良佐坐席西南角，他在致辞时，不想他从恭维孙中山很自然地转向恭维袁，继而牵涉到政治，批评了国民党几句，说道：“共和是北洋之功，同盟会是暴徒，只会乱闹……”
说到这里，有人开始响应，叫喊：
“孙中山一点力量也没有！”
“孙中山是孙大炮，大骗子！”
晚宴骚乱起来。有人偷看孙中山，只见他态度从容如常，若无所闻，黄兴虽然有些坐立不安，但见孙中山如此，也稳坐泰山，不为所动。
这时，袁世凯站起身来，用掌猛砸桌子，众人立即寂静下来，袁世凯怒吼道：“我们今天欢迎孙先生、黄司令，不要说那些题外的话！”然后，他拱手向孙中山、黄兴说：“北洋军人都是老粗，程度不太够，望孙先生、黄司令多多海谅！”
孙中山气量宽广，面带微笑点头。他见袁世凯坐下。便站起来，举杯道：“我与黄兴相约，皆放弃正式总统的竞选，让项城作总统10年，练兵百万。我经营设计铁路，把铁路线延长20万里，民国即可富强！”
孙中山的演讲，说得袁世凯再次站起来大呼：“孙中山先生万岁！”
孙中山也呼喊：“大总统万岁！”
孙中山在北京逗留20多天，与袁世凯会晤13次，每次会谈，袁世凯都装出十分谦恭的样子，无论孙讲什么，他都颌首：“所言极是。”
就连孙中山提出的“耕者有其田”的激进主张，他也满口答称：“事所当然！”
偶有异处，袁世凯也说“贵论宏大，可以参考”等奉承话。
这使孙中山感到很满意，他后来曾说：“余在京，与袁总统时相晤谈，讨论国家大事，颇入精微。故余信，袁之为人，甚有肩膀，其头脑亦甚清楚，见天下事，均能明彻，而思想亦很新，不过做事手腕稍涉于旧，但办事本不能尽采新法……欲治民国，非具有新思想旧经验、旧手段者不可，而袁总统适足当之。”
9月中旬，孙中山由孔祥熙陪同，离京前往山西太原，去和阎锡山会面。
孙中山走后，袁世凯发表了自己拟定的袁、孙、黄、黎的共同宣言，也就是八大政纲。
共同宣言没有经过孙中山、黄兴的酌定，而黎元洪因为张振武等，回避与孙中山和黄兴会见，未入京，只列上名而已。
八大政纲如下：
一、立国取统一制度；
二、主持是非善恶之真公道，以正民俗；
三、暂时收束武备，先储备海陆军人才；
四、开放门户，输入外资，兴办矿山铁路，建置钢铁工厂，以厚民生；
五、提倡资助国民实业，先着手于农、林、工、商；
六、军事、外交、财政、司法、交通皆取中央集权主义，其余斟酌各省情形兼采地方分权主义；
七、迅速整理财政；
八、竭力调和党见，维持秩序，为各国承认之根本。
孙中山离开北京之后，不再过问袁世凯的政治，而一心扑在中国的铁路建设上。他为考察日本实业和解决经营铁路的经费问题，于1913年2月。与夫人卢慕贞及其子女孙科、孙姬、孙婉、英文秘书宋霭龄，乘坐山城丸号轮船离开上海，前往日本。