太元九年三月北地长史慕容泓闻燕王垂攻邺，亡奔关中收集鲜卑聚众数千，屯华阴败秦将强永，自称都督陕西诸军事，大将军，雍州牧，济北王。叛乱之迅再次传入长安，豫州刚作乱，怎想关中也祸起萧墙，首乱者皆以鲜卑慕容者为始，苻坚厚重彼族却被心腹所叛，实乃刚愎之惩命也。急命广平公苻熙为雍州刺史镇蒲阪，征巨鹿公苻睿为都督中外诸军事，卫大将军，录尚书事配兵五万，又以左将军窦冲为长史，龙骧将军姚苌为司马讨伐慕容泓。
大军刚至北地，平阳太守慕容冲起兵于平阳策应其兄慕容泓，拾两万众进攻蒲阪。苻熙实堪难以坚守派兵向苻睿求援，睿遣左将军窦冲援助蒲阪，此时慕容泓闻秦军将至，有却战之意率军退往关东待有利时机再行攻之。姚苌谏曰:慕容泓者一介鲜卑末贵，其部皆有思归之图，应逐其出关不可遏也。苻睿不听从追至华阴，反中慕容泓之计被围战死，姚苌见苻睿尸首极为恐惧，派其长史赵都，参军姜协折书谢罪苻坚，心惶恐难安又密信子姚兴自逃出长安。信使求见苻坚告之苻睿死因，坚无故大怒斩其二人，诏使臣欲逮捕姚苌，苌闻之大惊自叹道:天子戏怒自行不义之举，巨鹿公不听我之言反悖作死今却拿我下罪，幸有三窟之计，冠军反叛冀豫，慕容泓叛于关中，今起叛又如何！遂姚苌奔渭北，在天水尹纬，尹祥，南庞演等羌豪拥护下，率五万余户投奔姚苌推举其为盟主，自称大将军，大单于，万年秦王起兵作乱。
此刻长安三面寇起，翟斌围困洛阳进逼京师，慕容冲与窦冲战于蒲阪，不敌领八千骑投奔慕容泓，但仍然封死苻坚北进之路，姚苌自起叛来天下羌族皆号其诏令，武都奉降雍京危卵。长安如腾空之地老残弱旅不过万人，生力之军西域吕光，晋阳张蚝，邺城苻丕，氐族杨氏，河东云中刘库仁等皆处贼寇外围。晋国桓冲领桓豁，殷仲堪，杨亮进逼汉中，魏兴诸郡遥望洛水，杨铨期，刘牢之攻下颖川，洛阳近在咫尺，此乃为继祖逖，殷浩，桓温之后晋庭在谢安策划下又一次北伐矣！时瞬半载，京师偏郡皆降贼寇唯长安独存，笼困良久食极缺，苻坚每日两道素食，禁酒庭之乐。李太傅府中白绫披散落院之中，庭堂一棺椁摆道:祭仁弟汝南侯李公瑾业之灵位，兄李忧德祀上。
李忧德哀哭跪地伏于灵前，祷告苍天不佑李氏，血脉濒危今遭大难，若贼寇入京李氏一门必屠戮怠尽，为保李铉之命忧德彻夜难眠。苻坚闻李忧嗣不屈丁零恶贼舍身而死，加封其汝南郡侯，紫金光禄大夫，并亲自前来拜灵，李府闻迅府内五十四口皆出门迎拜圣恩。苻坚行灵柩前痛哭流泪悲痛之情不亚于李忧德，忧德撵独子李铉引拜君上，苻坚观此子额骨宽突，眉宇间深浓稠密英气逼人，叹为称奇。坚谓李忧德曰:昨日释道安法师舍其阳寿卜一卦象乃算道，卿之公子为逆天命格改数之人，日后必成大器，现长安危困各命难保，禅师乃意将公子送五重寺中可保其一命不知爱卿可否！忧德正虑愁李铉如何安置，道安应承何乐而不为，遂答应苻坚送李铉，庾庆之进修五重寺，李铉二人分别拜泣父母。此时巴蜀之地被晋粱州刺史杨亮围困，苻定，苻绍皆降于燕，慕容麟攻打常山，姚苌屯北地，幸得杨壁领军来援长安才得渡险恶之势。苻坚返宫中据道安谶言护出苻婧瑶，孙嫣嫆出宫进得五重寺，婧瑶不肯离弃父皇被苻坚强行送走。翌日，苻坚拾得步骑两万率将杨壁出征亲自讨伐姚苌，诸臣劝止苻坚却道:天子持绒诛伐叛逆应天顺行，今粮草竭尽待之牢笼终为饿鬼，若击溃之西连粱熙，吕光之兵，北引晋阳之兵南下，全盘皆可活也。
初战于赵氏坞连胜数仗，坚遣护军将军杨壁抄小道分而歼之。时天起大旱雨露皆无，姚苌军水源被秦人堵死，手下兵卒渴死许多，姚苌之弟姚尹被斩死阵中。苻坚大喜以为姚苌大军待死困住其必降之，怎奈天雷滚滚大雨倾盆，解了姚苌燃眉之急，苻坚怨气涌喉吐出殷血大呼:天佑贼矣不护我大秦！姚苌脱困自认凭己之力无法抗衡苻坚，遂想结盟慕容泓，然二人有间隙计难得施，不想天意再次助苌，慕容泓治军残暴败将皆以斩首，部下早已愤为不满。谋臣高盖不受慕容泓重用，政治苛暴遂袭杀慕容泓，立其弟慕容冲为皇太弟承制行事置百官，以盖为尚书令。高盖早有连衡姚苌之意，苌于是派其子姚嵩为慕容冲人质共抗秦军。七月，慕容垂之子慕容麟得常山，降苻亮，苻谟，麟又攻克中山执苻鉴。平原公苻晖自弃洛阳率七万归长安，将军杨壁不敌姚苌覆灭五万人马为姚苌所执，而慕容冲得宇文骏率两万西鬽军来投声势浩大，冲封其为领军将军，不下数月便攻至长安周围。苻坚岂可坐以待毙令平原公苻晖领将拒慕容冲，晖战败冲占据阿房宫离长安一步之遥。
长安食粮告罄，虽守城兵卒仍有五万但饥不裹腹无战斗之意，甚有断食饿死者数千，民户百姓皆分出存粮暂止饥饿，然时日长久城中几无余粮。慕容冲率先围住长安城，叫骂苻坚以泄其多年藏袖之怨，苻坚听闻慕容冲来围城，其自认为待慕容冲之情深厚，招来使者端来慕容冲往昔所穿锦袍意欲感化于他。慕容冲不受执意灭坚，坚登城楼对喊慕容冲道:凤凰小儿朕今以锦袍赠于卿，乃化干戈如何！但见慕容冲仰天狂笑对曰:孤今心在天下，岂是一小袍能恵，苻坚孽贼还不速速下城来降。苻坚听之愤怒震道:吾不用王景略，阳平公之言，使白虏敢至于此。几次派遣苻晖出战，每战必败，坚怒而羞辱于他，苻晖愤而自杀，又派驸马领军将军杨定出战，又被慕容冲擒之，无果求签五重寺，催僖得谶语念曰:龙浅沙河遭笼困，奔走五将方显神。苻坚疑谶为何意，此时道安正禅座明堂座化，待由弟子答道:陛下乃困长安是为凶险之地，若化劫数当前往五将山，其劫必会消弥。坚信之，欲见其女婧瑶一面，门下弟子告知其与师祖内堂禅修多有不便，坚无奈携张夫人，内侍催僖，苻冼，二女苻宝，苻锦及数千将士奔袭五将山，留太子宏镇守长安。坚奔五将山之迅不胫而走，姚苌派骁骑将军吴忠围擒苻坚，坚与卫士被冲散就擒，送至新平寺。姚苌初以礼待之派人求坚之传国玉玺，坚咒骂道:耳等道貌小人，传国玉玺早已送晋，汝等休想得也！姚苌又派右司马尹纬劝苻坚禅位，苻坚却骂道:姚苌叛贼何得圣君之位，宜求速死耳！入夜，苻坚执出藏剑刺死苻宝，苻锦二女，张夫人与苻冼自尽而亡，姚苌听房中动静前来察看，见五百秦卒，家眷皆自尽已亡唯留苻坚。姚苌愤怒欲引剑砍杀苻坚，坚却道:古语云帝王之躯乃上天所授岂能沾惹凡尘俗器。姚苌遂端来白绫，唤两力士左右受力缢其身亡，姚苌告知天下苻坚乃自缢而亡并赠其谥号壮烈天王。