这样一对相依为命的母子，按理说应当母慈子孝、关系融洽，但事实似乎并非如此。关于顺治皇帝和母后的关系，《清史稿？后妃传》仅有例行公事的四句话：“世祖即位，尊为皇太后。赠太后父寨桑和硕忠亲王，母贤妃。十三年二月太后万寿，上制诗三十首以献。上承太后训，撰《内则衍义》，并为序以进。”以上四句话总共60个字而已。而同一篇传记，记载康熙同他祖母关系的则有715个字。从中透露出顺治同他母亲的关系并不太协调。
1、立后之争
顺治小时候贪玩，母后管教过严，这是家庭中的常理。这一点不构成母子不和的原因。笔者认为导致顺治同母后关系不太协调的最关键因素是“情”：“立后”和“下嫁”。皇太后和顺治帝母子间在“立后”的问题上存在着矛盾和分歧。前者出于国家大统，后者重于个人感情。自太祖、太宗开国创业以来，就把与蒙古“姻盟”视为团结蒙古各部，增强国力的重要政治措施，收到了很好的效果。来自蒙古科尔沁的皇太后深有体会，因此她为顺治帝两次“立后”皆出于此种政治目的。第一次立蒙古科尔沁部卓礼克图亲王克善之女为后，这是母后和叔父多尔衮给指定的。小皇后出身蒙古科尔沁贵族，从小娇生惯养，顺治不喜欢。虽然勉强成了亲，但婚后经常发生口角。不久顺治帝认为志意不协，传旨废后。虽然皇太后不同意，但是看到儿子执意要废，也就不强求了。于是将皇后废为静妃，改住在侧宫。就这样，顺治不顾母后和大臣的反对，强行废掉了皇后。直到顺治病危的时候，被废的小皇后想要见他一面都没给任何机会。第二次立蒙古科尔沁部贝勒绰尔济之女为后，顺治帝仍不满意，又要废后，却遭到母后的反对，未能废成。可见再立一个皇后，顺治还是不喜欢。
再者，顺治喜欢董鄂妃，爱得死去活来。后来皇太后得知，顺治帝已有意中人，是内大臣鄂硕之女董鄂氏，她很理解儿子的个人感情，便把董鄂氏召入宫内立为贤妃。但顺治帝要立董鄂氏为后，所以再次提出废后。这次不仅母后反对，而且知书达理的董鄂妃也不同意，于是顺治只好作罢。董鄂氏隶属满洲正白旗。父亲鄂硕任内大臣，母亲却是江南的一位才女。董鄂氏兼有满汉女子的优点，既有满洲人性格的豪放、开朗、洒脱，又有汉家才女的蕴藉、温柔、多情善感。她外柔内刚，含而不露，有心胸、有见识，可谓是姿容绝代。顺治董鄂妃相遇也有一段故事。
顺治年幼即位，大权最初由叔叔多尔衮掌管。他自小形成暴躁、猜忌的性格。再加上娶了一个刻薄的妻子，事事过得不顺心。清初有命妇轮番入侍后妃的制度，这便给顺治帝与董鄂妃相识热恋提供了机会。董鄂妃经常到后宫来拜见皇太后。她天生丽质，又很朴素，看起来宛若仙子，引起了顺治的注意。董鄂氏之夫博穆博果尔经常从军出征，董鄂氏出入宫苑侍候后妃，与福临相识并坠入情网。孝庄皇太后察觉后也曾采取措施，宣布停止命妇入侍的旧例，以“严上下之体，杜绝嫌疑”。但这一切并不能阻止福临对董鄂氏的迷恋。为了获得更多接近董鄂氏的机会，顺治十二（1655年）年二月，福临封博穆博果尔为和硕襄亲王，以示优宠。后来博穆博果尔得悉其中内情，愤怒地训斥董鄂氏。这事被福临知道，他打了弟弟一耳光。博穆博果尔因此羞愤自杀。未及守孝一年，董鄂妃便被顺治皇帝接进宫里封为王妃。一个月后，晋为贵妃，地位仅次于皇后。
顺治对董鄂氏的感情，已到了无以复加的地步。他认为董鄂氏有德有才，正是理想的皇后人选，准备二次废后。顺治的皇后是蒙古科尔沁博尔济吉特氏亲王的女儿，蒙古科尔沁自满清入关以前就始终支持皇太极平定满洲，夺取天下的战争，是蒙古四十九旗中最强大而举足轻重的一支。假如顺治再度废后，改立董鄂氏，蒙古女人失去中宫主子之位，势必影响满蒙关系，动摇大清帝国的立国之基。所有这些，顺治不是不知道。可是当一个人感情狂热的时候，理智难免就要丧失。董鄂氏没有显赫的家庭背景，她的母亲还是一个汉族女子。顺治册封董鄂氏为皇贵妃已经引起很多人因祖宗有“满汉不通婚”的制度而不满。孝庄太后毫不犹豫地对儿子的举动进行了抑制。结果，母子间出现隔阂，顺治皇帝甚至公然下令除去太庙匾额上的蒙古文字。同时，那位生活在感情荒漠中的蒙古皇后，对于安排自己命运的同族婆婆并无丝毫感激，相反把不幸和怨恨，统统归集到太后身上，连太后病倒也不去问候一声。这种微妙紧张的母子婆媳关系维持了五六年。
入宫不久，董鄂妃生皇四子荣亲王。不久爱子病逝，董鄂妃十分伤心悲痛，身体每况愈下。顺治十七年（1660年）八月，董鄂妃病逝。顺治帝似乎失去了一切，他“寻死觅活”，不能自拔。年轻的顺治帝，本来就尚佛事，喜好参禅，取法名“行痴”。面对繁忙的国事，他却经常与僧人交往，把国家社稷置于脑后。董鄂妃死后他便企图净发为僧，步人空门。皇太后对此十分失望，坚决反对，出面阻止。顺治对董鄂氏去世非常哀伤，为此五天没有上朝。不久，顺治下旨礼部，称“奉圣母皇太后懿旨，皇贵妃佐理宫中事务多年，以其贤淑之德行教化宫闱，成绩斐然。如今突然去世，朕内心深为痛悼。现追封皇贵妃为皇后，以示褒奖推崇。朕仰承太后懿旨，特此追封，并加以下谥号：孝献庄和至德宣仁温惠端敬皇后。”顺治为董鄂氏亲撰行状，说她对皇太后“奉养甚至，左右趋走，皇太后安之”；“事朕，候兴居，视饮食服御，曲体，无不悉”；“至节俭，不用金玉，诵四书及易，已卒业；习书未久，即精”，等等。并命学士王熙、胡北龙编纂《董鄂皇后语录》，大学士金之俊撰《董鄂皇后传》。当时听说的人都感到惊讶和不解：仅仅是一个贵妃，死后三天就被追封为皇后，皇帝何必如此滥加谥号？
贵妃辞世，留给少年天子无尽的哀思。四个多月之后，福临就溘然离世，追随爱妃而去。有人说，顺治皇帝并没有死，而是出家了。这不符合事实。从现有材料来看，顺治还是死了。顺治帝患天花有历史记载，清廷还曾禁止民间炒豆。还有更加直接的证据：顺治病危时，翰林院清孝陵掌院学士王熙起草《遗诏》。《王熙自定年谱》记载了这件事情：正月初二日，顺治帝突然病倒，病情严重。第二天，召王熙到养心殿。初六日子夜，又召王熙到养心殿，说：“朕患痘，势将不起。汝可详听朕言，速撰诏书。”王熙退到乾清门下西围屏内，根据顺治的意思撰写《遗诏》，写完一条，立即呈送。一天一夜，三次进览，三蒙钦定。到初七日傍晚《遗诏》撰写与修改完毕。当夜，顺治就去世了。顺治临终前说：“祖制火浴，朕今留心禅理，须得秉炬法语……”顺治帝死后被火化，由溪森和尚主持。四月十七日，溪森和尚在景山寿王殿为顺治遗体秉炬火化。溪森死后，他的门人编辑他的语录《敕赐圆照溪森禅师语录》记载了这件事。所以，顺治帝确是死了，而不是出家了。
2、董鄂妃是谁？
董鄂妃是何许人？她有什么样的魅力令这位至高无上的年轻君主甘心为之生，为之死？
董鄂妃的来历有三说：
一说是《清史稿？后妃传》的记载：“孝献皇后栋鄂氏，内大臣鄂硕女，年十八入侍。上眷之特厚，宠冠后宫。”
二说是董鄂妃为秦淮名妓董小宛。董小宛原为江南名士冒辟疆之妾。传说，清军南下，董小宛被掳到北京，先留在王府，后被太后要了去。顺治看了喜欢，就从孝庄太后那里要到自己身边，用满洲姓董鄂氏。其实，只要用一些史料排比对照着看一看，就知道这个说法站不住脚。
民国初期，我国不少地方上演了《董小宛与冒辟疆》一剧，而根据冒辟疆《影梅庵忆语》记载，冒辟疆初识董小宛在崇德四年（1639年）。那一年董小宛已经有十六岁了，顺治帝才两岁。顺治娶董鄂妃时是十九岁，董鄂妃才十八岁。如果董鄂妃就是董小宛，那么此时她应当是三十三岁了，这样的年岁显然不合。同时，《影梅庵忆语》对董、冒二人从相识、完婚、蒙难到董小宛病死，都有比较详尽的记录。大致的情形是：
崇德四年（1639年），董小宛十六岁。冒辟疆初遇董小宛。
崇德六年（1641年），冒辟疆又巧遇陈圆圆，于是疏远了董小宛。
崇德七年（1642年），陈圆圆被周奎购到京师，冒辟疆重逢董小宛。
崇德八年（1643年），董小宛二十岁，入冒辟疆家为妾。
顺治二年（1645年），董小宛二十二岁。清豫亲王多铎领军渡江，破南京。冒辟疆在逃难中患病，“此百五十日，姬仅卷一破席，横陈榻旁。寒则拥抱，热则披拂，痛则抚摸，或欠身起伏，为之左右翼”。
顺治四年（1647年），董小宛二十四岁。冒辟疆再病，“勺水不入口者二十余日”。董小宛侍疾。
顺治八年（1651年），董小宛二十八岁，病死。当时不少文人墨客的悼念诗词均可证明董小宛确实是死在冒府。
董小宛比顺治大十四岁，同冒辟疆结婚九年未生育，并于顺治八年病死。冒辟疆写的《影梅底忆语》明白地写着董于顺治八年（1651年）去世。这时世祖才十四岁，不可能纳董小宛为贵妃。所以董小宛即董鄂氏之说实属望风捕影，不能成立。
三说是董鄂妃原为顺治的弟弟、襄亲王博穆博果尔的妻子。这种说法主要来自于《汤若望传》的记述：“顺治皇帝对于一位满籍军人之夫人，起了一种火热爱恋。当这一位军人因此申斥他的夫人时，他竟被对于他这申斥有所闻知的天子，亲手打了一个极怪异的耳刮。这位军人于是乃因怨愤致死，或许竟是自杀而死。皇帝遂即将这位军人底未亡人收入宫中，封为贵妃。”根据著名史学家陈垣先生的考证，她似乎就是顺治夺十一弟襄亲王博穆博果尔之妻。（本书采用此说）3、太后下嫁之谜
太后同多尔衮有着说不清道不明的关系，这也就是历史上有名的太后下嫁。这也导致母子之间的关系并不是太好。
太后下嫁多尔衮的疑云之起，是由于张煌言收录在《奇云草》中的两首七绝，题为《建夷宫词》：
上寿觞为合卺尊，慈宁宫里烂盈门；
春宫昨进新仪注，大礼恭逢太后婚。
掖庭犹说册阏氏，妙选孀闺作母仪；
椒寝梦回云雨散，错将虾子作龙儿。
建夷是指建州之夷，是明朝遗民对清王朝的蔑称。觞是盛酒的杯子。合卺指成婚。慈宁宫是孝庄住的地方。阏氏是汉代匈奴君主的正妻之称呼。诗的前七句没有什么好解释的，无非是诋毁丑化敌国君主。最后一句颇费解。细推之，原来指的是多尔衮无子，以弟多铎之子为嗣。满文称侍卫为“虾”。多铎当时的职位有“领侍卫内大臣”一职。看来虾子指的是多尔衮的义子多尔博。也就是说，顺治子随母嫁，自为“龙儿”，不必以多铎的“虾子”为子。以前我们常将这首诗作为无稽之谈，但从多方面的证据来分析，“太后下嫁”的确是事实。
论据一：保全皇位的政治婚姻
皇太极死时，庄妃才三十二岁，年仅六岁的儿子福临继位。一个是三十出头的寡妇，一个是只知玩耍的顽童。在当时，执掌朝中军政大权的实际上是睿亲王多尔衮。他手握重兵，成为朝中说一不二的人物，甚至连皇帝的大印“玉玺”也搬到睿王府内使用，以代理天下。小皇帝随时有被废掉的危险。人们认为，孝庄为了保住儿皇帝顺治的天子宝座，而委身于小叔子多尔衮。
论据二：弟娶其嫂的满族旧俗
从当时满族婚俗来看，嫂嫁小叔、兄纳弟妇之事常常发生，此事不足为怪，甚至还有不管辈份的婚俗（汉族礼教称之为“乱伦”）。站在这样的历史背景下来思量，盛年寡居的孝庄与壮年英武的小叔子多尔衮的结合，也就没有什么不好理解的了。如顺治皇帝的大哥、皇太极的长子、肃亲王豪格在清贵族政治斗争中死去后，他的两个妻子就分别被叔父辈的多尔衮、阿济格娶去。庄妃是蒙古人，十三岁时就与其姑母一道嫁给皇太极，因其美貌聪慧能干，受宠多年，生有三女一子，其子后来就被立为顺治皇帝。崇德八年（1643年）皇太极死时，庄妃只有三十二岁，虽被尊为太后，仍风华正茂，美丽异常。多尔衮大权在握，岂能放过这天赐良机。这时清王朝刚入关，满洲贵族从东北刚入主北京，受到汉族文化与纲常礼教的影响与束缚很小，还大量保留原在东北时的旧婚姻风俗，如清皇室与贵族中寡妇改嫁的事频频发生。因此孝庄太后与小叔多尔衮结婚的事就是比较正常的事了。我们切不可用汉族的传统纲常礼教去要求和看待清初的满洲皇族。
论据三：多尔衮的“皇父”称谓
持下嫁说的人特别强调，在顺治朝多尔衮公开以皇上的父亲自居，称号就叫“皇父摄政王”。而只有皇帝的母亲下嫁了，多尔衮才有可能被称为“皇父”。人们认为，多尔衮称谓变化的过程，恰恰反映了太后与多尔衮的婚姻由隐秘到公开的过程。《朝鲜李朝实录》中记载，“皇父”称号非但举国轰动，甚至已经“声闻海外”。《朝鲜仁祖李倧实录》载：二十七年己丑（即清世祖顺治六年），二月壬寅，上曰：“清国咨文中，有‘皇父’摄政王之语，此何举措？”金曰：“臣问于来使，则答曰：今则去叔字，朝贺之事，与皇帝一体云。”上曰：“然则二帝矣。”朝鲜邦外属国，国王都发现此举与“二帝”无异。大清朝难道就真的荒唐到这种程度不成？当然不是。其时清廷正推崇儒教，广纳天下饱学之士，断不会做这种令世界当做笑柄的糊涂事，但“皇父”一词确已明诏天下，一朝二帝，已经是无可争议的事实。
论据四：皇帝谕旨露出破绽
顺治十七年（1660）十二月二十四日，因乳母李氏病故，顺治降谕礼部，其中有这样几句话：“睿王摄政时，皇太后与朕分宫而居，每经累月方得一见，以致皇太后萦怀弥切。乳母竭尽心力，多方保护诱掖，皇太后眷念慈衷赖以宽慰。”这无意间透露，幼年皇帝顺治与母亲孝庄分宫而居，而且皇太后不是居于皇宫之中，否则母子之间为何“每经累月方得一见？”皇太后萦怀弥切，为何却不去看望皇上？皇上又为何不去探望生母，以解“皇太后眷念慈衷”？度之事理，其间必有一个超越两者之上的力量破坏了母子之情。这个力量，除了多尔衮之外，还能有谁？另外，徐柯《清稗类钞》中对“太后下嫁摄政王”有较为详细公允的记载。
论据五：风水墙的诉说
按清朝早期丧葬制度，皇后、妃嫔最终都要与皇帝合葬。可是，孝庄竟葬在了遵化的清东陵风水墙外，而未与清太宗皇太极合葬于沈阳的昭陵。这种悖乎常礼的葬法多年以来一直引起人们的种种议论，其中可能有难言之隐。有人认为，这是孝庄因改嫁而无脸到阴间见皇太极的刻意安排。史料中也确有这样的记载。太后在遗嘱中说，“卑不动尊”，不忍再惊扰皇太极，这实在是托词。对祖母孝庄的心思，康熙自然心知肚明。但康熙又感到，将祖母单独安葬实在没有这样的先例，是件很棘手的事。于是他把这一难题留给了儿子雍正，将孝庄的棺材在东陵的地面上一直停放了三十八年之久，直到雍正三年（1725年）才为孝庄建陵安葬。还需说明的是，长眠在清东陵的五个皇帝、十四个皇后、一百三十六个妃嫔，都葬在了风水墙之内，而只有孝庄葬在风水墙外。这又是为什么？孝庄皇太后于康熙二十六年（1687年）去世，享年七十五岁。
论据六：有人见过“太后下嫁诏”
关于孝庄太后下嫁多尔衮之事，虽由于后来清皇室受汉族影响日深、纲常礼教观念加强，因而不让将此事记载到正史中，甚至原有的记载也被删改，使我们今天很难查到有关此事的正式记载，但我们仍可以从众多史料中看到有关此事的明显痕迹。如清故宫藏顺治朝的“批红”题本及《东华录》上，就记载顺治五年（1648年）多尔衮由“皇叔父摄政王”改称“皇父摄政王”，并“亲到皇宫内院”，“自称皇父”。若无太后下嫁之事发生，此事是顺治皇帝所万万不能接受的。太后下嫁之事传播甚广，前面已经提到当时人的记事诗，虽极尽嘲讽挖苦，但也是这件史事的一个有力旁证。1946年10月，近代学者刘文兴撰文《清初皇父摄政王多尔衮起居注跋》，其中写道，宣统元年（1909年），他的父亲刘启瑞任内阁侍读学士，奉命收拾内阁大库档案，“得顺治时太后下嫁皇父摄政王诏”。世上若果真有这一诏书，无疑是太后下嫁最具权威的铁证。