然而，这似乎并不是问题的实质所在。在人类历史上，有许多哲学家和科学家有着像霍金同样的对待上帝的态度，但是他们的身体状况却同正常人一样。当然，也有许多有着强烈的基督教信仰的科学家，他们对待上帝的态度十分虔诚，其中有一些人认为，霍金对宗教一无所知，所以他没有资格对宗教发表意见。然而，霍金所从事的研究领域正好是与宗教领域相对立的，他不可能调和两者之间的关系。他的研究要搞明白宇宙的起源租早期阶段，因而他必须以科学的态度对待他的研究。正如他所说的那样，在研究宇宙起源问题上躲避不开上帝的概念。我的研究是处在科学和宗教的边缘上，但我经常是站在科学一边的。我觉得上帝的行为方式是很难用科学的定律来描述的。
然而，当别人问霍金关于如何看待宗教和科学之间的冲突时，他从他的个人信仰出发，认为两者没有什么冲突。他说，如果认为宗教和科学是相互抵触的，那么如何解释牛顿这样的基督教的信仰者能够发现万有引力定律呢?
霍金认为，科学所回答的是“怎么样”的问题，但却不能回答“为什么”的问题，这个问题的回答还需要依靠宗教信仰。尽管霍金并不否认上帝的存在，也不否认宗教的作用，但珍妮却认为她的丈夫如果从他的宇宙观出发，大有排除上帝的可能。这将是影响她与霍金关系的一个大问题。随着霍金的声望和影响逐渐增大，这个问题也就越来越严重。她觉得霍金正在通过他的研究工作讨伐宗教信仰，或者他正在试图证明宗教信仰是错误的，他在宇宙学的研究中那种纯数学推理践踏了任何对上帝的信仰。
珍妮没有受过科学上的严格训练，她无法与她的丈夫一起探讨宇宙学方面的问题。霍金只有和他从事同一专业的同事、朋友和学生在一起时，才会滔滔不绝地讲起专业方面的问题。珍妮也感觉到了这一点，她说：“我最遗憾的事情中，有一件就是我不是一个数学家，斯蒂芬只有以非常形象化的语言和以极为通俗的方式，把他的专业问题解释给我听，我才能理解他的工作。”
在霍金夫妇以前的生活中，他们之间的宗教信仰冲突并没有成为一个问题，但当珍妮发现霍金正在探讨的问题危及到她的科学信仰时，她便发生了警觉。特别是霍金所搞的“宇宙无边界”模型，认为宇宙是可以自我包容的，这是珍妮最不能忍受的。当别人问及宇宙是如何达到这一状态时，霍金的回答是根本不需要解释，因为“宇宙本来如此”。霍金的“宇宙无边界”模型实际上是在表明科学的定律无处不在。显然，霍金如果坚持这一点，宗教的存在就成问题了。珍妮对这一点是比较敏感的。
霍金的一位亲密朋友和合作者唐·佩奇，是一个有着强烈宗教信仰的基督教徒，同时又是一个科学家。他能够把科学和宗教比较好地结合起来，这使他能同时兼任两种角色，即既是一个福音传教士，又是一个宇宙学家。他是这样来说明“宇宙无边界”模型的：“从犹太教一基督教的观点出发，与其说上帝是宇宙的本原，还不如说是上帝创造和支撑着整个世界。实际上，宇宙有无起始的问题和宇宙是否被创造的问题是两个不相同的问题。正像一位画家画的一个圆是否有起点和终点与这个圆是否是被画出来的一样，这是两个不同的问题。”
当唐·佩奇住进霍金家后不久，他曾设法吸引霍金参加关于宗教方面的讨论，但都没有达到目的。虽然佩奇和霍金在关于宗教的观念上有不同的理解，但并没有妨碍两人的友情，双方约定对于任何形式的属于个人信仰的上帝都不加以讨论。
从霍金的宗教观上来看，他并没有完全否定上帝的存在，而是限制了人们对上帝的依赖性。他认为，上帝在构建宇宙方面究竟起了多大的作用还需要进一步思考。如果“宇宙无边界”模型是正确的，那末上帝在宇宙的始初状态是没有一点自由的。当然上帝可以选择宇宙所遵循的规律。因此，人们可以同时研究宇宙的规律和探讨上帝的本质。
毫无疑问，霍金对传统宗教产生了怀疑，这也与他中学时代与同学们一起探讨超感知觉实验给他的经验教训有关。他不想再在探讨任何形式的神秘主义和玄学上浪费时间。有不少人试图在神秘主义与20世纪后期的物理学之间架起一座桥梁，其中有的人认为东方的宗教和量子力学之间、古代宗教教义与混沌理论之间有着类似之处，霍金对这种做法很不以为然。他说：“人们对东方神秘主义着迷，只不过过去人们没有听说过它们，感到新奇而已，但作为一种对现实的真实的描述，它是毫无价值的。如果你纵观一下东方神秘主义，你就会发现有些东西似乎是现代物理学或宇宙学的暗示，而实际上则是毫无意义的。”
从20世纪70年代之后，霍金外出的机会每年都在增长。1976年冬，他到美国去旅行，在芝加哥和波士顿的重要会议上作了演讲。霍金演讲的主题以及说话的声音都令那些来自全世界的科学家、普通大众和记者感到非常的难以理解。尽管如此，霍金的演讲还是那样充满了魅力，吸引着众多的听众。
尽管在演讲之前会议的主持者已经被告知关于霍金的残疾状况，特别是告诉他们霍金上讲台是非常不容易的，但霍金还是经常碰到没有坡道的讲台或没有提升器的讲台。一遇到这种情况，就得依靠霍金的朋友和同事的帮助，6个人一起用力把那沉重的轮椅抬到讲台上。虽然霍金的体重大约只有90多磅，但他的那个电动轮椅车却非常重，因为它装着发动机和电池等，比一般的轮椅要重不少。那些搬动霍金及他的电动轮椅车的人每次都是小心翼翼的，生怕把这位大科学家摔下来或扭伤了他的脖子。有一次，霍金到一个地方讲演，那里讲台既没有坡道，也没有提升器，6个高大强壮的科学家把轮椅抬到5英尺高的讲台上时，人们看到霍金的头在不停地摇晃，使抬他的人和听众都感到十分担忧。
霍金1976年的美国之行给那里的人们留下了深刻的印象。他骨瘦如柴，弓着身子坐在轮椅中，对着听众说着让人极为难懂的话。尽管如此，听众还是非常认真地听着，试图通过霍金那及其难懂的话来理解他的关于宇宙的深刻见解。当然，也有一些与霍金十分熟悉的科学家，他们能够听懂霍金的讲演，能够理解他的关于宇宙的高深见解，他们尽量地把霍金的讲演内容翻译给他们邻座。霍金也想了一些办法，力求使他的讲演能让听众更多地接受。他使用幻灯片来图解他的观点，还用大量的笑话来调剂他那抽象的宇宙学内容。
那时，霍金早先关于黑洞和热力学的观念已经完全改变，他在波士顿所作的一个题为“黑洞是自热的”讲演中，对爱因斯坦的一个著名命题“上帝不投骰子”提出反驳，引起了较大的轰动。他宣称，上帝不仅投骰子，有时还把骰子投到了谁也找不到它的地方。
霍金成了记者追踪的热门人物，许多记者排着队等着采访他。1977年1月，英国广播公司制作了一个题为“揭开宇宙之迷的钥匙”的节目，这个节目主要是围绕着霍金近期的工作，通俗地介绍了他的传略以及他在宇宙学方面的杰出贡献。这位35岁的皇家学会会员，受到了大众的青睐，在英国观看这个节目的人达到了百万以上。
从1977年以后，霍金的知名度越来越大，从剑桥扩大到英国全国，从英国又扩大到全世界。在英国，当人们对将要来到的女王结婚50周年大庆盛典激动不已时，另一件事情也在大众中传播着，一位严重残疾的皇家学会会员在电视中出现，他的大幅照片被刊登在报纸的引人注目的地方。更让人们诧异的是他还不是一个教授。
对于霍金还不是一个教授的较为温和的解释是：剑桥大学考虑到霍金是一个有着严重残疾的科学家，怕他活不久，所以没有给他教授的职位。当然，校方也感到社会上的压力，1977年3月，校方终于给了霍金一个引力物理学教授的职位，这个职位实际上是专为霍金设立的，只要他在剑桥大学～天，这个职位就非他莫属。同样是在这一年，凯斯学院特别授予他教授级研究员的职位。
霍金在牛津大学读书时的指导老师罗伯特·伯曼还推荐霍金担任牛津大学的荣誉研究员的职位，他在推荐信中写道：“我简直想不出我们的学院还曾培养出比霍金更为优秀的科学家，也许请求考虑一个不到35岁的人担任研究员会使人感到吃惊，但他的杰出才华应该把他作为一个例外来对待。我们不必一定要等到他闻名于世的时候再考虑他。”伯曼的理由足以说服评委，在委员会会议上他的推荐得到了全票赞成，霍金就这样成了他16年前读大学时的母校牛津大学的荣誉研究员。