按理说巴林顿到此可以作罢了，但揭秘之心驱使他想做进一步的考察。他偷偷躲在墙角对莫扎特进行观察。当被利奥波德发现之后，他就干脆对莫扎特进行起严格的音乐测验。巴林顿问莫扎特什么叫弥撒曲，什么是小夜曲、小步舞曲、交响曲和奏鸣曲。当问到前面几个问题时，莫扎特还漫不经心地随口应答几句，当问到后面的问题时，莫扎特只笑了笑说，你去看看我前几天给王后的献礼吧，那也许是最好的回答。巴林顿看看没能难倒莫扎特，就要莫扎特弹几首巴林顿临时拼凑起来的所谓的乐曲。莫扎特坐在钢琴前弹奏起来。但过了片刻，巴林顿说还是弹这首曲子，但要改成用愤怒的感情来表现。莫扎特不费吹灰之力就办到了。这时有一只小花猫从门外窜到了钢琴边，莫扎特立刻离开了钢琴，去与猫玩耍了。小花猫逃出门外，莫扎待也追到了门外，好半天也叫不回来。直到这时，巴林顿才感到，这孩子毕竟是个孩子，他的真实年龄也许被他非凡的天才掩盖了。事后，巴林顿在《皇家学会哲学年刊》上发表了长长的一篇文章，汇报了这次调查的前前后后的经过及结论。
在伦敦待久了，利奥波德发现伦敦对孩子来说是个很危险的地方，因为这儿的人大多数不信教，宗教问题上更是没法说。而且这里的男男女女接触太随便，有些事情就好像上街吃一餐点心一样，所以街头总充斥着缺胳膊少腿的贵族们的私生子，这些人就变成了新的乞丐。孩子到街上看到的都是这些坏榜样。
其实，莫扎特到街上倒并不去注意这些“坏榜样”，他更关心的倒是街上那种“像椅子似的会移动的东西”。原来那就是英式的轿子。自从见了轿子后，莫扎特总对父亲叫腿酸，走不动了，要坐轿子。父亲没法，只能让孩子坐轿子。但如果自己也陪着坐，那花费就太大了，所以他自称：在轿子里面腿伸不直，我还是希望能走走。于是，孩子们在轿上，利奥波德在后面跟着。然而他走路的速度绝对不能与轿夫相比，于是他慢慢地被抛下了，他拼命想赶上去，出了一身大汗，又着了凉，回到旅馆就感冒病倒了。在伦敦市里花费太大，空气也不很好，于是利奥波德就把全家迁到伦敦乡下的杰尔西小镇住下了。
在离开伦敦之前，利奥波德把莫扎特创作的一首圣歌《上帝是我们的庇护者》赠给了大英博物馆，并收到了大英博物馆的一封正式公函：
先生：
奉大英博物馆常任理事会之命，我谨通知您：您在最近为您聪颖的儿子举行的音乐演出后赠送的礼物已经收讫，并为此代表他们向您致以谢意。
大英博物馆
秘书 M·玛丽1765年7月19日
大英博物馆的这封信给了利奥波德很大的兴奋，因为这无疑又是一种骄傲的资本。更可观的是，随着这封信还带来了一小笔钱币，这使利奥波德喜出望外。
到伦敦乡下养病，还有一个理由，那就是利奥波德感到他在家乡大主教那里的地位日益不稳，他不甘心回家去过那种默默无闻的生活。他必须找出些理由以便推迟回家。于是，他又答应了海牙奥兰治亲王的妹妹冯·魏尔贝格公主的邀请，准备养好病就去海牙。
在伦敦乡下的时候，莫扎特和姐姐只是偶尔地做些演出，莫扎特姐弟则更潜心研究乐器的演奏技巧。聪明的莫扎特这时还发明了一种新的钢琴曲。本来莫扎特姐弟合奏时通常是用两台钢琴的，有时则是用有两层键盘的乐器，但莫扎特却写了只用一层键盘，但却是两个人同时演奏的乐谱，他们还兴奋地让病中的父亲听了他们的演奏。父亲听完后说两个孩子的发明实在让人惊讶。
利奥波德原来想在外面多拖些时日，以便晚些回到大主教那儿，可这一拖却拖出了大祸。也许是过分劳累后突然的休息，使身体一下子不能适应，两个孩子反而都得了重病。
先是南内尔发高烧，奇怪的是，她发高烧讲呓语用的是德文、英文、法文交杂的，这也许是这一年多的时间里，他们经常在用这几种文字，而且头脑是高度紧张的。医生认为是急性肺炎，姐姐稍好一些的时候，提出要听弟弟弹新创作的乐曲。但是没过几天，莫扎特也病倒了，主管内务的妈妈就不停地给莫扎特喂汤喝。莫扎特这已经是第二次得重病了，但他的父母却仍未从根本上去找些原因。刚刚懂事的孩子就被拖着在最艰苦的旅途中摸爬滚打。旅途无法保证最起码的卫生条件，而父母不注意最起码的卫生知识，又不懂得营养和锻炼，饱的时候山珍海味把肚子撑破了，饿的时候把胃的两壁都粘住了，所以莫扎特这时给人的印象是身体纤细，四肢羸弱，而脑袋却异常的大。
父亲非但没有认识到长此以往的危害性，反而要他们不管生病休息都要拼命地练习、演出，这可以从他给家乡房东的一段话中看出：“我失去的每一分钟都是一去不复返的。如果说我以前就知道时间对于青春来说是多么重要，那么我现在就更清楚了。你知道，我的孩子已经习惯于工作。如果他们学会借故不干，……我的整座大厦就会全部倒塌。习惯成自然嘛！”
“习惯成自然”成了利奥波德不肯给孩子松绑的借口。而不懂世事的两个孩子也真的是那样去做的。莫扎特在高烧中昏迷了8天，他那脆弱的身体在一点小火的支持下在死亡线上挣扎着。在他还在病中的时候，他还像父亲所说的那样拼命地干，他曾要了一枝笔和五线谱，几次软绵绵地躺倒在床上，但还是写下了几首奏鸣曲，还要父母把他抱到钢琴前，让他能摸一摸钢琴，弹一弹钢琴，只有钢琴那清脆的和声，才能唤起他生命中的活力……
在此期间，父亲还虔诚地写信到萨尔斯堡家乡，要三座教堂为两个孩子的生命做了6次弥撒。不知道是钢琴唤起了莫扎特生命中的活力，还是那6次弥撒确有回天之力，莫扎特居然能像小孩子学步一样，在父母的搀扶下，慢慢地下地行走了。
一场大病对莫扎特来说是一大灾难，但也出现了一个奇迹，也许病中的孩子这时有机会思考一些平时无暇思考的问题，总结一下平时无暇总结的经验，这使莫扎特在各方面的音乐知识都有了个突飞。这时的父亲曾与人说道：“我已经再也没有什么可以教给那个孩子了，他已经完全超越了我。以后，这个孩子必须接受这个时候各个大师的教诲与磨炼，而我的责任只是帮助他抓住学习机会、积累更多的知识。”
他们在英国逗留了一年多以后准备返回家乡了。看着一大堆行李包裹，南内尔对父亲说：“爸爸，我们这不成了吉卜赛人了吗？整天过着流浪生活，而所有的家产又都在我们的行李中。”这一说似乎说到了父亲的点子上，他嘿嘿地笑了起来。
在经过荷兰的时候，那品种繁多的郁金香使莫扎特姐弟大开了眼界。莫扎特看到了红黄白紫及洒金镶边条纹等多种花色的郁金香，还知道郁金香有杯形、碗形、卵形、百合花形、喇叭形、鹦鹉形等多种花形。
1766年11月15日，莫扎特一家踏进了慕尼黑市区。选帝侯想知道相隔三年后的莫扎特到底又变成怎样的孩子了，所以致函相邀。莫扎特一家在选帝侯家进餐时，选帝侯故意很随便地哼了几小节旋律，而且他知道这时的莫扎特正在与新朋友聊天呢，选帝侯然后对莫扎特说：“你能马上用我刚才哼的旋律谱成一曲吗？”“那就让我试试吧，尊敬的殿下。”莫扎特随即用侍从拿来的纸笔在一边谱写起乐曲来，只转眼工夫，莫扎特已经把乐曲写成。
选帝侯接过乐谱，仔细地看了看，然后对利奥波德说：“你以这个孩子为傲是完全理所应当的！”然后，选帝侯要侍从把他所钟爱的一些陶艺品拿出来，对莫扎特说：“这些陶艺品是东方的友人送给我的，我很喜欢，今天我很高兴，请你挑一个留作纪念吧。”从这以后，利奥波德珍藏的值得骄傲的赏赐中就又多了一份东方的瑰宝。