战斗开始了，攻击的英军士兵冒着炮火清除了河道内的各种障碍，然后用战船撞击横栏在水面的铁链，接着便向炮台实施炮击。
炮台上的守军进行了奋勇还击。
由于守军们训练刻苦，对地形地物熟悉，侵略者的舰船刚一出现，就能以极快的速度精确地计算出来，所以，在双方的炮战中，守军不但没被敌人的炮火压住，反而渐渐占了上风，这情形是侵略军原本没有料到的。炮战持续到下午时，敌人有些支持不住了，便改变战术，打起了白旗，装着撤退的样子绕至被击伤的舰船背后，又一次向炮台守军猛烈轰击。陆战队也分乘几十艘舢板船向南炮台强行登陆，战斗一下子进入白热化。
此时已是下午五时左右，正是潮水下落时。陆战队的小舢板正在向海边划动时被滞留在泥滩上。这是有着600多名的陆战队，现在，它们一下子像屎壳螂一样笨拙地爬动着，泥滩又深又软，因是连接海口的河道，非海岸沙滩可比，使侵略者顿时变得寸步难行。
即使是很蹩脚的射手也会百发百中的。可怜的陆战队员们在武器很差的清军士兵的射击下，一个个命归黄泉。
少数幸免的英军士兵倒伏在芦苇丛里再也不敢起来。这些芦苇后来也没帮他们什么忙，因为目标一个个被击杀，这些芦苇后来就当做靶子，直打得芦華丛里的敌人哭爹叫娘。
一些攻上岸的英军士兵也被清军的炮火和枪弹的攒射压了回去，他们在滩头顽抗着，等待着援兵和潮水的到来。
次日凌晨，潮水终于涨了起来，滞留在泥滩上的英军开始撤退了。
英军遭到了惨败！
此次战斗，英军有470余人死伤，2人被俘，11艘兵舰被击沉击伤，3只舢板船被缴获，另外还缴获一批武器弹药。英军海军司令赫伯被打伤，灰溜溜地弃船而去……中国守军大获全胜。
卜鲁斯嚣张的气焰受到了挫败，他再也不提进京换约的要求了，夹着尾巴和法国大使布尔布隆离开了天津，逃回了上海。
大沽口战败的消息传到伦敦后，引起全英一片哗然。但仍有一些巴麦尊的拥护者借机鼓噪，叫嚷要对中国实行报复。这种复仇的气焰越来越盛，在新闻传媒的推波助澜下，大不列颠如一头斗红了眼的公牛，倾注全力向中国扑来。
1859年9月，英国内阁连续召开四次会议商讨对策，最后决定：中国政府必须应允派员驻京的条款。如果通过外交手段不果，就继续使用武力。1860年3月起，英法政府开始大批增兵，到1860年6月，英法联军集中军舰多达157艘，英军载炮361门，官兵10500名，法军6300名，另有新的雇佣军不计。
英国在远东的官员大都认为，挟这次大兵压境的虎威，应该实现占领九龙半岛的夙愿。但是，对于如何占领九龙，采取什么样的方式，英国人内部的意见并不一致。1860年2月11日，一个叫斯托宾齐的英国官员说，在中国南方不宜采取大规模的军事行动。倘若对九龙实施直接的武装占领，有可能导致中方对香港或广州的英商采取报复行动。在这样的情势下，实行租借可能是有益的……但是，驻华公使卜鲁斯却极力赞成对九龙实行军事占领。他说，女王陛下政府表示渴望割占九龙半岛的一部分。为了保障港口安全，并在大陆沿岸聚居的居民中间维持秩序，需要占领这块地方。现在，中国政府迫使我们派来更多的部队，而在香港又不能妥善地安置它们，所以我们要寻找安置地，这块地方我们已经寻找到了，它就是九龙半岛地区。
占领九龙半岛的计划因意见不一而延缓下来，直到克灵顿中将率领新增大军来到香港后才又一次摆到议事日程。
克灵顿中将对卜鲁斯的意见很赞同，他的军队没多久就在尖沙嘴登陆。
于此同时，香港总督巴夏礼也假模假式地照会两广总督劳崇光说，这是因为大批英军将要到达中国的缘故，香港没有妥善安置这批军队的场地，因此不得不暂时占领九龙半岛之一部分作为宿营地。英军在这片荒岛上要大力恢复秩序，镇压无法无天的刁民。这真是典型的强盗逻辑，本来是为报大沽口战败的一箭之仇才来大批英军，还得让清朝官员配合，给它们辟让一块地方安置军队，还美其名日镇压无法无天的刁民，在荒岛上还要大力恢复秩序，真是鬼话连篇。但两广总督劳崇光却对英人的强盗理论不置一词，任其所为。
1860年3月18日，在新任侵华陆军司令克灵顿的指挥下，英军第四十四团特遣队强行侵占了九龙半岛岬角一一尖沙嘴一带。紧接着，几乎每天都有新的援兵赶来，一艘艘舰船满载着英法士兵相继驶入九龙本来平静的港湾。这些军队在九龙岛上进行着北上作战的准备，包括训练新招募的锡克族骑兵，对新研制出来的一种火炮一一阿姆斯特朗炮进行精度和威力方面的试验等等。九龙半岛成了英军的大本营。
中国方面似乎对英人侵占九龙的行为没有什么大的反响，除了那些世代居住在该岛的民众呼天喊地表示抗议之外，广州方面平静如初。倒是英囯人自己觉得不好意思，强盗们对中国这个礼仪之邦如此宽厚的礼让有些自惭形秽，他们就租借九龙半岛问题进行了一系列磋商。
3月中旬，巴夏礼、克灵顿、罗便臣等经过多次磋商后将侵占九龙半岛的一系列理由写进照会，送交给两广总督劳崇光。