“加贺”号这艘巨舰在几分钟内就被彻底摧毁了。舰上油烟滚滚，船身被烈火烤得发黑，船舱里不断发生爆炸，整个“加贺”号被笼罩在一片火海之中。
“加贺”号航空母舰的命运，把在“赤城”号上目睹这一切的草鹿少将惊得呆若木鸡。他没有注意到俯冲轰炸机也在向他这艘母舰扑来。
★“赤城”号航空母舰的毁灭
突然，一道明亮夺目的爆炸闪光，照得“赤城”号航空母舰舰桥上的日本军官眼花缭乱。一支往上高窜的火柱将他们掀翻在地。几乎同时，舰上火焰乱窜，浓烟四起。
俯冲轰炸机投下一枚接一枚炸弹，穿透“赤城”的飞行甲板，在舰体深处爆炸。舰上飞机及其炸弹和鱼雷，接二连三地连锁爆炸。灭火人员东奔西跑，穷于应付。大火蔓延到胡乱堆放在甲板上的燃料和弹药，再度引起大爆炸，把飞行甲板大块大块炸飞到空中。舰桥像在暴风雨中的树梢那样猛烈摇晃。
几秒钟内，炽烈的大火从舱内腾起，四下蔓延，吞没了飞行甲板上的飞机。船尾的舵机也失灵了。这艘几分钟前还威风凛凛的大型航空母舰，如今在大海上绝望地颠簸摇晃，把燃烧着的飞机从甲板上抛进沸腾的大海。
面对这突如其来的灭顶之灾，舰桥上的南云中将呆若木鸡。火舌已经舔着舰桥上的玻璃窗。草鹿朝南云喊道：“咱们得撤离啦！”但是南云拒绝离开。
成千加仑燃烧着的汽油流向下层甲板，放在机库内的鱼雷也开始爆炸了。一团团火球从舰身两侧喷射出来。南云仍然不肯离开舰桥。
“赤城”号航空母舰舰长青木大二郎大佐朝南云喊道：“这艘舰由我负责，你和你的人员留在这里毫无用处，请转移到另一艘舰上去吧！”草鹿也劝南云说：他是整个突击舰队的司令，而不是某一艘舰的舰长。
当南云被说服同意离开时，整个舰桥几乎都被大火围住了。“把玻璃打碎！”草鹿喊道。打碎玻璃后，他们垂下两条绳子，草鹿先把南云推出来，这位身材矮小的将军滑了下去，落到比舰桥低14米的飞行甲板上，草鹿跟在后面。
短短的6分钟内，“赤城”号被彻底炸毁了。
南云带着指挥机构离开后，青木舰长指挥“赤城”号的舰员继续努力控制火势。但他们的努力无异于杯水车薪。由于发电机停止工作，舰上不仅失去了照明，而且连灭火用的水泵也失去了作用。机库的防火门已被烧毁，化学灭火机全部不能用了。而且甲板不断发生着爆炸，每次爆炸都炸穿甲板，伤害到许多人。
烈火继续蔓延，火势越来越猛，热气通过进气孔，窜进军舰最底下的部分，在那里工作的人员开始因窒息而昏倒。为了使部下得救，机电长穿过燃烧中的甲板，跑到上面向舰长报告了机舱情况。舰长立即下令全体机电人员马上到甲板上来。但是，已经太晚了，带着这道命令试图穿过火海下去的传令兵一去不返，机舱人员没有一个人幸免。
伤亡不断增加，大火越来越无法控制了。18点，青木舰长决定弃舰。伤员开始转移到小船和汽艇上，许多没有负伤的人跳到海里，游泳离开“赤城”号。
青木舰长于19点20分从一艘驱逐舰上发电报给南云，请求批准将被毁的航空母舰炸沉。联合舰队的旗舰截收到了这份电报。22时25分，山本海军上将发出暂缓处置那艘航空母舰的命令。
青木舰长接到这一命令后，独自返回“赤城”号。他回到还没有被大火波及的抛锚甲板，把自己绑在铁锚上，等待着死亡。
6月5日3时50分，南云收到山本关于击沉“赤城”号的命令后，随即将命令转达给第4驱逐舰队队长有贺海军上校。有贺命令他的4艘驱逐舰准备向“赤城”号发射鱼雷。
拂晓前，海上大雾茫茫。“赤城”号上的大火似乎已自行熄灭了。大雾中，“赤城”号隐约可见，就像日本画家笔下的一幅水墨画。
此时，有贺派出几个代表乘小艇去劝说青木不要自尽。“赤城”号领航主任三浦海军中校告诉青木：航空母舰将由日本自己的鱼雷来击沉，而不是被敌人鱼雷击沉，所以它的舰长无需与它一起沉没。但青木不听劝告。最后，有贺海军上校亲自上舰，命令青木离舰，青木这才服从了。
5时整，3艘驱逐舰围上去，向“赤城”号发射了3枚鱼雷。右舷一侧发生爆炸，“赤城”号的舰艏开始下沉。20分钟后，这艘航空母舰晃动着它那庞大的身躯，缓缓下沉，最后被海水淹没。
“赤城”号消失了，海面上翻起巨大的泡沫。在这艘航空母舰的最后一次战斗中，舰上人员共死亡263人。
麦克拉斯基的机群对“赤城”号和“加贺”号航空母舰的攻击几乎是同时进行的。但“加贺”号可没有像旗舰“赤城”号那样挺得那么久。
正在“加贺”号的舰员们努力控制舰上的火势时，一位不速之客悄悄地出现在“加贺”号身边。这位不速之客便是美军的潜艇“舡鱼”号。
在离“加贺”号航空母舰几海里之外的蓝色海面上，“舡鱼”号潜艇的潜望镜留下了一道白色浪迹。布罗克曼海军中校跟踪潜望镜中的这艘航空母舰已近3个小时。在布罗克曼面前有3个可供选择的攻击目标，分别是受损的航空母舰和它的两艘护航军舰。那两艘护航军舰在航空母舰前方约两海里处。
布罗克曼经过一番思考，决定首先对付那个大家伙。布罗克曼谨慎地以潜望镜深度接敌，向航空母舰靠舰桥的右舷方向迂回，以寻机攻击。
14时10分，布罗克曼进至距航空母舰3100米处。他从潜望镜中清楚地看到舰上燃烧的大火和忙乱的人员。已经进入最佳发射阵位了。随着布罗克曼一声令下，第一枚鱼雷驰出了发射管。几秒钟后，第二、第三枚鱼雷先后发射。
但实际上，只有一枚鱼雷径直朝“加贺”号疾射过去，另外两枚鱼雷都脱靶了。
此时，这条鱼雷疾驶中带着白色的浪迹直奔“加贺”号而去，此枚鱼雷虽然击中了“加贺”号舰体，但却没有爆炸。鱼雷的雷体断成了两截，它的弹头沉下水，后半截却像块巨大的软木浮出水面。
“舡鱼”号发射完3枚鱼雷后，立即被护卫“加贺”号的日本驱逐舰“风”号抓住。舰长岩上次一海军中校熟练自如地指挥着自己的驱逐舰，用深水炸弹对“舡鱼”号实施攻击。
“舡鱼”号左逃右躲，全力进行规避。“风”号则紧紧咬住“舡鱼”号，连续不断地实施深水炸弹攻击。虽然深水炸弹没有直接命中“舡鱼”号，但有几颗炸弹在距离潜艇很近的位置爆炸，使潜艇里发生了几处小渗漏。
为了逃过水面舰的搜索，布罗克曼决定冒险，下令潜艇停止潜伏。刚刚潜停下来，艇员们就听见潜艇的上方发出奇怪的响声，仿佛有人在艇身上拖一根链条似的。接着，甲板上传来两次重物撞击的响声。声纳操纵手报告说：指示器上到处显示有螺旋桨的响声。原来这时正是“风”号从它上方驶过。
经过一番较量，“舡鱼”号终于逃脱了“风”号的攻击。在“风”号追逐“舡鱼”号的同时，“加贺”号上天谷海军中校带领消防人员正在与不断蔓延的烈火继续搏斗着。但是，他们的努力越来越无济于事了。
易燃的油漆把大火带到全舰各部位，诱发了弹药库以及机库里散乱放置的炸弹、鱼雷的连锁大爆炸。剧烈的爆炸所产生的气浪，把人、物件，甚至舰上的钢板，都像干柴一样掀进大海。
“加贺”号病员舱里，一位年轻少尉带着几名卫生兵在奋战。大火阻断了他们同舰上其他部位的联系。少尉命令一个卫生兵寻找通道，想办法把伤员转移到安全的地方。卫生兵找了一通之后，向少尉汇报说，所有通道都被阻断。少尉说了声：“谢谢，你费心了。”随即无可奈何地把眼睛闭了起来。他准备以身效忠天皇。
此时，一位老资格的士官跑过来，对少尉说：“我们不能束手待毙，可以从舷窗出去。”
士官的话提醒了少尉，他立即让卫生兵把伤员从舷窗往外推。此时，天花板已经着火，他们冒着烈火将伤员从舷窗推出，直到所有的伤员都脱险后他们才逃出。
舰上的大火越烧越大，时间越来越紧迫，到了天谷孝久海军中校决定是否弃舰的时候了。可这是个非常困难的决定。天谷是一个飞行员出身的军官，对舰艇懂得不多。特别是对于这艘大型航空母舰的复杂操作技术一窍不通，更何况这又是一艘受了重创的航空母舰。
天谷想到，富有实战经验的海军航空兵是宝贵的财富，他们在以后的战争中的作用将比这艘受伤的航空母舰更大。在这种信念的支配着下，他准备带着飞行员们离开“加贺”号，重新战斗。
但是另一方面，天谷也感到一股难堪的压力，这使他想到了自杀。因为处在他当时境遇的人，自杀符合日本人的传统做法。不管他是航空兵还是什么兵，因为官阶最高，所以他担任了“加贺”号的临时指挥，而作为“临时舰长”，他必须对“加贺”号的命运负责。
在日本帝国海军中，当时仍保持着古代的传统：舰长与舰艇共存亡。日本男人自儿童时就接受的教育使他们认为：日本人是神明所选中的，属于优等民族，比其他民族有教养。日本男人头脑中的这一自我形象是根深蒂固的。日本的宗教、法律及社会习俗都支持日本国民以自杀效忠天皇。
按照许多日本男子的想法，如果此时天谷一死了之，他对“加贺”号及其舰员、对自己飞行员所负的责任就会一笔勾销，而且还能在靖国神社里占上一席之地，成为帝国的守护神并受到天皇祭祀，他的全家也会因此得到荣誉，受到优待。
然而，天谷却不这么认为。在“加贺”号已无法挽救的情况下，天谷命令飞行员和地勤人员尽可能离开这艘航空母舰。
16时40分，他下令弃舰后，自己也跳进海里，向一艘驱逐舰游去。
“舡鱼”号逃到安全海域后，并没有走远。大约18时，它再度升起潜望镜观察战场。布罗克曼看到，被击中的那艘航空母舰上浓烟滚滚，黑色烟柱高达1000英尺，这一场面与珍珠港事件中“亚利桑那”号遭袭后起火燃烧的情形很相似。
此时，“加贺”号上的人员已陆续从舰上下来。“加贺”号也像美国“列克星敦”号航空母舰一样，成了惨不忍睹的样子。19时整，在两次剧烈爆炸的作用下，“加贺”号似乎要跃出水面。接着，它开始下沉，但它的舰体暂时还保持着平稳。
19时25分，“加贺”号完全沉没。
16分钟后，“舡鱼”号浮出水面，发现那艘航空母舰已无影无踪了。潜艇上的人误认为是他们击沉了“加贺”号，个个兴高采烈，喜出望外。
“加贺”号上的舰员共死亡800人，占全舰人员的三分之一。
4.“苍龙”号航母沉没，日军的报复
就在麦克拉斯基少校率队向南云舰队发动进攻时，从“约克城”号航空母舰上起飞的17架俯冲轰炸机，由霍姆伯格海军少尉率领，正飞行在距离日本舰队东南方约10公里。
霍姆伯格看见天际黑烟冲天，便朝西北方向飞去。透过云层，他瞥见了“飞龙”和“苍龙”号两艘航空母舰。他立即下令全队进攻，从4500米的高空向“苍龙”号猛冲下去。