中央军委于10月10日23时复给四野并告四兵团的电报大意说：完全同意你们建议，陈赓兵团即由韶关、英德之线直插桂林、柳州，断敌后路协同主力聚歼白匪。接连收到这些电报，陈赓根据这次大迂回的作战方针和当前情况，经过反复考虑，认为林彪关于把白崇禧集团歼灭在湘桂边境，不使退入广西老巢的想法是对的。但在这时命令第四兵团转往桂林、柳州地区堵击白崇禧集团的主意，则是欠妥当的。因为，四兵团各部正沿粤汉铁路兼程追赶逃敌，正以每日130里以上行程前进，广州指日可下。这时为了执行断敌后路的任务，四兵团如赴桂林、柳州前线，直线距离有1300里，以时间计算不如就近调派四野所属部队迅速；四兵团则不如直下三水，打下广州后不停留地由水路运输，经梧州直取南宁。
问题是，这次中共中央军委同意了林彪的意见。一个在前线的战役指挥员，自己有了与中央军委不相一致的想法，如果向上提出，会不会干扰统率部的决心？关于这一点，陈赓也曾经过反复的思考。陈赓深知，我们党在一个重要问题作出决定时，通常要征求下级组织的意见，并且要保证下级组织能够正常行使他们的职权。下组织如果认为上级组织的决定不符合本地区、本部门的实际情况，可以请求改变，而上级组织的最后决定，下级组织必须执行。正是党的这一优良传统，保障了一切革命斗争的胜利进展。这个时候，作为一个身在前线的战役指挥员，在执行上级给予的作战任务时，应当坚持我党实事求是的作风，不能盲目地执行上级指示，而应结合战争的全局，考虑利弊得失，及时反映战场真实情况，促使中央军委进一步深思熟虑，使军委的最后决断符合现场实际情况。即使是从局部看到的问题，对中央观察全局，作出决策，也可能有参考价值；即使自己的意见不对，如经中央军委指出，坚决执行中央的指示，与事并无损害。同时，毛泽东善于博采众议，正是一直鼓励各个战线的高级将领这样做的。他在直接指挥历次重大战役的时候，发电报都是用商量的口气，经常征求前线指挥员的意见，或林彪、白崇禧国共两大干将对决。者提醒他们根据当地情况酌情执行中央军委的指示。虽然他的心里有底，但是还是拿出来征求意见，如果你提出的意见合理，他很快就采纳。试看毛泽东亲自起草的有关历次重要战役部署、重大军事行动电报指示，在电报的末尾，总会采用这样的语气，询问对方有什么意见：“你们意见如何？盼告。”“你们估计是否有此可能？局势将会怎样？”甚至在电报中说：“如果得到你们同意，请将此电文及××电发给各纵队，引起大家的注意。”就是一些电文肯定地讲了应当怎么办的电报，也给下属留下很大的机动权，在电报结尾也常见到这样的话：“但一切由你们自己决定。”“一切望按情况决定。”或者说：“望斟酌实施之。”
陈赓非常熟悉这个情况，他本人就常接到毛泽东这样写给他的电报；深知这正是我军重要的优良传统和胜利源泉。因此，陈赓在一些重大军事行动中，不论是在会议上进行讨论时，或是在同上级指挥机关电报来往中，一向勇于提出自己经过深思熟虑后形成的重要意见。经过党的长期培养教育和革命战争实践的锻炼，陈赓已经成为我军杰出的军事指挥员，在同中外敌人拼搏的棋局中，他的见解常常高人一招。所以，他的意见常能受到上级指挥机关的重视，得到采纳。这次开始收到林彪发来的电报，陈赓感到此事需要磋商，因此林彪和中央军委的有关电报没有下达给各部队。陈赓首先召集兵团党委的同志开会讨论，他的意见得到兵团其他领导同志的一致支持；又经与其他有关负责同志磋商，他就根据前述考虑的那些意见，亲自起稿，于10月11日3时20分发出致林彪并报中央军委的电报：“我们讨论了军委复你们的10日23时电，提出下列意见请考虑：（一）我们赞成军委和四野在湘桂边求得歼灭白匪主力的方针。（二）但依目前情况，四兵团前锋已进到清远地区，本日在英德以南60里之连江口，我先头部队正在围歼敌2个团：十五兵团本日正围歼佛风敌人1个团；各团每日行130里以上向广州前进中。（三）在此情况下，四兵团为了执行断敌后路的任务，如向桂林，直线距离有1300里，以时间计算，不如十八军、四十六军及十三兵团来得快。因此我们意见，四兵团不如直下三水，打下广州后不停留地用水路运输，经梧州直取南宁。（四）广州敌人增加了胡琏兵团，四兵团不参加，仅邓赖兵团2个军（6个师）曾、雷、林部则时间拖长了。因此四兵团如立刻向桂林、柳州前进，实际上仍须集结队伍，重新动员的时间。则一方面路远赶不上，另一方面广州不能获得迅速解放，有两头失准备的顾虑。（五）也许这是偏重局部的看法，你们从全局打算认为必要，命令一到，我们坚决执行。如何请复。”
中央军委复电接受了陈赓的意见，决定四兵团仍照原定任务行动。10月13日，陈赓即电各军督令部队继续向广州疾进。这天11时得到情报：根据各方情况，敌人可能放弃广州，退集珠江口各屿再退台湾、海南岛左路部队正围歼从化、花县之敌（11时）。即又下令：十五军不应为琶江以南敌人抑制，主力直向广州疾进。十四军在清远不停地兼程向广州疾进；其后尾部队应让开道路，使十三军迅速前进到清远待命。当天中午，陈赓又令十五军速组轻装师向广州疾进；十三军迅速寻找船只水运1个师到三水，主力跟进十四师，星夜向广州疾进。陈赓在命令中强调指出：各军如果动作稍迟，则敌将会跑光。左路军各部队接命令后奋勇追敌。十五军的四十五师于13日14时追至源潭，击溃敌一0三师、一四七师4个团、俘敌1000多人；十四军于同日在清远东北击退敌二十三军2个师的阻击，占领清远；十三军主力也已经进至英德以北。左路军连续攻占花县、从化、增城，并迅速向广州市推进。南路军两广纵队已进至河源地区。林平纵队于11日进至海丰、平山间的多祝。在我军的强大攻势面前，广东各处守敌闻风溃逃，在广州也不敢抵抗，于13日10时炸毁海珠大桥弃城逃跑。我左路军自广州北郊进入市中心区。广州遂告解放。这个时候，各路部队共歼敌2.2万余人，解放了广东省的大部地区。第三次冲突就是发生在广西战役中。
11月23日，林彪判断鲁道源等十一兵团正向岑溪以东方向逃跑，正是歼敌于运动之中好机会。于是火速电令调四兵团的3个军乘胜追击鲁道源所部，只留十三军的三十九师在廉江阻击白崇禧部队向雷州半岛进攻。陈赓收到林总电令后，不禁摇头咋舌。林彪的这一作战计划和敌情完全是南辕北辙；白崇禧的主力张淦兵团正秘密向博白、陆川一线集结，准备夺取雷州半岛。鲁道源的一二五军不过是向东佯动，以掩护张淦兵团的行动。因此，必须以主力守住廉江，切断敌人向雷州半岛尔后向海南岛的退路。陈赓如上向林彪作了建议。林彪的回电神速而坚决：“我决心已下，不能更改。命令各军按规定的时间、路线出动，歼灭鲁道源兵团。”并开列了行军路线。林彪的固执是有名的。这一对师兄弟发生了争执，谁来作裁判？只有毛泽东。陈赓字斟句酌地向军委作了建议，最后还不忘附了一句：各军正待命出动，准备随时执行四野的命令。电报主送中央军委并报林彪、刘、邓。陈司令员要求电台立即发出并催要回电。毛泽东的回电既快又明确：“同意陈赓同志建议。”11月24日，中央军委致电林彪、陈赓：广州解放，市民欢迎解放军。白崇禧于23日集合其所部共16个师向廉江、茂名之线攻击，这是歼灭该敌的好机会。所以，陈赓率部严阵以待。至12月14日，广西战役结束，白崇禧集团共被歼灭17.3万人，基本将白集团全歼于广西境内。曾在战场叱咤风云二十多年的“小诸葛”白崇禧于12月3日飞离广西。10年之后，林彪红极一时。他取代彭德怀，当国防部长。而陈赓又被调任国防部副部长，受林彪节制。那个时期陈赓心中压抑，在郁郁不乐中写了《在祖国南部边疆的三次追歼战》中，以怀念自己在新中国成立前后的那段戎马生涯。心直口快的陈赓大将在文中暗示：当时有人提出了另外一种部署，如果按这种部署，白崇禧集团就会从雷州半岛逃跑了……这篇文章一直被扣到1979年9月14日——林彪爆炸后的第六个年头，才在《人民日报》上登出。