“湖口兵变”之前，蒋纬国除与装甲兵关系密切外，与赵志华的关系更亲密，两人合作长达20余年，蒋纬国对这位西点军校毕业生的信任程度，远远超过对黄埔系、中央军校系学生的信任。赵志华在“总司令”的栽培下，稳且快地上升。特别是在1950年间，作为淮海战场上共产党俘虏的赵，能够到台湾官复装甲兵上校旅长，则完全是蒋纬国在起作用。惟一给两人友谊留下的遗憾，是1963年蒋纬国离开装甲兵总部时，在蒋介石、蒋经国精心安排下，赵志华没有能够成为蒋纬国的接班人，而是让郭东旸领先。湖口事发，蒋纬国不顾自己的困境，尽可能地为赵辩护，认为当事人行动属于莫名其妙的精神不正常行为，不必送军事法庭，关进精神病院即可。赵入狱后，蒋纬国经常去看望，亲自安排赵的妻室儿女赴美定居。安排赵保释出狱就医。赵病故后，当时身为台湾“联勤总司令”的蒋纬国还亲自出面料理丧事。
有以上两层关系，尽管蒋纬国离开装甲兵已经一年有余，但“子弟兵”闹事，作为“老长官”的他难逃其咎。“湖口兵变”发生，蒋纬国立即向国防部长俞大维“自请处分”。俞部长虽为蒋介石所信任的重臣，连任11年的国防部长，可也不敢处分蒋纬国，只是上报蒋介石，由“总裁、总统”裁决。
由于宋美龄出面为蒋纬国后援，蒋介石没有公开处分蒋纬国，而且也缘宋美龄的力保，主事者赵志华这位蒋纬国的老部下，由死刑改判为无期徒刑，所牵涉的30余位将领，也个个都在“原职待退”。但是，蒋纬国就此失信、失宠于蒋介石。疑心极重的蒋介石决定剥夺蒋纬国的带兵权。这样，蒋纬国在蒋介石的最后10年间，实际的部队指挥权已不复存在，只能是拿着笔杆教鞭，在军校里纸上谈兵，并且一直得不到提升，在中将阶衔上的一滞又是14年。
三、没有作为的政治家
“湖口兵变”后，蒋纬国从军事指挥系统转到军事教育、军事研究系统，整整远离兵权十八年，培养了一大批军事人才，成为军学系首领。
蒋介石的早期计划是大儿子接班，小儿子掌握军队撑腰，一文一武，武为文用。可他为何改变计划，放弃了让蒋纬国执掌军队的打算？
一是湖口事变后，蒋介石觉得小儿子思想偏激，情绪奔放，稳重不足，轻浮有余，虽说不至于背叛蒋家，可成事之才逊于败事之能，不堪重任，放在一线位置容易出乱子，还不如早作安排。
二是在旧中国的政治舞台，向来是枪杆子说话最响。蒋纬国如果独掌军权，形成尾大不掉之势，会打乱大儿子蒋经国的接班步骤，还不如早作防范。
三是蒋经国的接班意图明显后，父传子、家天下，令天下人耻笑。蒋介石为减少人们的议论，故意让蒋纬国放弃一些权力，不再担任作战部队主官，以美化自己的形象，淡化蒋记色彩，以蒋纬国的损失来换取蒋记政权得以延续。
四是蒋介石所看到的无可否认的现实是：家人儿子有限，可奴才不少。蒋家人士放弃的职位，可以用听话的下属来代替，况且下属比儿子便于管理，更能理解和执行蒋介石、蒋经国的旨意，对蒋氏政权有益无害，特别是不易造成军权落入一人之手的被动局面。当然为防止军事主官拥兵自重，蒋介石、蒋经国还采取了加强政战系统的监督、强化军事主官任期制等预防措施。
五是对蒋纬国的自我发展，蒋介石则根据自己办黄埔的经验和蒋经国从政接班的经验，希望蒋纬国自己寻找机会表现自己，提高自己。最好的办法无疑是办教育，通过执教办校，以扩大自己的影响，这种威信来得容易，也来得迅速。再说蒋纬国具备到军校任教的条件，他口才上乘，风度不俗，看过不少书，大学毕业后又三度出洋专攻军事，见多识广，文的武的洋的土的齐全。
自愿也罢，不自愿也罢，被冷落的蒋纬国只能是接受蒋介石、蒋经国父子的安排，在湖口兵变后，彻底地从军事指挥系统转到军事教育、军事研究系统，整整18年远离兵权。
国民党军界的指挥参谋学校一共有3所，分别设在陆、海、空三军，负责培训参谋人员，与陆、海、空三军军官学校相配套。“陆指参大学”规模虽不大，但是因为蒋纬国一是内行，二也喜欢教育，所以军校办得有声有色，短短几年间，就在军事教育界确立了自己的权威地位。在“陆指参大学”毕业的学生中，就像蒋介石当年在黄埔军校学生中的地位一样，“蒋校长”名声鹊起。1969年11月，分属“陆、海、空三军”的“指挥参谋大学”合并为“三军大学”，并增设了由蒋纬国一手筹办的“战争学院”。“战争学院”主要培训高级军事将领，并负责进行国民党的军事理论和战略战术理论研究工作。蒋纬国任三军大学副校长兼战争学院院长，这样就在蒋经国于1972年出掌行政院被称为“蒋院长”的前3年，蒋纬国也被他的学生称之为“蒋院长”，从而使得对蒋家向来关心的台湾舆论界出现“兄弟蒋院长”之说。
有心栽花花不开，无心插柳柳成荫。蒋纬国在50年代台湾国民党国防部任职时，结识了国民党的所谓“战略泰斗”余伯泉，开始萌生出对军事战略研究和军事教育的兴趣，但那时毕竟只是业余爱好而已。孰料若干年后，竟会以此为职业消度时日。客观地评价，蒋家并没有亏待蒋纬国，自幼失怙的蒋纬国能有其时国民党军界中之尊崇地位，均系蒋介石之倾心倾力相持。因此，当他明白了蒋介石着意培植其兄长蒋经国日后“接班”之时，他只好与世无争，潜心军事教育，从“陆军指参大学”到“三军大学”，一干就是18年，直到晚年才应其兄蒋经国之召，重返部队，“以军监国”。故蒋纬国之所以安于守成，原因无他，只是蒋家待他之厚，他无以回报而已。
18年的军事教育和军事理论研究生涯，蒋纬国对蒋家王朝的最大贡献，就是继蒋介石的“黄埔系”、蒋经国的“凤山系统”之后，在国民党军队中又培育起效忠于蒋家的“军学系”。18年间，师从过蒋纬国的将校级军官逾万名，蒋纬国的门生遍布国民党陆、海、空三军，且不少为军中重臣。这也成为日后蒋纬国出山重掌兵权的最大的政治资本。当然，此乃为蒋纬国当初所未料及到的“塞翁失马，焉知非福”耶！
18年间，蒋纬国对蒋家王朝的第二大贡献，就是从事反共、蒋介石的指挥、国民党的军事作战、建立台湾顽抗基地的“四则运算”，加以拼凑，填补了国民党的军事理论和实践结合研究方面的空白，并在“研究”的过程中，成为蒋介石军事理论的合适的解释者、虔诚的崇拜者，还是出类拔萃的宣传者。
18年间，蒋纬国对蒋家王朝的第三个贡献，是作为“台湾战略学会副理事长”，负责主编《国民革命军战史》和《中国历代战争史》。通过编史，他把自己的观点完整地搬进国民党的军史之中。“两史”篇幅不小，资料丰富，因受政治的影响，夸大了蒋介石在军事史上的作用，指责、攻击人民革命力量，避而不谈或少谈国民党的败绩，更没有找出南京政府为何失败的原因。只因“两史”不符历史史实，所以大大降低了两书的价值。
从蒋纬国从事国民党的军事教育、军事理研究、编写国民党军史三方面看，其虽遭其父的冷落，被剥夺了兵权，被赶出其称为“第二生命”的装甲兵部，可他的小太子的身份并没有变。
当然，就蒋纬国“好动不好静”的性格而言，执掌教鞭的“校长”一职比起叱咤千军的“司令”之职，其间风光，何异天壤之别！蒋纬国对于自己“无过”而被踢出军事一线位置，始终是“颇有微词”的。
好多年前，台湾流传着的关于他的几个幽默小品，说的就是蒋纬国心中的怨言和苦闷。
一个小品说的是蒋纬国一次对父亲讲：“在中华民国的军事将领中，有两位是一直没有升迁的。其一是你（蒋介石是五星特级上将，为台湾军界最高衔），其二是我（蒋纬国自1961年当上中将后一直没动）。”以此表达自己对应该晋升而未晋升的不满。
另一个小品说的是在一次社交场合，一位属龙的年轻女歌星在唱完一曲《龙的传人》后，端起酒杯向同为属龙的蒋纬国祝寿，祝词是“龙的传人向龙的传人敬酒”。蒋“幽默而感伤”地回答：“龙的传人算什么，这年头龙是连猪（蒋介石属相）狗（蒋经国属相）都不如了。”以发泄对自己不受重用的不满。
第三个小品说的是蒋纬国在演说时，常用的开场白是“我的国语虽然讲得不标准，却是我们蒋家成员中讲得最标准的一个”。此话虽然说的是口音问题，可音外有音，话中有话。是以“话”喻“才”，隐喻自己“才”过父兄，可只能充当蒋府里的“二等公民”矣。
以上政治笑话不足为信，但有一点却是事实，即蒋纬国深懂太极、柔性攻势，并出过专著，更精通阴阳五行说，相信阴抱阳，阳抱阴；阴逐阳，阳逐阴；相互取与，而互依生存。再说他进入著书立说和上台执教的境界后，言必称“军事战略”，对不顺心的事谈得也少，只是经常借机申叙自己的主张和见解，向其父其兄发动迂回进攻。蒋纬国的柔性攻势，对蒋介石来说不起什么作用，对蒋经国来说则起到了时刻提醒哥哥别忘了弟弟的作用。
在蒋纬国即将离开军队之时，由于宋美龄的干预，在60岁时才升为上将，实行“以军监国”。
1975年4月5日，蒋介石在台北“士林”官邸过世。蒋介石弥留之际，蒋纬国一直随侍在侧。4月6日，蒋纬国亲撰悼词，以示哀念。
蒋介石过世后，按照他生前的预定安排，由蒋经国“承继父业”，出任国民党主席和台湾总统，由“老蒋天下”变成了“小蒋天下”。蒋纬国曾戏谑地说：“我原来是‘总统’的儿子，现在是‘总统’的弟弟了！”然而，蒋纬国备受冷落、抑制的命运并没有因为“决定权”的“主人”改换而有所改变。蒋经国上台后下达的第一道军政人事升迁命令为：“联勤总司令”郑为元转任“警备总司令”、“空军副总司令”司徒福晋升“空军总司令”、“总政战部主任”罗友伦转调“联勤总司令”、“总政战部副主任”王升升任“总政战部主任”……惟有蒋纬国依旧是“三军大学”副校长兼“战争学院”院长，不见有任何升迁之希望。
后来，许多国民党元老看不过去，迭向宋美龄进言，并向蒋经国暗示蒋纬国的“出处”，应有合理的安排，不料，却遭蒋经国“婉拒”，理由是“没有适当位置安插”。直到“三军大学”校长余伯泉上将主动向蒋经国提出“退役”辞呈，并力荐蒋纬国接替他的校长遗缺，又经宋美龄说情，蒋纬国才得以出任“三军大学”校长，并晋升为上将。
关于蒋纬国“升迁”的这一曲折过程，台湾尚有一则流传甚广的“故事”，外人莫辨虚实：
1975年8月，蒋介石丧事已告一段落。宋美龄决定离台赴美静养，“士林”官邸的秘书、侍卫自都集中帮着收拾行李和恭送，蒋家长幼两房也被通知前往送行。这一天，蒋纬国比送行启程的时间早一两小时先到，而不同于往昔的则是，这一天他穿着军常服，佩带勋章勋标前往。在以前，蒋氏家族聚会每年总有几次，如蒋介石、宋美龄生日家宴；阴历新年、除夕团圆饭；端阳、中秋等节日，王太夫人的宴诞和忌辰等，都有家庭团聚的场合。所有的人自都是着便衣前往。这天，蒋夫人看到蒋纬国全副戎装出现，并先行了一下军礼，难免有些怪怪的。端详了他一下说：“你穿军装的确很有精神，啥事情今天给我送行又穿军装，又行军礼？”
“因为再过不久，我就没有资格再穿军装了！所以今天给妈送行，特别让妈看看穿军装的印象。”蒋纬国回答。
宋美龄绝没有想过蒋纬国会有“没有资格再穿军装”的事，经这么一说，更加奇怪了！就问：“为什么？”蒋纬国便把台湾军中强制限龄退役的制度，大略的说了一遍。“今天已到了我中将限龄退役的年龄，我已在报请退役了，妈回来时，我退了役自然不能再穿军装看妈了”！这一限龄强迫退役的事，对宋美龄来说，无疑是从来没听过的新鲜事。在她的印象里，自己的丈夫一辈子穿军装，她常见到的军人，像何应钦、薛岳、顾祝同等等，到了拿拐杖、坐轮椅了还在穿。于是禁不住再问：“何敬之（何应钦）为什么可以继续穿？”
“那是一级上将，功在国家，终身职的。”蒋纬国回答。
这才算使闻所未闻的宋美龄弄明白了。说着说着，蒋经国一家也来给宋美龄送行。蒋纬国站起来向哥哥行了一个军礼，蒋经国说：“在家里干什么来这一套？”宋美龄远行未定归期，蒋经国必须和宋美龄有所请示。在往常，都是到宋美龄单独的会客室中谈，可是今天情形特殊，行李已在整装待发，侍卫人员进进出出在搬运，大家都在大客厅坐着谈话。宋美龄忽然指着蒋纬国问蒋经国：“纬国做军人还行吗？”
“他本人就是干军人，干得很出色。”蒋经国一时还不能过进情况，所以只能这么答。
“既然他干军人很出色，为什么听说他的报请退役，要脱掉军装？”宋美龄步步紧逼。
“纬国中将年龄到了，也听说他报请退役，不过我已经交代给他办升级上将的事体。”终于，蒋经国不得不如此回复。
这样，在“中将”阶级上整整滞留了14年的蒋纬国，方得以晋升“上将”军衔，年届60矣！
蒋经国晚年体弱多病，上台不久就开始着手布置“接班”事宜。虽然蒋经国对外界所传“传子是既定方针”的说法一再予以否认，但他精心安排蒋家三代放手抓权则是不争的事实。无奈儿辈们不争气在第三代政治行情最看好的蒋孝武因“江南命案”事发而接班无望之后，蒋经国不得不公开表示：“将来国家元首一职，由蒋家人继位一节，本人从未有此考虑。”台湾下届“总统的选举经由宪法选举产生”，他的家人“不能也不竞选下任总统”。这样蒋家第三代将无缘承继大统，而且事实上也封杀了“蛰伏”加余年的蒋纬国的“政治前途”。