黄瓜供食用部分是其脆嫩果实，含水量很高，采收后在常温下存放几天就开始衰老，表皮由绿色逐渐变成黄色，瓜的头部因种子继续发育而逐渐膨大，尾部组织萎缩成棒槌状，果肉绵软，酸度增高，食用品质显著下降。黄瓜不耐贮藏，在采收后变为棒槌状，酸度增高，果肉绵软，食用品质下降。黄瓜质地脆嫩，易受机械损伤，瓜刺易碰脱，伤口流出汁液，从而感染病菌引起变质腐烂。因此，黄瓜在贮藏中要注意防止后熟变质和腐烂。
一、呼吸作用与贮藏的关系
呼吸作用是生命的基本过程，采收后蔬菜基本停止干物质的累积，呼吸作用成为其新陈代谢的主体，直接联系着其体内各生理过程，体内的贮藏性物质不断供给采后各种生理代谢，为采收后的代谢提供能量，含量不断下降，干物质不断被消耗。从保存干物质、减少消耗的角度来看，蔬菜在采收后应尽可能降低其呼吸作用。因此呼吸作用影响瓜菜耐贮性，呼吸作用越旺盛，各过程的变化越快，生命也终止越早。采后的果蔬，干物质的累积停止，体内的贮藏性物质将不断用于采后各种生理代谢，含量逐渐下降。贮藏性物质的减少，最终造成果蔬品质和耐贮性、抗病性下降。一般来讲，呼吸作用越强，呼吸消耗就越大，所以在不影响正常生理代谢的前提下，贮藏过程中应尽可能降低呼吸作用。
在果蔬贮藏中，抑制其呼吸作用和各种代谢强度，控制好其贮藏环境，保持瓜菜正常的生命活动和过程，是搞好瓜菜贮藏保鲜的前提条件。在控制采后果蔬呼吸作用的同时，必须注意保证其基本的生命活动不受破坏，否则，呼吸过程任何一个环节发生异常，将会打破原有的平衡，积累不完全的中间产物，严重时使细胞中毒，不仅不能延长贮藏期，相反会加速蔬菜腐烂和变质。
二、蒸腾作用与贮藏的关系
有些果实在其成熟过程中没有呼吸高峰的出现，呼吸强度在其成熟过程中缓慢下降或基本保持不变，此类果实称为非呼吸型果实。黄瓜属于非跃变型果实，在成熟期间没有内源乙烯的释放高峰，只能合成微量的乙烯。
蒸腾作用是植物积极的生理过程，是植物根系从土壤中吸收养分、水分的主要动力，也是高温季节防止植物体温异常升高的一种保护措施。采收后的果蔬离开母体后，失去了母体的水分供应，一旦失水就难以恢复，水分蒸发已失去了原来的积极作用，成为一个消极的生理过程。黄瓜以幼嫩果实供食用，新采摘后的黄瓜含水量很高，组织脆嫩，在贮藏中容易因蒸腾脱水而引起瓜皮组织萎蔫、光泽度下降、瓜条变软和萎蔫，失去新鲜的状态，引起西甜瓜品质的下降。因此，在黄瓜贮运中应尽可能地减少失水。
黄瓜的蒸腾作用受到许多内外因素的影响，不同品种在组织和结构、生化特性等方面都有个体差异，所以不同的品种呼吸作用的强弱各不相同，蒸腾作用相差很大。黄瓜在贮藏中不断地蒸腾脱水，从而引起失重和失鲜，即损耗了水分又损耗了物质，质量明显下降，当失水过多时，黄瓜就会出现萎蔫变软。黄瓜采收后，由于呼吸作用失水过多，加速了干物质的消耗，导致萎蔫疲软，代谢作用被破坏，抗病性剧烈下降，腐烂加速。因此生产中尽可能保持适宜的环境条件，尽量减少黄瓜的代谢过程和活动。
三、黄瓜的贮藏保鲜
1.影响黄瓜贮藏保鲜的因素
（1）低温伤害及其控制低温冷藏是搞好黄瓜贮藏的基本条件，但并非温度越低越好。由于黄瓜对低温忍耐力不强，在贮藏过程中在较低温度下会造成伤害。在冷害温度下，由于原生质由液晶态变为凝胶态，膜的透性增大，细胞汁液由细胞内流入细胞间隙。黄瓜受低温伤害，皮薄柔软，透过表皮可看到水浸状的斑块。适宜黄瓜贮藏的温度为13℃，在正常的生理温度范围内，温度越低，黄瓜呼吸作用越小，贮藏效果越好；在冷害临界温度以下，温度越低，时间越长，黄瓜受害也越重。
（2）品种选择不同的黄瓜品种其贮藏性状是不一样的。适于贮藏的黄瓜，应选择抗病性强，果实中固形物含量高，表皮较厚，果实丰满，耐贮藏性好的晚熟品种。由于黄瓜表皮刺较多，容易碰伤或碰掉，伤口为病菌感染创造了有利条件，因此刺少的品种较耐贮藏。
（3）采收贮藏用的黄瓜最好是采收植株中部生长的瓜，俗称“腰瓜”，切勿采收接连地面的瓜来贮藏，因为连地瓜与泥土接触，瓜身带有许多病菌，容易腐烂，也不要采收植株顶部的结头瓜来贮藏，因为这种瓜是植株衰老枯竭时的后期瓜，瓜的内含物不足，在外形上也表现不大规则，贮藏寿命短。黄瓜采收时期应做到适时早收，要求在瓜身呈碧绿、顶芽带刺、种子尚未膨大时进行，即选直条、充实的中等成熟绿色瓜条供贮藏用。过嫩的瓜含水多，固形物少，不耐贮藏，黄色衰老的瓜商品价值差，也不宜贮藏。需要贮运时间长的商品瓜应在清晨采收，以确保瓜的质量。
（4）采后处理与包装黄瓜采后要对果实进行严格挑选，去除有机械伤痕、有病斑、形状不规则、过嫩或老、有虫害的不合格瓜，将合格的瓜拿来贮藏。为了防止黄瓜脱水，贮藏时可采用聚乙烯薄膜袋折口作为内包装，袋内放入占瓜重约1/30的乙烯吸收剂，或在堆码好的包装箱底与四壁用塑料薄膜铺盖。黄瓜贮藏中的病害主要有炭疽病、细菌性软腐病、腐霉病和根霉病等，贮存期1个月以上的可在入贮前用杀菌剂（如特克多）加涂膜剂（如虫胶、可溶性蜡剂）混合浸果处理，以延长保鲜期。
2.贮藏方法
（1）塑料袋装藏法黄瓜很易失水变软萎蔫，贮藏适宜的相对湿度为90%—95%，可采用加塑料薄膜包装，防止失水。贮藏时选用小型塑料食品袋，每袋装1—1.5千克，然后将袋口封扎，注意扎袋口时尽量松扎，放入室内冷凉处，夏季可贮藏4—7天，秋冬季室内温度较低，可贮藏8—15天。
（2）气调贮藏法气调贮藏时，将黄瓜贮藏温度控制在10℃—13℃，控制含氧量为2%—5%，用0.1%—0.2%甲基托布津加1：5虫胶混合液涂被，在气调帐内放置高锰酸钾饱和液浸泡的砖块载体，以吸收乙烯，延缓黄瓜后熟过程。
（3）涂膜保鲜法采用一定量的蔗糖脂肪酸酯，加入一定量的水，加热至60℃—80℃搅拌溶解，并缓慢加入一定量的海藻酸钠，继续搅拌至充分溶解，冷却至室温备用。将黄瓜浸到涂膜液中，浸渍30秒后取出黄瓜自然风干，用塑料袋包装至室温下贮藏，此法可贮藏10天以上。
（4）升华脱水法把黄瓜冷冻，然后输入一个高度真空密封仓内，气压为1025MPa，水分的硬度像冰一样并在高度真空的环境呈升华脱水。此法处理过的黄瓜质地、味道与原黄瓜毫无改变，而且可长期保存。
3.贮藏注意事项
（1）温度黄瓜的适宜贮藏温度很窄，最适温度为10℃—13℃，8℃以下容易受冷害，受冷害的黄瓜表皮变为深绿色，细胞液外渗，很快会感染腐烂。15℃以上种子长大、变黄及腐烂明显加快。有机械制冷设备的冷库是较理想的场所，库藏时将温度控制在12℃—13℃为宜。
（2）湿度黄瓜很易失水变软萎蔫，贮藏适宜的相对湿度为90%—95%，可采用加塑料薄膜包装，防止失水。
（3）气体黄瓜对乙烯极为敏感，贮藏和运输时须注意避免与容易产生乙烯的果蔬（如番茄、香蕉等）混放，贮藏中用乙烯吸收剂脱除乙烯对延缓黄瓜有明显效果。黄瓜采用气调贮藏时，适宜的气体组成是o2和Co2均为2%—5%。Co2浓度高于10%，会引起气体伤害，表现为瓜皮出现不规则的褐斑。另外，黄瓜自身产生的乙烯，会加速黄瓜的后熟进程。