从此“宠遇日隆，比于亲臣”，“朝廷有大谋议，必见咨询。”折冲机枢，襄赞政要，身历五帝，掌教四十四年。至元十五年（1278年）“赐号玄教宗师，授道教都提点，管领江北淮东淮西荆襄道教事”，并钦赐宝剑玉印。延佑二年（1315年）又“领集贤院，领诸路道教事”，俨然执掌全国道教之牛耳，并在北京与全真教分庭抗礼。今北京朝外东岳庙即玄教所建，其规模建制丝毫不亚于全真教之白云观。
玄教事颇繁杂，与本文主旨相关者有三点值得注意：第一点是正一派正是通过与玄教的分中有合，分而又合，从而在元代取得道教的最高支配性地位的。由于朱元璋只承认嗣汉天师府，玄教消亡，全真教亦后继无人，明初道教权势遂尽归于龙虎山。第二点是玄教主要靠运作政治起家，其组织重点也在控制国家的各级道教管理部门，形同官衙，而于道教经义科仪却绝少建树，仍须仰赖正一经典，故龙虎宗教义亦得借其炎势而流播于北方。第三点是玄教传人中颇多精于儒术和理学之辈，因而加速了儒道的相互理解和结合。尤其是理学大师陆九渊家乡之象山毗邻龙虎山，他的着述讲学亦对正一派产生过影响。如玄教第二代大宗师吴全节曾在至顺二年（1331年）向元文宗“进宋儒陆文安公九渊《语录》。世罕知陆氏之学，是以进之。”第四代大宗师张德隆则索性称其六世祖“尝与里人共构精舍于所居之西，延陆文安公讲道其中，俾子弟受学焉。”
进入元代后关羽崇拜开始纳入国家祀典，关羽的戏曲小说和宗教故事也开始了广为传扬，原因固然非一。就道教而言，则“降神靖妖”之神功，既因道教正一派之势张而彰扬，亦缘正一派之荣耀而扩散。
道教《太上大圣朗灵上将护国妙经》，已开始假托关帝说咒传经了，由于这是较早出现为关公托的经文，故全文照录：
“尔时，兴国太平天尊义勇武安王汉寿亭侯关大元帅敕封崇宁真君，圣父聪明正直忠翊仁圣明王，圣母助顺明素元君，神子圣孙，参谋大将，麾下左右，统兵分兵之神，伏兵降兵之神，藏兵收兵之神，布阵摆阵之神，团阵走阵之神，水阵火阵之神，八方八煞四方四勇天丁，掣电轰雷，腾云致雨，鸣锣击鼓，发号施令，将军合司文武公卿，玉泉山得道仙真吾授玉帝敕命，三界都总管雷火瘟部冥府酆都御史，提典三界鬼神。吾登坛示知尔众：日在天中，心在人中。日在天中普照万方；心在人中不容一私。宁为忠臣而不用，毋邪媚以欺君；宁为孝子而不伸，毋忿戾以怼亲。无论纲常伦理，无论日用细微，皆当省身寡过，不可利己损人。一念从正，景星庆云；一念从邪，厉气妖氛。善恶明如观火，祸福应若持衡。凡我含生，总盟此心。吾司雷部霹雳，奏疏速上天庭，昼察阳元功过，夜判冥夜鬼神。若人传写千本，胜看一藏真经，吾遣天丁拥护，自然百福来臻。即说咒曰：大圣馘魔纠察三界鬼神刑宪都提辖使，三界采探捕鬼使者，元始一气七阶降龙伏虎大将军，崇宁真君雷霆行符伐恶招讨大使、三十六雷总管酆都行台御史，提典三界鬼神刑狱公事大典者，提督刑案神霄大力天丁、三界都总兵马招兵大使、统天御地诛神杀鬼大元帅。尔时与会文武圣众，闻是经说，莫不踊跃，赞叹称善。若人虔心讽诵，上至帝王，下及民庶，即得星辰顺度，社稷安宁，人物康阜，灾厄蠲除。凡有请祈，悉应其感，一切人天，均沾利益，信受奉行，作礼而退。”
显然踵继佛教有关“玉泉山得道”传说，不过宣示信众“义勇武安王汉寿亭侯关大元帅”系受玉帝敕命，为“三界都总管雷火瘟部冥府酆都御史”，“吾司雷部霹雳”，亦兼有惩恶之使命。而“宁为忠臣”，“宁为孝子”，“无论纲常伦理，无论日用细微，皆当省身寡过，不可利己损人。一念从正，景星庆云；一念从邪，厉气妖氛”，则兼杂理学及道教之说。
明嘉隆时浙人田艺蘅《留青日札》说：
“雷，地之义气也。故春分而发，秋分而收，昼而作，夜而息。今则方春而震隆冬而轰，无分于昼夜而霹雳，此殆之其所暴然而辟焉。”（重点号为作者所加）
雷为“天地之义气”的说法比较新鲜。田坚执认为的理由是：
“王充有《雷虚篇》，以雷之击人为偶然，辩之甚详。此或未尽天道之妙。天无妄灾，雷无虚击。今历观远近，所击死者，虽未必皆元恶之人，而不善者实居多矣。”
或者正是关羽何以由“义神”兼为“雷神”的儒家解释。但是嘉靖时成书的《三界伏魔关圣帝君忠孝忠义真经》则迳称关羽为“三界伏魔大帝”，并提高其神权，在《关圣帝君诰》中自称为：
“太上神威，英文雄武，精忠大义，高洁清廉，协运皇图，德崇演正。掌儒释道教之权，管天地人才之柄。上司三十六天星辰云汉，下辖七十二地土垒幽酆。秉注生功德延寿丹书，执定死罪过夺命黑籍。考察诸佛诸神，监制群仙群职。高证妙果，无量度人。至灵至圣，至上至尊。伏魔大帝，关圣帝君。大悲大愿，大圣大仁。贞元显应光昭翊汉灵佑天尊。”（重点号为作者所加）
已经成为了道教中统管三界十方、神仙人鬼的超级神只了。从此关公即置身道教神谱之外，自成一格。
另康熙中《百城烟水》描述苏州着名的圆妙观，先缕述其晋、唐、宋时屡毁屡建的兴废过程，元代元贞元年（1295年）羽士严焕文、张善渊复建后的神像是这样排列的：
“左有玉皇、神州、五路、天医、真官、真武、三元、梓潼、张仙、三茅、机房、关帝、东岳、酆都十王、净乐等殿；右有雷尊、五雷、观音、三官、八仙、灵宝、转藏等殿，后有蓑衣、圣贤、高真、方丈等殿。”
则雷部尊神居然与玉皇等分庭抗礼，真武与净乐各为一神，关羽位居东岳之前，观音、八仙同享一体之祀。后人看起来颇似《西游记》之“大闹天宫”。元时道观祀像之随意，于此可见一斑。
另有一题，即关羽诞日向有六月二十四日一说，北宋曾以此日为二郎神诞日。但在张天师系统里，这一天又有什么特别意义呢？
前文已述黄帝“以雷精起”，《重修纬书集成·河图稽命征》：“附宝见大电光绕北斗权星，照耀郊野，感而生黄帝轩辕于青丘。”《春秋合成图》：“轩辕，主雷雨之神也。”《大象列星图》：“轩辕十七星在七星北，如龙之体，主雷雨之神。”《云笈七签》卷一百《轩辕本纪》：“其母西乔氏女，名附宝，瞑见大电光绕北斗，枢星照于郊野，附宝感之而有娠，以枢星降，又名曰轩辕。怀之二十四月，生轩辕于寿丘。”可见宋人也承认黄帝即古之雷神。《山海经·大荒东经》复言：黄帝战蚩尤，得夔牛于东海流波山，“以其鼓为皮，橛以雷兽之骨，声闻五百里，以威天下。”是为黄河中下游地区民间祈赛活动中大张锣鼓之本源。
鉴于元至明初以来，进入国家祀典之道教致祭越来越繁复，明朝弘治元年（1488年）四月，礼部给事中张九功建言“乞敕礼部，稽之祀典，尽为厘正”。尚书周洪谟奉旨清查，言及雷神祭典时，曾道：
“所谓九天应元雷声普化天尊，为道教所尊雷部主神。道教以为玉霄一府，总司五雷，雷部诸神皆受其统辖。又以六月二十四日为天尊示现之日，故朝廷岁以是日遣官诣显灵宫致祭。夫风云雷雨，每岁南郊已有合祭之礼，山川坛复有秋报之祭，重复致祭，非其所宜。以六月二十四日为神现示日，和设像名称，皆无所据，亦祈罢其祭告。”则六月二十四日本为雷神示现之日。又《铸鼎馀闻》卷一：
“明姚宗仪《常熟私志》云：致道观雷部前殿，列律令大神邓元帅，银牙耀目辛天君，飞捷报应张使者，左伐魔使苟元帅，右伐魔使毕元帅，火犀雷府朱天君，纠伐灵官王天君，黑虎大神刘元帅，魁神灵官马元帅，朗灵上将关元帅，雷公江使者（名赫冲），电母秀使者（名文英）。又雷尊殿在招真治，道房内奉九天应元雷声普化天尊，九天雷祖大帝。”
《正统道藏》卷二六〇《酆都朗灵关元帅秘法》称关羽封号为“酆都朗灵馘魔关元帅”，可知雷部众神中的“朗灵上将关元帅”亦为关羽。但后世民间犹以六月二十四日为雷神“诞日”而祭之。案《山海经·海内东经》叙：“雷泽中有雷神，龙身而人头，鼓其腹，在吴西。”吴承泽《山海经地理今释》以为：“雷泽即震泽，《汉志》区具泽在会稽郡吴西，扬州薮，古文以为震泽，可证。”故三吴地区民间赛会独重祀雷神，亦渊源有自。
光绪八年《周庄镇志》：
“（六月）二十四日，澄虚道院雷祖会。”光绪八年《苏州府志》：
“（六月）二十四日为雷祖诞，又为杨山太尉诞，烧香者不绝。是月多食雷斋者，谓之斋月。”
民国六年《同里志》：
“（六月）二十三为火德星君诞辰。是日，里中水龙齐集渡船，庵前互相试验，观者如堵。”
民国十四年《盛湖志》：
“（六月）二十三日炎帝诞，士女拈香于火神庙。二十四日为荷花生日，又谓雷祖诞。持斋者毕集于雷尊殿，进香阗塞道路。”民国十九年《崇明县志》：
“（六月）二十四日为雷祖诞，道士设醮，游街市，焚纸龙。”民国二十二年《吴县志》：
“（六月）二十三日为火神诞。以神司火，祷谢者众。二十四日为雷祖诞，城中圆妙观、阊门外四图观各有神像，蜡炬山堆，香烟雾喷，有集众为雷醮者，延羽流颂经，拜表焚疏，颇形严肃。自朔至诞日茹素者，谓之‘雷斋’。是日又为二郎神生日，患疡者拜祷于葑门之庙，祀之必以白雄鸡。又相传为‘荷花生日’，群游于荷花荡，或遇雨而归，相率科头跣足，俗有‘赤足荷花荡’之谚。”
民国十一年《杭州府志》叙述稍详，曰：
“（六月）二十四日，北山雷院炷香。（《万历志》）咸淳间，羽士陈崇真自闽来，卜居钱塘西湖，善雷法，因敕建雷院居之，赐号冲素真人。六月二十四日设醮醵资，郡人云蒸川赴，至今不衰。（《西湖游览志馀》）阖城烧香，是夜山上茶店以及摊场均备，亮如白昼。”
如果这则方志记载属实，那么江浙盛行的以六月二十四日为雷神诞日的风俗，还可以上溯到南宋。
《淮南子·天文》：“北方水也。其帝颛顼，其佐玄冥，其神为辰星，其兽玄武。”《重修纬书集成》卷三《诗含灵雾》：“其北黑帝座，神名曰协光纪，其精为玄武之类。”同书卷六《河图帝览》：“北方玄武之所生，其帝颛顼，其神玄冥。北方七神之宿，实始于斗，镇北方，主风雨。”同卷《河图》：“北方黑帝，神名叶光纪，精为玄武。”可见“黑杀神”即“北方黑帝”，转而为真武亦与黄帝有关，且自有“主风雨”之神功。
我们知道，符箓派道教所以大兴祈禳斋醮，意图是感通宇宙天地之阴阳造化以趋吉避凶。在以农为本的传统经济模式中，自然灾害对于国计民生的影响是显而易见的，尤其是水旱两灾经常发生，关连尤为直接，道教符箓各派亦俱以祈雨灵验与否，作为争胜之由。而雨以云致风行，雷霆为号，此其常识之谈。《夷坚支志》甲卷五：
“淳熙丙午，桂林连月不雨。府守张钦夫栻遣驭卒持公牒诣雷州雷王庙，问何时当雨。”
即以雷鸣为致雨之征。故征信于人，莫若显示雷霆万钧之先导；宣示于民，亦莫若借助雷霆万钧之声威，故有专以“雷法”祈雨祷验之门派。前引陆游所述之神霄派道士林灵素即以“雷法”着称，曾在宋徽宗时以“金门羽客”喧赫一时。《宋史·方伎传》云：林在京师开神霄箓坛，“浸浸造为青华正书临坛，及火龙神剑夜降内宫之事，假帝诰、天书、云篆，务以欺世惑众。其说妄诞，不可究质，实无所能解。惟稍识五雷法，召呼风霆，间祷雨有小验而已。”
这当然不是以今人科学眼光的批评，但毕竟承认他的雷法颇有功效。神霄派以雷法着称的道士还有一些，如创建人王文卿（侍宸）、萨守坚（萨真人）、邹铁壁、莫丹（月）鼎、谭悟真、陈楠、白玉蟾、彭耜等，一直延续入元。这些人有一个显而易见的共同点，即自陈楠以上都是江西人，陈、白、彭则承接神霄而傍依南宗，主要传行于福建一带。《杭州府志》提到的陈崇真，或即其中一位。这个系统专以雷法行世，包括“行持雷法，祈晴求雨”。道教的雷部神系大概也出于他们之手。如果考虑到《宋史》集纂于正一派玄教领袖道教之时，这种肯定就更值得寻味了。
张继先就是以行持雷法，呼召雷霆的“正一雷法”传世的。《中国道教史》称：“该派自北宋末第三十代正一天师张继先起，吸收内丹术，改进符箓道法，形成正一雷法，而且为之一新，从而表现出新的活力。”第四十三代天师张宇初着《岘泉集》卷七《授法普说》，即为张继先“正一雷法”的说明。
另有《东岳独体关元帅大法》一种，则索性载有召唤关羽的符咒和口令：
酆都大将，斩鬼馘魔。拖刀仗剑，运戟挥戈。威声烜赫，邪道消魔。大刀所拖，倾倒山河。随吾符命，速出北罗。上帝有敕，普济沉痾。急急如北帝律令。再一气合德云云。
俺折吉盘陀加利帝敕煞摄（煞文北气布）皂钱甲马发之。
关羽关羽，吾奉事汝。汝若负吾，天亦不许。吾若负汝，仙职不举。同结斯盟，相为终始。急急如新书律令。
信字召符：速速通灵，北帝/关羽/威灵/威猛/上将/真形/圣者/神灵。四国八方。
“关羽：结结咤咤，金那金那，留离留离，骨奴留离。闻召即至，不得有违北帝信令。违者斩尸。”
可知关羽一度还是道士可以拘魂招致的神将，不但要受天帝（北帝。疑即真武）约束，而且还与道士是“同结斯盟”的关系。道士所以选择关羽结盟，或者就因为他的人格传说中“忠义可嘉”，能够做到“吾汝不负”，因而在有难求助之际，可以特别信赖的缘故。虽不能确定此法成书年代，但应该是在关羽之神格尚未独立，仍然依附于东岳庙神系的时期。
此外，该书基本上以符咒图式口诀组成，属于道士实用性的作法教程，包括召雷方法，就提到“神霄玉府五雷使院”、“祖师紫霄元明显德元君马道清”和“祖师太微侍宸洞玄高明君白玉蟾”，可知与神霄派颇有干系。这与《道法会元》收录的《正一灵官马元帅大法》、《上清武春烈雷大法》的情况相似，有兴趣的读者不妨自行翻检。而这正是为后世儒生深为诟病的。明代有署名“田家”者痛心疾首地说：
“故穷村卑祠，邃壤猥庙，咸立将军诸神之旁，庾币邮庑，观寺店狱，鲜不塑镂将军，竞享纷荐，羽衲之辈，动以符牒，召将军供庾摄之役，又谓将军职天曹雷部，梁仙吏当听指挥，而里人行傩，则尸将军前导，舞蹈跪起，逮之徘优，倒与翻身，侮调斯极。将军有知，宁丼心妖魔之挫，否邪？当其斩颜良，逼许都也，曹瞒虽猛黠超世，犹壮其气而扬其威，今乃丼闾阎之戏具，巫觋之走卒，魑魅之侍胥焉。是所以悲将军者，深于临沮之死时矣。夫土水图画山川之灵，非真将军也。然肖其形，书其号字，是刻画将军，为侮慢计也。即死数千百年，不之恕也，是所以害将军者，惨于孙权与马忠矣。”
财神赵公明最初亦擅“驱雷役电”。《三教源流搜神大全》卷三云：
“赵元帅，姓赵讳公明，终南山人也。自秦时避世山中，精修至道。功成钦奉玉帝旨召为神霄副帅……体则为道，用则为法，法则非雷霆无以彰其威……昔汉祖天师修炼仙丹，龙神奏帝请威猛神吏为之守护，由是元帅上奉玉旨，授正一玄坛元帅……天师飞升之后，永镇龙虎名山，厥今三元，开坛传度，其趋善谢功谢过之人，及顽冥不化者，皆元帅掌之，故有龙虎玄坛实赏罚之一司……驱雷役电，唤雨呼风，除瘟剪疟，保病禳灾，元帅之功大焉。至如讼冤伸抑，公能使之解释公平，买卖求财，公能使之宜利和合。但有公平之事，可以对神祷，无不如意。”
这证实他也属于张天师系统的神只。从“神霄副帅”而兼“正一玄坛元帅”，正如神霄“五雷法”到“正一雷法”的转换，是否意味着正一派复出后，也对其他门派有着某种借鉴承接呢？