前列腺结石的治疗可根据病人有无自觉症状和伴发疾病分无需治疗和需要治疗两种情况。
无需治疗的前列腺结石，病人常常没有明显不适症状，既无会阴部不适，亦无排尿异常，而且结石小，数目少。此类病人常常可以与存留在前列腺腺体内的结石长期和平共处，不必管它，因为这种结石目前尚无特效药可治疗，因而服用那些无关紧要的药物就不必要了。患此疾病的人也不必为此而过多烦恼和担心，因为前列腺结石在许多情况下并不影响身体的健康，许多人发病多年仍没什么变化。当然，并不是说发现了前列腺结石都可以不去管它，而须做定期检查，包括观察结石大小、数目、位置等有无变化。
需要治疗的前列腺结石，常常是由于并发梗阻和感染，或者同时伴有前列腺炎及前列腺增生而须治疗。此时治疗的重点往往是伴发或并发疾病。对伴随前列腺增生的结石可行手术治疗，具体方法有种：①经尿道切除前列腺和结石，即经尿道插入一种特别的前列腺切除镜，在前列腺尿道外边观察边进行前列腺电切，这种方法可以将前列腺内的结石一并取出，临床最为常用，适用于年龄较轻者，可避免术后性功能障碍的发生；亦可用于年老体弱者，但有结石不易取尽、术后易复发等缺点；②大而多发的结石伴前列腺增生可行耻骨上前列腺及结石一并切除术；③前列腺深部的多发结石可行经会阴前列腺（包括结石）切除术。对于伴感染者则可以抗感染和对症处理。