顺治出家一事，一段时期里曾是清初宫史的一大疑案。人们传说清朝入关后的第一代皇帝福临，在自己心爱的董鄂妃去世后，悲伤过度，看破红尘，遁入空门，出家当和尚了。这件事不像太后下嫁"摄政王"那样复杂，但问题很难辩解。
很难辩解的理由之一，就是顺治皇帝喜欢寺庙生活，喜欢当和尚。顺治帝6岁即位，24岁去世，在位18年。他一生中十分信奉佛教，与当时著名高僧玉林謖、木陈、茆溪森等过往甚密。
顺治帝多情善感，身体羸弱，时值青春年龄，放纵情欲，因此神经衰弱严重。他曾对木陈说："我睡觉时只能单人独室，不能与人同床。临睡前，必须让所有的人都出去，若听到一丝气息，就一夜睡不着。睡早了也不行，必须熬过半夜，困极了，才能一觉睡着。"顺治十七年八月十九日，爱妃董鄂妃病逝，这使顺治帝精神陷入崩溃而不能自拔。他自己撰写了4500字的《董妃行状》，又命大臣为她作传，还破例追谥她为皇后，最后又让30名太监和宫女为她殉葬。但这一切都不能使他感情的创伤得到弥合，还昏天黑地不知死活。孝庄皇太后无法，只好派很多人天天看守着他。
董鄂妃之死，给痴情的顺治帝带来了感情上的重大打击福临是史所罕见的专注于爱情的一位皇帝，董鄂妃是他的生命之根，她的死致使福临万念俱灰。这位曾胸怀治国安邦鸿志且以明君自期的青年皇帝，这位曾立下平定云贵五省，建立一统江山雄心壮志的青年皇帝，现在心灰意冷，执意抛却红尘，出家为僧，遁入空门。
这时的顺治帝决意披缁山林，孑身修道，终于在十月初，请茆溪森为自己履行了净发仪式，准备到山西五台山当和尚。十月十五日，玉林謖第二次来到北京时，见茆溪森已给皇帝净了发，勃然大怒，当即命人取来干柴，要把茆溪森当场烧死。顺治帝只得向玉林謖表示自己愿意蓄发，不出家了。玉林謖又对顺治帝作了一番思想工作。他说："若以人间礼法论，皇上应该永居皇位，这样上可以孝敬母后，下可以造福万民；若以世外之法论，皇上也应该永做君王，这样对外可以保护佛法，对内可以管理教内大事。"顺治帝听后觉得有理，便不非要出家不可了。
但是，经过4个多月出世与入世的反复折腾，顺治帝本就虚弱的身体已支持不住了，到年底终于病倒了，很快就染上当时的不治之症天花。顺治帝让玉林謖为自己念经祈祷，又亲自把平日最亲昵的太监吴良辅送到法源寺剃度，作为自己的替身，但病情仍不断恶化。
顺治十八年正月初六半夜，顺治帝自知势将不起，急命学士王熙、麻勒吉速到养心殿记录遗诏。王熙垂泪听命，在床前匆匆写下遗诏的第一段。这时顺治帝已疲惫不堪，王熙担心皇上支持不住，便奏请先将遗诏全部拟出，再呈皇上过目。顺治帝点头同意。王、麻二人到干清宫西朝房连夜起草了皇帝遗诏，又赶到养心殿请皇帝过目。顺治挣扎着将遗诏修改了三遍，天亮时才定稿。
顺治十八年(1661年)正月初七，带着对爱妃逝去的无限惆怅，不满24周岁，正值风华正茂的清代开国皇帝顺治在紫禁城内养心殿溘然去逝，死后葬于孝陵，成为清朝关内皇家墓地——东陵的第一座皇陵。