腹泻病程在2周—2月为迁延性腹泻，2月以上为慢性腹泻。病因复杂，感染、营养不良、酶缺陷、免疫缺陷、药物因素、先天性畸形等均可引起。以急性腹泻未彻底治疗或治疗不当、迁延不愈最为常见。患儿小肠黏膜结构和功能持续损害和正常修复机制受损是腹泻迁延不愈的重要原因。因常伴有营养不良和其他并发症，病情复杂，须到医院综合治疗。治疗如下：
（1）预防和治疗脱水，纠正电解质及酸碱平衡紊乱。
（2）营养治疗，此类病儿多有营养障碍，继续喂养对促进疾病恢复，如肠黏膜损伤的修复、胰腺功能的恢复、微绒毛上皮细胞双糖酶的产生等，是必要的治疗措施，禁食对机体有害。母乳喂养者继续母乳喂养，人工喂养儿应调整饮食，＜6个月婴幼儿用去乳糖配方奶、稀释奶、发酵奶、奶一谷类混合物，每天喂6次，以保证足够热卡。大于6个月的婴儿可用已习惯的平常饮食，选用稠粥、面条，加有少量熟植物油、蔬菜、鱼末或肉末等，由少到多，由稀到稠。对蛋白质过敏（如对牛奶或大豆蛋白过敏）的，应改用其他饮食。要素饮食：是肠黏膜受损伤患儿最理想的食物，系由氨基酸、葡萄糖、中链甘油三酯、多种维生素和微量元素组合而成。即使在严重黏膜损害和胰消化酶、胆盐缺乏情况下仍能吸收与耐受，应用时的浓度和量视患儿临床状态而定。应用时浓度由低到高，每天6—7次，2～3天逐渐达到所需蛋白质和热量。静脉营养：不能耐要素饮食或效果不佳者，可采用静脉高营养。方案由医师决定。好转后改为口服。
（3）抗生素：仅用于分离出特异病原的感染患儿，并根据药物敏感结果选用。
（4）肠黏膜保护剂：思密达，有改善肠液的质和量，加强肠黏膜屏障，吸附细菌、病毒、毒素，有助于受损黏膜的修复和再生。
（5）微生态调节剂：恢复肠道正常菌群等生态平衡，起到生物屏障作用，如乳酶生、丽珠肠乐、妈咪爱、金双歧、培菲康等。
（6）补充微量元素和维生素：如锌、铁、烟酸、维生素A、B，B2、B12、C和叶酸等，有助于肠黏膜的修复。