吕思勉的一生，著有通史两部：《白话本国史》和《吕著中国通史》；断代史四部：《先秦史》、《秦汉史》、《两晋南北朝史》、《隋唐五代史》；专史九部：《中国民族史》、《先秦学术概论》、《理学纲要》、《宋代文学》、《中国国体制度小史》、《中国政体制度小史》、《中国阶级制度小史》、《中国宗族制度小史》、《中国婚姻制度小史》。此外，还有探讨史学研究方法的著作四种：《历史研究法》、《史通评》、《文史通义评》、《中国史籍读法》；作为研究古代史必要工具的文字学著作四种：《中国文字变迁考》、《字例略说》、《章句论》、《〈说文解字〉文考》；指导学习先秦史著作一种：《经子解题》；读史札记两种：《燕石札记》、《燕石续记》。他用新方法整理了旧史实。
当苏联十月社会主义革命胜利后不久，中国共产党还没有诞生，五四新文化运动刚刚开展，我国绝大部分知识分子对马克思主义哲学还抱着怀疑态度的时候，吕思勉却已经认真学习，从思想上肯定了这种认识世界的科学方法，而且用实际行动贯彻在他的史实整理和史学著作中。他惊呼：“马克思其圣矣乎！以其所言，推诸万事而皆准，匪独经济家也！”
胡适在1920年《建设杂志》上发表文章，否定井田制度的存在时，他用新方法整理和再现旧史实，在同年5月的《建设杂志》上发表了长达七千字的学术论文，严予驳斥。
梁启超在1923年的《东方杂志》上发表文章，认为阴阳五行说起源于战国时代燕齐方士，由邹衍首先传播时，他第一个站出来，用新方法整理和再现旧史实，在同年20卷20号《东方杂志》上发表了《辨梁任公阴阳五行说之来历》，反驳了梁氏的这种主观唯心的臆断。
章太炎撰文流露出抵制西洋物质文明的保守思想时，他在1920年发表的《沈游通信》中，用新方法整理、分析旧史实，阐释了“资本社会之破裂，其原因即存于资本社会自身之组织”，批评了章氏视野的短浅。
文言白话的使用还在争议、国内还没有出版过以自学青年为对象的通史时，他却用新方法整理旧史实，在长期教学实践的基础上，写成我国第一部自修适用的《白话本国史》，在1920年12月定稿付印。
唯有运用新方法整理旧史实，才能还历史以本来面目。正因为运用新方法整理旧史实，敢于担当史学革命的先驱，才使他的著述在史学研究领域里熠熠闪光。