森林土壤的污染是指进入土壤的污染物超过土壤的自净能力，而且对土壤和生物造成损害时的状况。用来判定土壤是否污染的指标有二：一是土壤的自净能力，二是生物直接及间接吸收而受害的临界浓度。
土壤的自净能力包括土壤对污染物的固定与分解能力。前者主要是化学的与物理的作用，后者主要是生化反应。这些作用随着环境的节律性变化而持续地进行，每一瞬间都有其相对的平衡状态，而整体却是一个永动过程。土壤学上常借鉴物理、化学与生物科学的方法，以瞬态测定为基础，以动态规律建立估测模型，作为判断土壤自净能力的方法。
使植物受害的浓度，一般是以植株减产10％时的污染物浓度为标尺，或以可食部分的污染物浓度超过食品卫生标准时土壤的污染物浓度为标尺。
森林土壤的污染主要来源于林业自身的生产过程。化肥和农药是最直接的污染源。其次是作为生活废物的土地处理。工业上的废水、废气和废渣也可通过直接或间接的途径（如酸雨和酸雾等）进入土壤。
所有的污染源都不是单纯的成分。土壤的主要污染物质可分为无机污染物和有机污染物两大类。无机污染物包括重金属（汞、镉、铜、锌、铬、铅、镍、砷）、放射元素及氟和一些酸类等，它们在土壤中主要吸附在表层土壤的胶体上，很难降解。有机污染物主要包括农药、洗涤剂、石油、酚、氰化物等，但容易被土壤微生物分解。