马步瀛呼唤父亲不醒，急忙让人抬回公馆。随行医师谢刚杰作了治疗，说是中风引起的昏厥，以致咬破舌尖，口吐鲜血。虽说凶险，但与生命没有大的妨害了，只需静养治疗数日，便可恢复健康。最重要的是在养病期间不能受精神刺激，谢刚杰给马麒注射了镇静药，到了后半夜才苏醒，众人这才放下心来。
这年8月，马步芳由河西走廊率兵返回西宁途中，听说马麒告病，在水峡休养，便取道大通回宁，前往水峡探望。
马步芳这次出兵河西走廊，是为了排除马仲英的势力，占据河西走廊。
上年，马仲英进入河西走廊后，便派人前往南京，通过身为蒙藏委员会委员长的马福祥，与蒋介石取得了联系。后来马仲英又赴南京晋见蒋介石，被任命为新编第三十六师师长。从此，马仲英以甘州为基地，重整旗鼓，补充实力，以图再举。于是，马步芳派该师参谋长戴瑾珊赴开封活动，征得了西北绥靖主任顾祝同的同意，开始对马仲英实行武力兼并。这年，他派所属第九混成旅第一团由马驯带领从西宁出发，经永登占据了凉州，成立了凉州城防司令部。又亲率第二团马步康、第三团韩起功，自西宁经门源、扁都口，直趋甘州。途经洪水，即与马仲英派出的前沿警戒部队发生激战，马仲英部死伤一百多人，不支后退。
马仲英自知实力不敌马步芳，即准备放弃甘州赶赴肃州，与驻守肃州的部队汇合。马步芳率部尾追至甘州。马仲英受到马步芳的威逼，派人请求讲和，马步芳回答道：“这是公事，不能因为我们是弟兄，以私废公。你们退出河西，亦可去新疆另起炉灶，河西是我的防地，不可留你的一兵一卒。不然，我就出兵攻打！”
其时，马鸿逵为了结交马仲英，自宁夏接济了一个师的军装和电台等军用器材，在肃州城外也被马步芳截获。马仲英见马步芳不肯让步，即率部离开甘州，将城防任务交给所收编的国民军高振邦团负责。高振邦团原是国民军雷中田的旧部，因在甘州被马步芳部所围，走投无路，无奈向马步芳投降，表示愿意服从调遣。马步芳表面上接受其投降，实为报当年兰州“雷马争督”之仇。马步芳暗中却令手枪营营长在原甘州提督府旁东小院，掘好了大坑，并埋伏了大刀队百余人。
此后，马步芳又率部进占肃州。马仲英即率兵退到安西、敦煌、玉门三县。适逢哈密维吾尔族发生民变，马仲英部进入哈密。这样，马步芳便控制了整个河西地区。
驱逐马仲英部进入新疆，是马步芳带兵以来的第一次重大的军事胜利，心里自然十分得意。他到了公馆，未及休息，首先去看父亲马麒。问安之后，马步芳见父亲面色很好，又听兄弟马步瀛说了得病的经过，知道是因中风所引起的昏厥，便也放下心来。
马麒见儿子远道前来探望，自然十分高兴，精神也清爽了许多，便问道：“娃娃，你这次出兵河西，战况如何？”
马步芳笑道：“人常说索菲由能打仗，有军事天才，依我看也是名不副实。他的部队和我的部队相比，那是鸡蛋碰石头，差得远哩！”
马麒惊问道：“难道你真的同马仲英交火了？”
马步芳说道：“岂止交火，我已将他的全部人马赶到嘉峪关外去了！”
马麒有些不悦，问道：“索菲由没有跟你说什么吗？”
马步芳说道：“他派人来请求我给他留块地盘。我说，这是奉命剿办，不能因私废公。河西是我的防地，不能留一兵一卒，让他到新疆去开辟地盘。”
马麒听了马步芳对河西作战的详细叙述，长长地叹息了一声，说道：“娃娃，你的心太大，手太狠。倘若对旁人，这也算不得什么。索菲由是你的堂兄弟，在他的手里抢馍馍，你算不得什么英雄！如果不是他舍命反抗国民军，我们马家焉有今天？手足相残，不仅让人耻笑，于己有何益处？出兵之时，我早就对你说过，这次是奉命征讨，得让人处且让人，只要南京政府不怪罪我们，只要索菲由愿意归顺我们，何苦要将他驱赶到新疆？给他兄弟俩在河西留下一块地盘，于我们不会有什么妨害。你又何必要截夺他的武装，杀害他的部众？”
对马麒的责备，马步芳心中并不以为然。他心中奇怪，父亲现在为何这般心慈手软，全然不解自己的良苦用心？于是，他争辩道：“阿大！索菲由已接受南京的任命，成为新编第三十六师师长，军权与我们相当，又不服阿爸的管束，心怀异志，要依靠蒋介石独霸西北，野心不小。此时不赶掉索菲由，占据河西三州，他一旦羽毛丰满，必将与我们为敌，难以制服。这次作战，我并未消灭索菲由的主力部队，手下已是留情。再说，将索菲由赶出关外，使他向新疆发展，作为我们打入新疆的前驱，这对我们有利而无害。阿大，你有啥生气的必要哩？”
马步芳的这些理由，也的确冠冕堂皇，使他难以驳倒。但是，马麒知道，马步芳驱赶马仲英的目的是为了剪除自己的军事敌手。马仲英是南京政府任命的新编师师长，必然会造成对马步芳的潜在威胁。他佩服儿子的心计，但对儿子的自私不赞成，甚至感到忧惧、担心。自从孙连仲处决了马伏良、马朝佐、马步云三人，马麒心中就很不高兴。但那时形势紧急，性命难保，丢卒保车也是一法，他原谅了儿子。这次驱赶马仲英，儿子也是在借南京政府之手排挤马仲英。儿子自以为得计，却不知“螳螂扑蝉，黄雀在后”。驱逐了马仲英，宁海军便失去“联手”，势孤力单了。中央军进兵青海，又怎能抵抗得住？马麒知道，国民军退出西北，地方空虚，中央军必定会进入西北，逐一剪除地方军阀势力。要想生存，就得有足够的兵力，才能不被中央军吃掉。儿子毕竟年轻，虑事不周，谋划不远，以致自折一臂，中了人家的计谋。但事已如此，说有何益。
使马麒忧虑的是自己身后之事。长子马步青，虽然才能平平，但为人总还忠厚，心地总算良善。二子马步芳，才能过人，心高眼大，将来必能干出一番事业。但他性格残忍，寡恩少情，是容不了人的。在儿子中间，马麒最疼爱三子马步瀛。这倒不是马步瀛有什么过人的本领，只是因为他是自己心爱的小妾所生。俗话说：“老爱小。”能舍金砖银瓦，舍不了奶干尕娃。这是人之常情。只是因为这个“奶干”还未成年，倘若自己撒手尘寰，马步芳当权，孤儿寡母，又将如何过活？马麒想到这里，怜悯之情油然而生，他望着马步瀛叹息了一声，默默无语，只是垂泪。马步瀛见老父掉泪，却不知父亲的心思，以为父亲为病情发愁，陪着父亲哭泣。
马步芳对这个同父异母的兄弟，从小就不太喜欢。这不仅是因为马步瀛从小顽劣，不喜上进。也是因为马步瀛恃宠自大，目无兄长，虽为同胞手足，比外人还生疏一些。
对马麒过分宠爱马步瀛，马步芳心里早怀不满。今见马步瀛无端哭泣，败人兴致，马步芳就有怨气，他瞪了兄弟一眼，起身准备告辞。此时，马麒却叫住了他，神情严厉地说道：“胡赛尼！你坐下来，我还有话要对你说。”
马步芳虽然不甚愿意，但也只得重新坐下：“阿大有何吩咐，我听着哩。”
马麒说道：“我这病，也是拖天熬月的事。鹿活千岁，终有一死。说不定哪天胡大给个口唤，也就不在阳世了。我们马家的基业，还得靠你创哩。你很精明，如何上山，如何过河，自然用不着我详细吩咐。只是有一点我得嘱咐你，我们马家创业不易，征战杀伐，枪林弹雨，性命相搏……然而，征战杀伐，争权夺利，对旁人犹可，对自己家族亲人，你要孝悌亲爱，绝不可骨肉相残，让人耻笑。我们老辈弟兄，除了你三爸早年械斗身亡外，我和你二爸总是相敬如宾，从没有闹过什么口角，伤过和气。所以，我们马家才有今日的兴旺。兄弟之间不结怨，肠子里头不插刀。你们亲兄弟三个，最使我牵挂的是你这小兄弟步瀛，他还没有成年，你要好好待他！”
马步芳见父亲流泪，说得哀痛，也对马步瀛产生了爱怜之情。他拉过兄弟的手，抚摸着说道：“阿大，我一定遵从你的吩咐！”
马麒点了点头，又说道：“我的后事，由你二爸主持料理。家产匀作三份，你们兄弟每人一份，由他看着分配，不要说多嫌少。日后，你们各自分开过活。”
马步芳说道：“这些我都遵从。话说到这里，我得问阿大一事。阿大百年之后，青海省政府主席由谁继任？”
马麒问道：“娃娃，你想当主席？”
马步芳说道：“阿哥忠厚老实，又长期在外，军队里没有根基。阿爸现在做着甘肃剿匪司令，用不着回到青海。阿大何不立下一纸遗书，交给黎丹，由他们推荐我做主席，免得以后阿爸同我争权，伤了家族间的和气。”
马麒说道：“娃娃，你的资历尚浅，难以服众。此事我自会安排，你不必跟你阿爸争权。”
马步芳说道：“阿大时常说疼爱我们兄弟，到了关键时刻，却不为我们兄弟做主。父职子袭，古之常理。我不相信阿爸有什么能耐，能把青海的事情办好！”
马麒申斥道：“胡说！你有何能耐，能笼络住省府那些官员？我常教导你，做事不可太急，野心不可太大。倘若你与你阿爸争权，家族中必然四分五裂。咱们马家，必将一败涂地！”
马步芳的请求遭到了拒绝，心中生气，又焉能听父亲的申斥。于是不待马麒说完，便拂袖而起，走了出去。刚走到院内，却听见马步瀛号啕大哭起来。马步芳不由心中一怔，侧耳细听，又听见马步瀛在焦急地呼喊：“阿哥！你快来，阿大不行了！”马步芳心中一惊，急忙返回房中，只见父亲扑跌在地，手足抽搐，面色紫青，口吐鲜血，已是不省人事了。
马步芳急忙将父亲抱到炕上，又连忙找来医师谢刚杰。谢刚杰束手无策，急催马步芳连夜送到西宁中山医院抢救，当夜不治身亡。其时为1930年9月14日。
马麒一死，马家阖族惊骇，犹如大厦断了一根梁柱。只是马步芳倒还镇定，即发电给在兰州的马麟，在北平的马步青，让他俩火速来青海奔丧。
其时，马步青正在北平，路途遥远，不能即刻就到。马麟倒是在第二日下午就兼程赶到了西宁，筹办丧事。叔侄俩一面应酬前来吊唁的军政官员及亲友，私下里却在为继任青海省政府主席而各自紧张活动。
当时，对青海省政府主席继任人选问题军政界分成两派，少壮派拥护马步芳，认为父死子袭，理所当然。元老派则支持马麟，认为马步芳盛气凌人，他一登台，自己必遭排挤。
马麟、马步芳虽然都想继任主席，但这时已到了民国年代，继任省政府主席得由南京政府任命。叔侄俩与南京政府都无很深的关系，也无得力靠山，自然都把希望寄托在对方的让步之上。马步芳托人说服马麟，马麟只是装聋作哑，并不表态。过了两天，省务会议召开，秘书长黎丹及厅长王玉堂、杨希尧和魏敷滋提出，马步芳还没有兼任省政府委员，按例不能任省政府主席，一致主张由省政府委员兼建设厅厅长马麟继任。马麟当仁不让，表示同意。当日便电请中央正式任命。
马步芳虽然心怀不满，但亦无计可施。不过，南京政府并没有立即任命，只拨治丧费三千银元。蒋介石书写了“勋业彪炳”四字的挽幛，加盖“介公翰墨”的朱印，由南京的青海省政府驻京办事处收转。
国民党元老于右任、戴传贤也都寄来了诔词挽幛。
不久从南京传来消息，蒋介石将接受于右任等人的建议，打算暂派国民政府厅长王玉堂暂代马麒的遗缺，再行物色适当人选。
马麟、马步芳在接到征求意见的电报后，两人都大吃一惊。马步芳更是恼怒，对部属愤愤不平地说：“先人创立的基业，岂能拱手让人？”这时，他方才知道老父亲确有先见之明。于是，便转而支持马麟。他主动去找马麟，说道：“先人们创立基业不易，岂能让外姓旁人夺去？阿爸是我们家族的长辈，我们全力支持你老人家继任主席！”
马麟笑了，问道：“娃娃，你这话可是当真？”
马步芳说道：“阿爸，这是啥时候哩，我还能开玩笑？我拥护阿爸当主席，是真心实意，绝无半句谎言。如果我们不联起手来，省府主席可就是人家姓王的了！”
马麟见马步芳说得真诚，极亲热地拉着马步芳坐到自己的跟前，说道：“这样是好，这样是好。古人说得好，‘鹬蚌相争，渔翁得利。’贤侄是极聪明的，想必明白其中的道理。不过话说回来，只要我们叔侄精诚团结，王玉堂必不敢应命，他坚决辞职不干，南京政府必然慎重考虑。承蒙你阿大老班底同僚们的拥戴，电请我继任省政府主席，再有贤侄的通力支持，大事必能成功。我们是一家人，我当主席，就如同你当主席一样，准保不能让贤侄你吃亏。”马麟说罢，抚摸着便便大腹，开怀大笑。
马步芳虽听出叔父话中的讥讽之意，但此时只装憨卖傻，亦陪着笑了一阵。末了，马步芳问道：“阿爸继任了省主席，总得让我兼任省政府委员吧？”
马麟说道：“这是自然。咱们是一家人，什么事情都好商量。”
马步芳说道：“阿爸升任青海省政府主席，照例不能兼任甘肃暂编骑兵第一师师长，这第一师师长是否由我阿哥马步青出任？”
马麟没有料到马步芳会突然提出这个问题，吃惊地睁开眼睛，说道：“这个，步青还在北平，隶属于宋哲元部，人家怕不会放他回青。再说，骑一师也没有地方安置，总不能将它调回西宁来吧？骑一师现在驻扎在兰州新城，用来对付雷中田，骑一师一撤，甘肃就是人家的天下了。”
马步芳知道这是马麟的搪塞之辞，其实是不愿放弃军权。于是他绵里藏针地说道：“这事不必阿爸担心。我已发电报让阿哥及他的部队来青，将来把马驯旅由凉州调回西宁，安置阿哥驻扎。如今冯玉祥兵败，阿哥长期在外，也不是办法。让他统率骑一师，占据河西地盘，亦可保存我们的一支军力，以免被别人吃掉。我阿大操劳一生，才创立了我们马家的这份家业。如今我阿大不在世了，我们兄弟拥护阿爸您兼任主席，阿爸总会给我们兄弟这点面子？”
话说到这个份上，若不答应必然会得罪马步芳。马麟一狠心，说道：“贤侄，就照你说的办吧！宁海军的军权由你掌握，不过南京方面，你还得活动活动，表明对王玉堂的拒绝态度。这事得快些办，不然任命一下，既成事实，那就难以转圜了。”
马步芳说道：“这是自然。阿爸放心，一切由我办理！”
当下马步芳辞出，遂即找黎丹、李乃棻等商议，电告驻京办事处长王廷瑞出面，以答谢对马麒的治丧为名，向南京政府各重要官员及其眷属，馈送了名贵的紫羔皮、鹿茸、麝香、藏红花等土特产品，并婉转表达了对王玉堂代理青海省政府主席的拒绝态度。
其时，王玉堂迫于马步芳的压力，一再向南京政府表示谢绝之意。蒋介石当时因王玉堂并非嫡系，一时又没有急于图青的打算，于是顺水推舟，在这年9月2日，明令马麟继任马麒遗职，并任命马步芳为青海省政府委员。
再说，马麒葬于西宁南川水磨尔庄不久，马步芳、马步青兄弟便花费巨资建陵园，修砌砖石墓道，并在墓道修建牌坊，栽种花木，雕梁彩绘，极为华丽。更有一桩奇事为各省所少见：马麟、马步芳在马麒病殁的第二年，授意建设厅长李乃棻在西宁城北门外水香公园内建了一座马公祠，以纪念马麒。于是各县县长，相继仿效，修建马公祠。有的县来不及修建，即用庙宇改修。
这时的马步芳身为国民政府陆军新编第九师师长，并兼省政府委员、青海省保安处处长，军权在握，炙手可热。那些省府军政官员，趋炎附势，无不把他奉为真正的“青海王”。不过，马步芳对元老派们的衔恨并未消除，总想伺机报复。
马麟任青海省主席不久，马福祥利用任国民党中央蒙藏委员会委员长的有利地位，活动蒋介石任命其侄子马鸿宾为甘肃省政府主席。
这年8月25日，国民党中央陆军新编第八师师长雷中田在兰州以军事政变的方式，扣押马鸿宾，当时报纸上称之为“雷马事变”。消息传来，西宁形势顿时紧张起来。