结果树修剪是在整形基础上整理枝条，增加树体通风透光度，改善光照条件，减少病虫害，调节开花结果与生长的矛盾，改善果实品质，克服大小年结果现象，为丰产优质创造条件。特别对于矮化密植型果园，枝叶密集，投产几年内就会封行，对结果树的修剪尤为重要。结果树修剪主要为采果后修剪和生长期修剪。
一、采果后修剪
在果实采收后的8～9月份进行，这1次修剪为全年修剪最大的1次，目的是调整树冠永久性骨干枝的数量和着生角度，使其分布均匀。方法以短截结果母枝为主，并适当剪除过密枝、过多主枝，回缩冠间和冠内的交叉枝、重叠枝，剪去下垂枝和病虫枝。果实采收后，因为结果枝弯曲下垂，所以应沿结果枝上较强壮有芽的地方剪断，使其抽新梢，留取强壮者作为翌年的结果枝。剪枝时不可过度短截，否则会影响到翌年的抽穗。树龄在10年以内的结果树，采果后修剪不宜过重，以免影响次年的产量。树龄10龄以上的树体高大，枝条错乱，不仅影响通风透光，也给管理带来许多不便，所以应及时回缩修剪株间或行间交叉枝条，衰弱、过密、病虫、重叠枝条应疏除，树冠中部的直立型徒长枝条可适当短截或从基部疏除。此次的修剪应与施重肥和病虫害防治紧密配合才能取得较好的效果。
二、生长期修剪
生长期的修剪包括秋梢
修剪、春夏梢修剪等。主要采取抹芽、疏梢和短截的方法。秋梢的修剪：经采果后修剪抽出的秋梢，根据空间位置保留1～3条，其余的抹去，留下的枝梢长至18～20厘米时短截，促发第2次抽秋梢，以此方法，末次秋梢留取长18～20厘米、中等粗壮的枝条作为结果母枝，其余的抹去。春夏梢修剪：在开花不足的小年，春夏梢大量抽生旺长，新梢对养分抢夺剧烈，导致花序抽生纤弱，坐果率不高，所以，对开花量不足50％的树视情况疏枝抹芽，以保证足够的营养促使花序正常抽生。此次修剪在春梢抽出后，即第2次生理落果后（果有鸡蛋大时）进行，目的为了将未结果的春梢培养为翌年的结果枝，使大量的养分能完全供给果实的发育，所以一方面要选留发育强壮的新梢，剪去过多的纤细枝，另一方面疏去影响果实发育的花梗与枝条，并将畸形果、病虫害果和过小的败育果，减小果实对养分的消耗，减少花梗及枝叶对果实的摩擦损伤，增加果实的光照，使果实发育均匀，增进果实外观，提高果实品质。在我国台湾，果农在收果前30天疏剪过密的新枝或短截未结果的枝以增加光照。为了保证良好的光照条件，培养出克服大小年、保证丰产稳产、具有优良结果性能的树形，对结果树的修剪应该是经常的和必不可少的管理措施。
三、培养结果母枝
芒果通常是顶花芽，末级梢只要适时老熟均可成为结果母枝开花结果。在我国大部分芒果产区，丰产树很少抽生春梢和夏梢，所以一般都以果实采收后抽出的秋梢或早冬梢作为结果母枝。促发适时停止生长的秋梢或早冬梢是培养优良结果母枝的关键。在有些地区，春夏梢也可分化成为结果母枝。芒果花穗大多数从上一年最后抽生的枝梢顶端或叶腋抽生。上一年生枝无论是一年抽1次、2次或3次梢的，一般都能抽穗开花。但连续抽梢4次的抽穗率低，应把最后1次抽生的梢摘除，使留下的枝梢老熟，为第2年的抽穗开花积累养分。结果过多的树负重多而下垂，采果后应及时进行适当的修剪并施1次重肥，促使抽发健壮秋梢。纬度较低的雷州半岛以南在8月底修剪完毕，抽梢次数最多可达3次，末次梢在12月底至翌年1月初老熟，进入花芽分化；而在雷州半岛以北的广州地区末次梢在12月底或翌年1月初可能仍未老熟，采果后修剪就要在8月底以前完成，并保证有充足的水肥供应，在花芽分化前枝梢有1～2次抽生，保证花芽分化。