白灵菇菌丝在25℃的温度下生长最适，不仅生长速度快，而且长势旺、健壮。高于30℃生长虽快，但菌丝纤细，长势弱；低于则20℃生长明显减慢。因此，发菌场所要保持25℃的温度，但是当菌丝生长繁殖时要进行呼吸，当菌丝大量繁殖时，放出的热量增多，会提高菌袋内培养料的温度。特别是当接种后15～25天这段时间，菌丝大量生长，呼吸加强，消耗氧气量大，放热多，因此菌袋的温度往往高于发菌场所的气温，如果不采取翻袋或通风散热等措施，会引起“烧堆”。在这一段时间发菌场所的空气温度要适当低一些，以利于菌袋散热。
由于白灵菇发菌期间菌丝主要从培养料内吸收水分，而不是从空气中吸收。因此，培养室内应干燥通风，控制空气湿度为70％。若室内潮湿，有利杂菌滋生，反而对菌丝生长不利。室内空气湿度过大时，除加强通风排湿外，可在地面撒消石灰吸潮并防除杂菌。