瘿蚊是昆虫纲、双翅目、长角亚目、瘿蚊科的一些种类的统称，危害双孢菇的种类主要有异足瘿蚊、史氏嗜菌瘿蚊和巴氏嗜菌瘿蚊。三种瘿蚊中异足瘿蚊的危害最为严重。瘿蚊成虫不直接造成危害，但能携带和传播病原菌、螨类、线虫等，并通过繁殖幼虫造成危害。
防治措施参照菌蚊类害虫的防治方法。另外，由于瘿蚊幼虫不耐干旱，所以，出菇期如果发生瘿蚊，应停止喷水，使床面适当干燥，促使幼虫停止生殖或因缺水而死亡。
