1959年，作为制订新中国科技发展12年规划的成员，林为干出席了在北京举行的国防科委科学规划工作会议。会议研讨当前国家建设所需要的重要科学技术任务和中心课题。
会议结束后，正值除夕夜，参加研讨的科学家们受到周恩来总理、聂荣臻副总理的宴请。在北京西郊的某宾馆里，周恩来、聂荣臻等领导人与制订规划的科学家们欢聚一堂、亲切交谈。林为干和其他参会的科学家和技术人员一样，被科学发展的美妙前景激动着。周恩来总理走到他身边，和他碰杯祝贺，亲切地询问他工作的情况，并感谢他为科学规划所做出的努力。国家领导人的亲切关怀，让林为干十分兴奋，他怀着激动的心情向周总理汇报了自己的工作情况。之后，参会的科学家们还受到了毛主席的接见，这是对林为干工作的肯定也是激励，回到成都以后，林为干激情满怀地投入科学研究中。
但不久，再次因为“政治历史问题”，中央第二机械工业部批示，将把林为干调离国防工业院校，去四川大学执教，并中止其预备党员资格。接到这个消息，林为干沉默了很久，但他随即向组织表示“到哪里去，做什么工作都是为党工作”，并保证一定会做好移交工作。
听说林为干要走，在学校召开的院务扩大会议上，学校领导专门为林为干送别，林为干表示一定会把学校的工作做好才离开。
其时，四川省工业展览即将在成都召开，林为干负责的一个项目将代表学校在该展览会上展出。同时，林为干还要负责学院的首次科学讨论的筹备工作，这次会议应邀参加的有中央和四川省有关部门、一机部部属高等学校和北京、天津、上海等地有关高等学校、无线电厂、研究所的150多名代表。这让作为院长助理的林为干恨不得有分身之术，白天他就在各科研处和大家一起讨论会议的筹备情况，常常讨论到晚上十一、二点，才又回到实验室开始参展项目的研究。
工夫不负有心人，学院首次科学讨论会取得了圆满成功。通过科学讨论会，全校掀起了一个“学、比、赶、帮”的群众性的社会主义竞赛运动。之后在1959年5月6日召开的四川省工业展览会上，林为干的项目在会上成功展出，当时正在四川视察的刘少奇副主席还专门到该项目的展台前参观，对林为干的研究给予了高度肯定。
做完了手头上的工作，也完成了最后的移交工作，林为干等待着组织的一纸调令，就在此时，戏剧性的一幕再次降临到了他的身上，他收到通知将不调动他的工作了。与收到调令一样，林为干当做没事发生似的，回到自己的岗位上继续开始工作。这一干就是 40 多年，林为干把他的青春和智慧都奉献给了成电。
20世纪60年代初，林为干在对微波滤波器、矩形滤波器等的研究基础上、对传输线理论进行了系统的研究，拓宽和发展了保角变换在电磁场中的应用。1963年，他与当时的助手钟祥礼副教授在《物理学报》上合作发表的《矩形内导体圆柱外导体同轴线的特殊性研究》论文，建立的计算公式被英国《马可尼》丛书第二卷大量引用。丛书根据他们的计算公式制成了曲线图表，和其他六七个欧美科学家（包括谢昆诺夫这样的微波理论创始人）的计算公式相比，他们的计算公式最准确，最便于计算和估值，被誉为“林－钟”方法。正是林为干有双洞察秋毫的慧眼，盯住了目标，看准了方向和“神游冥想”积极思维的学术风格，使他假以时日获取成功。
从1951年8月到1964年，林为干共发表了17篇论文，带领我校在电磁理论、微波技术、光纤技术、电磁辐射与散射等领域走在了世界学科研究的前沿领域。
总结自己这么多年的工作，林为干说在他的一生中，生活还算平坦，但也遇到过挫折、不幸和遗憾，但他都把这些看做是上天赐予我们的不可多得的去体味生命的完整和真实，去丰富生命的营养的机会。
对于科学研究之路，林为干说，一个人一定要勤奋，勤奋是一个人走向成功路途中最重要的一环。