顺治七年，多尔衮去世，顺治开始亲政。亲政之后，顺治重用汉官，尤其是洪承畴等人。在这些人的辅佐之下，整个大清朝走上了正轨。
人算不如天算，命运仿佛跟多尔衮开了一个大玩笑，多尔衮竟然真的应中自己当初立下的誓言，短寿而死。
当年他在誓言里是这样说的，他和济尔哈朗一定会为皇上分忧，如果不秉公处理，反而妄自尊大，漠视兄弟，不服从大家的商议，处理事情怀有私心，以内心的恩怨情仇为重的话，就会被天地谴责，让自己短寿而死。如果从誓言的内容来看，多尔衮似乎犯了几乎里面所有的罪行，结果，他在三十九岁壮年而亡。按理说，这个年纪本来应该是事业如日中天的时候，他却突然去世了，难道真的是中了誓言的诅咒？
多尔衮的身体一直不太好，据他自己说，是因为在松山大战的时候太过于劳神费心而留下了病根。入关之后，他又过多地操劳于政事，每天都在忙于批阅奏折，让他觉得疲于应对，时间久了就头昏目胀。
他当时的病，大概就是现在的脑血管病，他自己也知道自己的病情。有一次多尔衮发牢骚说，我身体病成这个样子，小皇帝怎么也不来看我一下，他年纪小不懂事，你们也都不来，难道你们也是不懂事吗？然而即使是病成了这样，他也没有放弃紧握自己手中的大权。就是这些朝廷大权和军中要事，让他的身体一步步衰弱了下来。
就在他迎娶朝鲜公主的那年，因心情不好，竞不顾自己的身体状况带领王公大臣们去围猎，结果不小心从马上摔下来，他爬上马后继续坚持行走了一会儿，终于感觉力不从心了。这之后，他的病情日益加重。他慢慢感觉到自己的身体每况愈下，也许将不久于人世，就着手对死后的事情做一些规划。
本来多尔衮最依赖倚重的是自己的兄弟两白旗，他最器重的人，就是与自己同父同母的亲弟弟多铎。多铎是个文武全才，曾被任命为辅政王。但也许是天妒英才，顺治六年（1649年），多铎死于出痘。对于多尔衮来说，这无疑是一个沉重的打击。多尔衮的哥哥阿济格是一介武夫，有勇无谋，还脾气暴躁，容易坏事情。
多尔衮深知自己长兄的缺点，所以没有重用他，但是也多次派他出征，以建立功勋。多尔衮死前，秘密地召见了他的哥哥阿济格，安排了一些身后事。顺治七年（1650年），多尔衮死于边外喀喇城。一代枭雄就这样与世长辞了，享年三十九岁。
多尔衮去世的死讯传到京城，满朝震惊人心浮动。孝庄皇太后为了稳住局面，防止多尔衮的余党趁机行动犯上作乱，决定以退为进。顺治皇帝表现出非常伤心的样子，亲自率王公贝勒大臣们身穿孝服，在大殿门外五里迎候多尔衮的灵柩，并举国为他举行了国丧，肯定了他对平定中原、统一天下的巨大贡献。
之后，又追封多尔衮为义皇帝，多尔衮生前一直想做皇帝却未能如愿，结果死后却被尊称为帝，可惜，这只是一个虚名罢了。