我国目前尚面临着严重的生态赤字，防护林体系建设才刚刚起步，且规模庞大，资金短缺，发展又很不平衡，面临的困难和任务还十分艰巨。
（1）防护林体系建设依然是当前和近几十年林业建设的重点。我国现有防护林总面积1456平方米，占林业用地比重5.5%，远远低于发达国家的发展水平。一方面要加快现有防护林体系的建设，使其科学化、规范化，尽快发挥综合效能；另一方面是因地制宜、围害设防，加快对西藏一江两河地区、淮河及太湖流域的防护林体系建设，以及鄱阳湖、洞庭湖、广东珠江等的综合治理。
（2）加强对现有防护林体系的管理及效益的评估。我国防护林体系规模居世界之首。在经营管理上要进行宏观控制与微观协调，加强从幼林管理、抚育间伐到防护成熟、更新的理论与实践研究，提高现有防护林的质量，建立系统的防护林经营体系。对防护林效益的评估，是客观地分析总结防护林建设成败的关键。
（3）加快生态经济型防护林建设。生态经济型防护林体系是在系统的总体生态经济条件下，以优化土地利用为基础，以发挥当地水土资源、气候资源和生物资源的生产潜力为依托，以防护林为主，多林种合理布局，改变单一生态型防护林结构，实行造林绿化、木材生产、林产工业、多种经营并重方针。提高防护林建设的自我积累、自我发展机制，使工程建设由单纯输血型变为输造血结合型。
（4）增加对防护林体系建设的投入。国家对防护林体系建设经费投入应不少于国家财政总支出的0.68%；国家应尽快建立生态效益补偿机制，理顺经营者与受益者的关系，激励全民环境保护意识。生态补偿机制就是政府通过市场之外的各种形式，如征税、缴费等对林业建设的合理补偿，以增加对防护林建设的必要投入。