元代的赋税制度和徭役制度同国家的经济、政治制度一样，是我国封建社会赋役制度的承继，同时也有许多特异之处，对元朝的兴衰有着重要的影响。
元朝的田赋和其它赋税呈现南北异制，就是同一地区的赋税，制度有很大差别。原因在于：统治者征服各地的时间不同，只能因时立制，不可能强求统一。
元代的商税和盐税较之以前有所发展，并规定赋税征钞；元代建立赋役册籍，强化里社制度，保障了徭役征发。
元朝赋税制度南北异制，就是同一地区的赋税，制度也有很大差别。同时，元代由于商业的繁盛，使商税无论是品类还是数额都有明显增加，成为元朝财政的主要收入之一。
此外，因为元代货币经济发达，政府以钞为法定通货，因此在赋税中采取征钞的办法。这些有别于前代的赋税特点，体现在元代各个方面的赋税法规中。
元太宗即位之初，接受耶律楚材建议，初定地税之法，地税的税率“上田亩税3.5升，中田3升，下田2升，水田5升。”元世祖时，除江东、浙西外，其他地区只征收秋税。
1282年，江南税粮按宋旧制折纳绵绢杂物。1296年，才开始确定在江南征收夏税，以木棉、布、绢、丝等物交纳。
元世祖之初，曾多次进行括田，履亩征税。这种括田，虽有增加田赋的意义，但以均平田赋为主。
1314年，元世祖采用大臣奏议，实行经理法，旨在括隐田，增赋税。首先张榜，晓谕百姓，限40天内，将其家所有田产田赋，自己向官府呈报，如有作弊，告发得实，或杖或流，所隐田产没官。
元代初年，继续实行盐专卖，盐利是元财政收入的主要支柱。元朝对其所属盐场实行不同的税率制度，因地而异。政府对盐实行定额税，以白银交纳。
元代的茶税也是国家的一项大宗收入。元代茶税制度基本上是因袭了南宋旧制，实行茶专卖，间或在某一时期或地区征税，或两者并行。
1288年，元朝颁布《榷茶条画》，其主要内容有：茶园不得纵头匹损坏；差官巡绰出差札者，不得夹带私茶；蒙古万户、千户头目人等，无得非理婪索榷茶酒食撒花等物等。
除上述盐茶专卖外，元对酒醋等也实行专卖并课税。元代对酒醋征税始于1230年正月。
当时的规定是酒醋同税，税率为十取其一。由于征收困难，特别是为了保证粮食的基本用途，所以实行官制官卖，设立了酒醋务坊场官，专管酒醋制造和买卖事宜。至元代后期，实行榷征的办法，并大兴造酒场所。
元代的酒醋税大都以银钞缴纳，这就是“赋税征钞”的特点。但偶尔也征收实物，如粮食。酒醋税一直是元代重要的财政来源，减免情况甚少，加上大多实行专管，收入比较稳定。
元代时期的牲畜税在当时称之为“羊马抽分”，是元代建立以前就有的蒙古最古老的税种。有资料记载的元代牲畜税始于1229年8月，当时由于战争的需要，规定凡蒙古人有马百匹者及有牛、羊百头者，各纳其一。这种办法一直持续至元代建立以后，前后近70年没有大的变化。
元代还实行市舶课税法。元承宋制，对国内与海外诸国往还贸易的商舶及海外诸国来华贸易的船只，统称市舶。对中外船舶所载货物的抽分与课税，叫市舶课。
元代市舶课制度，初期沿袭宋朝旧制，实行抽分法，即对进出口货物抽取定量实物。抽分之后，随客商买卖，在贩卖时另征商税。为鼓励土货出口，曾实行双抽、单抽之法，对土货实行单抽，对蕃货实行双抽，即加倍征收。
元代商税是一种交易税，收入主要来自全国三四十处大中城市，但在财政收入的钱钞部分中占有重要地位，其重要性仅次于盐课。1270年正月，忽必烈立尚书省，以回族人阿合马平章尚书省事。
阿合马长于理财，采取多种措施，增加国库收入。阿合马规定了应征商税的总额，这成为有元一代通行的制度。