一行学习十分认真。他在向师父学习梵语和密宗经典的同时，也向师父学习“工巧”，这为他以后和梁令瓒合作，共造天文仪器，打下了良好基础。师父的手巧极了，自制模型，铸造金铜灵塔，备极庄严。所画曼陀罗尤其精妙，妙手天成。这大概是虔诚诵“真言”的缘故吧，诸法皆成就嘛。
两三年里，一行从善无畏学习了密宗胎藏界全部理论、修法和仪轨，成为胎藏界阿卷土重阇黎，即地位很高的师父。在以后的几年里，除帮助师父译《大日经》，并为之作《疏》外，又积极建议皇帝让善无畏译《苏婆呼童子经》三卷及《苏悉地羯罗经》三卷，为弘扬密宗建立了最基本的理论基础。
开元七年（719），南天竺阿阁黎金刚智闻说中国佛法兴盛，从海道来到广州，奉敕入长安，次年又随驾入洛阳。他每到一处，必建大曼陀罗灌顶道场，广收门徒，传授与善无畏相异的金刚界密法。据说，金刚智在南天竺观音寺断食七日求法，使枯萎的尼拘陀树重新枝叶繁茂，感动了观音菩萨，便现身对他说：“……可往中国礼谒文殊师利菩萨，彼国与汝有缘。”这样一来，他来到中国后，便受到很高的礼遇。一行已对密教产生了浓厚兴趣，所以，他又拜金刚智为师，学习金刚界密法。
这年从正月到五月一直未下雨，道士们祈雨无效，玄宗皇帝下诏令金刚智结坛祈雨，并诏一行：“请大师到结坛地点谨密候之，若金刚智有何需求，只要能祈下雨，可尽量供给。”因为此前几次以密法祈雨都是十分灵验的。
汉地佛教在实践上不主张修神通，一行也不崇尚神通，但他一向谨慎、老成，还想看看金刚智这一套金刚界密法到底有何特色，所以奉旨后便立即来到广福寺。
密宗金刚界讲究“智差别”，与胎藏界的曼陀罗不同之处是：供奉佛菩萨共一千四百六十一尊，而对方的曼陀罗供奉佛菩萨仅四百一十六尊。金刚智领着弟子们正忙着筑坛，绘曼陀罗，坛高四肘。
一行扫了一眼，发现金刚智没有按照正常曼陀罗画法，即中央绘上大日如来，周围绘上东方阿閦、南方宝生、西方无量寿、北方不空成就佛，外围再绘上其余的一千多尊菩萨，而是直接绘了七俱胝菩萨像。以非常之法行非常之事，勉强给自己留了一点儿退路。
金刚智和徒儿们看见一行，不待开口问便说：“这是用不空鉤，依菩萨法……”然后便招呼：“请大师坐，请上坐，给大师泡茶，泡好茶。”
一行说：“奉旨听候金刚智大师差遣，大旱五月，大师若能祈下雨来，真是无量功德。贫僧能参与盛事，真乃三生有幸。从今日起，就在此恭侍您了。”“哪里，哪里，您是钦差，皇上这样看重这次法事，老衲说不得尽力效命就是。”
“那么敢问大师，何时能祈下雨来呢？”
“明日六月初八，法事正式开始，七日为限，至迟到第七日给菩萨‘开光’时，雨一定下来。”金刚智掐着指头说。
从此一行就住在广福寺里，谨守曼陀罗戒坛寸步不离。这七天里金刚智领着徒弟们，对着没画眼珠子的七俱胝菩萨，不停地念《请雨咒经》，《龙咒水浴经》，《五龙咒毒经》。到了第六日晚上仍是万里晴空。金刚智命徒弟们以牛粪涂地，设饮食花果，烧安息香，每人用白线一条念《陀罗尼咒》，念一遍打一个结，共打了四十九个结，说是这样所有的障碍鬼神都被缚住，明日就可以顺利降雨了。徒弟们已累得东倒西歪，金刚智还在强打精神。一行心中老大不忍，暗中打定主意：如果祈雨不成，尽量帮助金刚智过关。
第二天仍是湛蓝无云，涂在地上的牛粪臭哄哄地薰人，招来不少苍蝇、蚊子、壕虫。午后好容易起了一阵西北风，飞瓦拔树，裹沙卷尘。金刚智绽露笑容，赶紧让给菩萨“开光”——画眼珠子。眼睛画好了，风也停了，雨还是没下。金刚智呆立如木偶，一脸无奈。
一行宽慰道：“大师歇息，天意从来高妙难违。贫僧昨夜观星象，太白金星犯东井钺星，今日未雨，恐与此有关，且看太史局占卜结果吧。”
金刚智点点头，心情轻松许多。
太史局官员向皇帝禀报：“昨夜太白犯东井钺星，占曰：斧钺用。”
李隆基迷惘了：近来没有战事啊。海内升平，百姓行路万里不用带兵器的。怎么会出现这样的占卜结果？
一行趁机说：“不应在人，必应在天，也许因‘斧钺’之动，惊走‘雨师’也未可知。”
“大师以为如何呢？”皇帝问金刚智。
“老衲十岁出家，三十一岁从龙智大师皈依密教，多次祈雨成功，可这次祈雨却告不验，只能说：天意难违，缘法未到。”金刚智婉转而又语气坚定地说。一行的话使他悬着的心完全踏实了。
“罢了。”玄宗挥手回后宫去了。
六 设计救人觅镜祈雨
世上有些事真像造化戏弄人，九年前一行因厌恶太平公主而拒奉睿宗之诏，可这一年来奉诏和善无畏译《大日经》，却住在太平公主修的圣善寺里。
这一天，一行在外面办完事，刚走到寺门口，恍惚听得有人怯怯地叫：“公子！公子！”
一行回过头，看见一个白发苍苍的老太太向自己走来。出家十几年来，从没人这样叫过，这是谁呢？
“公子，我是你乳娘王妈妈啊！”老太太哭着说。
十几年不见，王妈妈竟苍老、憔悴如此。
“啊！王妈妈，快请进，快请进，您怎么知道我在这里？”一行抢步向前招呼道。
“我怎么不知道？举国谁不知道？”一行看见乳娘这副模样来找自己，必有什么大事，寺门口不好说话，就搀她进了寺里自己禅房。
坐定之后，老太太大哭起来：“你得救救我啊，我快活不成了。”
原来王妈妈儿子在家乡因抱不平打死了人，被官府捉去，秋后便要问斩。老婆子万般无奈，千里迢迢来找一行。
“大家伙儿都说：你如今在皇上面前很说得上话，你可得救救我儿子啊，他若死了，我也就活不成了。”
好容易一行才劝得她安静下来，并命手下僧人拿来许多银子和财物堆放面前。王妈妈愕然：“你这是干什么？我不是打‘秋风’来的。”
一行很为难地说：“王妈妈，您听我说，我知道您的儿子是无辜的，可这国家刑法大事，我一个和尚总不能直接出面干预吧。”
语音未落地，王妈妈把面前的钱物推落一地，指着大骂：“好个没良心的东西！你如今成个人物儿了，就睁眼不认乳娘了？你忘了吃谁的奶长大的？你忘了当年穷得没饭吃是谁周济你的？你是用这些东西来糊弄我老婆子吗？”
王妈妈走后，一行闷闷不乐，想起出家前老人家的种种关顾慈爱，辗转反侧，夜不能寐。半夜起来又拨弄自己的天文、算历那一套。算着算着，他眼睛一亮：明天夜里将出现“掩星”现象：北斗七星将被月亮和其它天体遮蔽而看不见。一行蓦然计上心来，若此计可行，也许就可以救乳娘儿子一命了。
次日清晨，宫里太监来圣善寺宣旨：皇帝召一行和尚从速进宫问事。
“大师啊，今日司天台来奏，昨天夜里北斗七星全不见了，这是怎么回事儿啊？”道教认为，星象预示国运，尤其崇拜北斗七星。重道的皇帝不能不关心。
一行马上忧心忡忡：“啊！妙见菩萨出走了，这是天象示警啊！”
“怎么说？”皇帝有些急了，前几天太白犯东井，而今北斗七星又不见了。一行又说什么“妙见菩萨”出走了。
一行条分缕析地说：“密宗认为：北斗七星就是妙见菩萨的星座。《后魏书》有记载：北魏曾失熒惑星（即火星），招致立国一百五十年后亡国，几经起落，虽然后来也曾有过东魏、西魏，每次不过一二十年光景，终于不能复国。陛下再想想：前几天在广福寺，金刚智法师祈雨七日，坛场上一切做得丝丝入扣，为何只刮风不下雨？这是天象示警啊。先是太白犯东井，而今又是妙见菩萨不安其位而出走，这警示再明显不过了。”
“朕有失德之处吧？”玄宗有些惶惑了，本朝立国才一百零一年啊。
一行自顾自说：“寻常百姓人家流离失所，不是天旱就是降霜，自古贤君英主此时往往多行德政，感动上苍，降福于国于民，就能消灾祛难，有的君王甚至惠及枯骨，埋葬饿殍，安其亡灵……”
“然则朕该如何办呢？”玄宗急急打断一行的话，他确实太怕亡国了。
“佛门以慈心降一切魔，以贫僧愚见，莫如大赦天下，以求上苍宽宥。”
“对，对，朕立即下诏，大赦天下。”
玄宗皇帝大赦天下，王妈妈的儿子也得救了，但天还是没有下雨。皇帝再次召见一行：“大师啊，大赦已毕，妙见菩萨已归原位了。怎么天还不下雨啊？”
这时已进入七月，一行心中有数：这是“气旋雨”
的形成季节。他对皇帝说：“应当在宫内找一个上面有龙形的器具，让贫僧用来祈雨。”
“好吧，你就随着总管太监到宫内库房去挑吧。”皇帝说。
一行随着总管太监在宫内库房转悠了几天，左看一件不是，右看一件不是，几乎把仓库东西都翻遍了。最后一天极闷热，总管太监满头是汗，不耐烦了：“大师，可别糊弄咱啊，这库房都让你翻遍了……”
“就是它了。”一行突然指着一面古铜镜说。那铜镜上的“铜绿”潮得像浸了水，变得更绿了。镜面也已锈得模糊，用手一摸，竟沁出水来。
“这哪儿有龙啊？”
“您仔细看看镜鼻儿，总管公公。”总管一看，果然那镜鼻儿是由两条小龙盘成的。
一行拿走铜镜，放入自己的曼陀罗坛场。一日之后，雨即大下。从此，皇帝更信任他，凡事都喜欢请教他。
此后，一行又把主要精力用于学习金刚智的密宗金刚界密法。金刚智为一行进行了更高一级的“灌顶”。
皇帝接受一行的建议，下敕请金刚智翻译密宗经典《金刚顶经》。
金刚智本是王子出身的学问僧，风度雍容，在“知天命”之年被“天子”逼上法坛，伸拳舞腿，祈“天”
降雨。“天”却掴了他一耳光，心情正黯，如今有一行一心随他学法，自然要尽心教他，而译经本是他的所长，自然也愿意拼出个面子来。
可是，不久又有官员多事，奏请把蕃僧一律遣送回国，玄宗恩准所奏。
金刚智以传法译经为重，在圣旨中钻空子说：“我是梵僧，不是蕃胡，不在圣旨规定范围内，我不管怎么也是不走的。”为了避免出现僵局，就停下译事，准备到雁门关去传教。风声传到皇帝耳里，又下诏将他留住。
七 奉旨修历造仪测地
开元九年（721）九月初一，太史局里人来人往，忙忙碌碌，但却没有什么声音，静寂中隐含着肃杀。几次“日蚀”预报不准，若照旧例，天文官的脑袋就难保了。虽然玄宗皇帝宽仁驭下，但这次若再报不准确，恐怕就不好交待。所以虽是深秋，太史监南宫说和太史大相元太的额头和鼻尖都紧张得沁出了汗珠，分头指挥手下，准备油盆，较准漏刻，准备记录簿。细心的南宫说甚至试了试毛笔和观台里墨汁是否合适。
预报的时刻终于到了，在油盆里，耀眼的太阳只显现出一个光亮的圆轮，日食情况可以清楚看到，在轸宿十八度，而预报却并非如此。南宫说和元太一头一头地出汗。
皇帝看见观测报告眉头微皱。南宫说很聪明，他这样说：“按照现行的《麟德历》预报日蚀总是不准确，请陛下指示，司天台该怎么办？”一下子把责任推到了五十六年前造《麟德历》的李淳风身上。
宰相张说便向皇帝说：“一行和尚也曾说过：《麟德历》用的时间长了，不准确了，陛下何不叫来问问，他向来对天文、历算这一套钻得很深。”
皇帝立即召见一行。一行果然说得头头是道：“古今星象一直在变，现今的星宿位置与古代不同，不光是赤道上的位置和距极度数因岁差而有差异，即黄道上的位置，也是不同的。再譬如太阳在黄道上的运动速度，也是不均匀的，冬至时最快，所以这天白昼最短，以后渐慢，到夏至时最慢，所以这天白昼最长，以后又逐渐加快。而今陛下想造新历，必先知道黄道进退，请让太史令测侯星度。”
南宫说等人回奏说：“过去总是以赤道为基准考察星象，太史局没有黄道游仪，无法测定。”
一行又说：“黄道游仪，古有其术而无其器，黄道随天运动，时刻变化，难用旧有仪器来测定，所以编修《麟德历》的李淳风等人只是限于想象，而不能制造。请陛下下诏。就在书院内用铜铁铸造，造好后就可以测度星象，不出什么差错了。”
皇帝依从建议，下令一行与梁令瓒合作。一行从善无畏处学习的“工巧”，在此大大地派上了用场。
开元十一年（723），铜铁铸造的“黄道游仪”制成。
其中二十八星宿和其它星座位置与古代历象记载不同者多达数十处。在一行和梁令瓒的大胆改进下，在黄道环和赤道环上每隔一度都打一个洞，使白道环可以在黄道环上一度就移动一下。但因传统习惯的影响——认为“岁差”是黄道沿赤道滑动造成，所以“黄道游仪”在制造时固定了赤道，而这与事实正好相反——“岁差”是赤道沿黄道滑动，但当时并未悟到这点。因之，一行不得不大量地采用实测以收取数据。
一行利用这架“黄道游仪”研究月亮的运动，研究恒星的坐标，对于修订《大衍历》，提高交食计算的准确性，发现恒星坐标因“岁差”而变化等方面都有很大的作用。
玄宗亲制铭文，将“黄道游仪”置于灵台，供一行专用，还在长安集贤院内为他专建了一座天文台——仰观台，支持他的修历工作。
位于长安崇贤坊的资圣寺里也传出了好消息。金刚智领着他的译经班子译出了《金刚顶瑜伽中略出念诵经》