由于宗教对人的思想和行为有强大的规范力，因此往往都是政治集团所热衷利用的政治工具。宗教需要得到政治上的支持，以获得一定社会上的生存空间和发展空间，因此往往也会以自己特有的方式为政治服务。政治是人们借助于社会公共权力来实现社会公共事务的管理，具体表现为对人们的思想、行为进行约束以形成特定的社会秩序。而神化的宗教正好迎合了政治统治的需要，借助于宗教，人类的社会秩序、政治制度、律法体系和道德行为更容易得到维持和巩固。在历史上的王权国家时代，很多统治者都要用宗教来神化自己的王权，形成所谓的君权神授的思想，使自己的政权更加巩固。国教是被国家的统治集团定为国家的全民信仰的宗教，它成为国家官方的思想意识，是维护统治秩序的最重要的精神支柱。基督教、伊斯兰教、佛教是三大世界宗教，在历史上都曾被不同的国家封为国教。****制度是政治和宗教结合最密切的形式，这时的君权与神权、政权与教权合二而一，国家元首和宗教领袖同为一人，政权和教权由一人执掌，国家法律以宗教教义为依据，宗教教义是处理一切国家事务的准则。
统治阶级会利用宗教来加强统治，而被统治阶级也会利用宗教来反抗统治者。历史上的许多人民起义都以宗教为组织民众的手段，如中国历史上的太平天国运动就是借助“拜上帝会”来组织众多信徒而起义的。当一个国家或民族有共同的宗教时，整个国家和全民族就因此获得了共同的信仰和共同的教义，这就能加强一个国家和民族的认同感和一体化，有助于使它在种族冲突和国际冲突中维系自己的团结和统一。但是，若一个国家或民族有不同的宗教，则可能会因不同的信仰和教义而冲突分裂。宗教对人们思想和行为的约束有可能是良性的规范，使人们获得增进的幸福，也可能会对人们构成束缚甚至是压迫。比如说，历史上很多先行的科学家就因触犯宗教的戒律而被压迫。因此，宗教在社会生活中所起的作用既可能有积极性的一面，也可能有消极性的一面。
宗教会与科学发生冲突，给人们造成灾难，但是也能够实现和谐共存，共同促进人们的幸福。科学通过观察、实践，以严谨而精确的逻辑推理来揭示事物的客观规律，获得关于世间万物的真理，使人们能够在真理的指导下生产生活以实现人生幸福。宗教则以幻想的方式来解释世界，通过相信存在着某种具有神秘力量的超自然物（即灵魂和神灵）主宰世界、决定人世命运而达成某种心灵倾向和行为规范，最终实现人生的幸福。科学追求的是真理，主要特征是严谨的逻辑求证；宗教追求的是符合某种价值规范的心灵和行为，主要特征是信仰。因此，心灵塑造和行为规范有两种达成的方法：宗教信仰、科学指导。科学是认知的范畴，而宗教是信仰的范畴。由于科学和宗教都涉及到对世间万物的解释，因此就有了科学与宗教的冲突。科学的发展实际上是人类智慧的发展，是人类的智慧进化决定了科学的进步。人类的智慧进化有两个共同推进的进程：一是生理进化上的智能结构的传承和累积；二是社会进化上的文明的传承和累积。人类的智慧进化是以传承和累积的方式由低向高发展，所以作为智慧进化的一个重要内容，科学也经历着由粗浅到深入、由片面到系统的过程。在生产力发展水平低下的社会里，人们对于事实关系的认识是零散的、模糊的、直观的、缺乏逻辑的和主观的，此时的科学缺乏理论性、精确性、抽象性、逻辑性和客观性。这时对人们来说，这世界存在着太多的未知，人们的力量显得很渺小，就很容易对未知而又强大的自然力量产生一种敬畏而更易形成宗教上的信仰，并用宗教的方式来解释世界。宗教就是用较为零散性、模糊性、虚幻性的方式来解释世间万物。
人就是有强烈好奇心的智能动物，宗教就是人们在智慧较粗浅时对世界的认识。随着智慧的不断进化，宗教作为人们早期对世界的最为重要的解释也得到不断的发展。在人类发展的早期，科学是从宗教理论中分化出来的关于大自然的认识。
首先，从宗教学中分离出哲学，再从哲学中分离出物理和化学，然后再分离出众多的社会科学和自然科学。语言、文字、绘画、舞蹈、诗歌、音乐等通过宗教的形式进行了广泛的传播，有力地促进了科学的发展。许多宗教人员也因此成为文学艺术与科学技术的发明者和创造者。随着科学技术的进一步发展，科学认识与宗教解释发生了巨大的冲突。比如说，科学认识上不相信神灵，但宗教的核心就是对神灵的信仰。布鲁诺就是因为他的科学认知触犯了宗教信仰而被烧死在罗马鲜花广场。特别是当宗教与政治结合时，出于维护宗教利益和政治统治利益，宗教政治集团更会残酷地对科学事业进行压迫。因此，在世界的科学发展史上，曾经经历过残酷的时期。所幸的是，随着宗教自身的调整并逐步脱离了政治，专注于符合现代社会价值要求的人类心灵塑造和行为上的道德规范。今天科学和宗教已经能够较好地和谐共存，科学在所有的人类活动领域继续它的真理追求，而宗教在人类心灵和行为道德的范畴内可以较好地继续保持它的神灵信仰并获得发展。科学使人们获得了强大的物质力量，而宗教使人们获得了心灵上的力量，它们以不同的方式增进人们的幸福。