第二个时期是原来守护过成陵的鄂尔多斯部于明初（约14世纪中叶）出现在蒙古草原以后，到天顺年间（1457—1464年）鄂尔多斯部进驻到今天伊克昭盟的时候，这时成吉思汗陵也随之迁来。“八白室”供奉在济农（亲王）的牙帐近旁，可能经常转移，没有一个固定场所，以在王爱召的时间较多。
第三个时期是清初顺治年间，左翼中旗的札萨克额璘臣被封为多罗郡王以后，便把“八白室”迁到了他的封地“郡王旗”内，以便自己称尊和利用祭陵活动抬高自己的地位。“八白室”所在的地方遂命名为伊金霍洛。自此以后，虽然更换过多次盟长，但成吉思汗陵的位置再未更动过，距现在已经300多年的历史了。清乾隆时起，伊克昭盟陆续准许汉族农牧民迁入，每年祭陵时还在附近举行那达慕大会。这不仅是蒙族人民的盛大节日，而且也有汉族和其他民族人民参加，观礼和贸易者络绎不绝。
成吉思汗陵园建成后又挪动过地方吗？如果挪动过，具体又到过哪里？为何原因挪动的呢？原来，1939年，随着日寇侵华的加剧，成吉思汗的灵柩曾先后迁移到甘肃省榆中县兴隆山和青海省湟中县塔尔寺。1954年，人民政府根据内蒙古人民的要求，又将成吉思汗灵柩由塔尔寺迎回伊金霍洛旗，并在这里兴建了新的陵园。多年来，成吉思汗陵园一直由专门担任守护的达尔浩特护卫着，如今是他们的35代子孙。现在每年举行四次祭祀成陵活动，特别是农历三月二十一日为传统的祭奠日期。
新修建的成吉思汗陵位于甘德尔敖包上，陵园长30公里，宽15公里，占地225平方公里，陵寝由三座蒙古包式的宏伟殿堂组成，分正殿、东殿、西殿和后殿，四殿相互连接。殿顶呈圆形，房檐都用金黄色、蓝色琉璃瓦镶嵌砌筑，显得格外辉煌壮观。
正殿高达26米。踏入殿门，大殿正中敬奉着一座5米高的成吉思汗巨大塑像。正殿是祭祀活动的中心。蒙古人民对成吉思汗十分崇拜，按蒙古族习俗，每年农历三月二十一日为春祭，五月十五日为夏祭，九月二十一日为秋祭，十月三日为冬祭。其中，春祭最为隆重。
后殿有巨大的成吉思汗灵包，上面覆盖着黄缎。成吉思汗的三位夫人的灵柩分别放在两边的灵包里。
东殿安放着成吉思汗的四子拖雷和夫人的灵柩。西殿是展厅，展出成吉思汗当年用过的遗物——“苏鲁锭”（长矛）、宝剑、马鞍等军事用品。
一代天骄的真墓在何方
几百年来，找到真正的成吉思汗陵一直是大家梦寐以求的愿望，而且许多人还付诸行动。那么，都有哪些人具体实施过这些行动呢？他们都有哪些收获呢？
2000年8月，我国考古学者在新疆北部阿勒泰山脉所在的青和县三道海附近，发现了一座人工改造的大山，推测有可能是成吉思汗的葬身陵墓。为什么如此肯定呢？原来，马可·波罗在他所著的《马可·波罗游记》中写道：在把君主的灵柩运往阿勒泰山的途中，护送的人将沿途遇到的所有人作为殉葬者。最关键的一点，此山的山势、山形与中国古代君王挑选墓地所依据的“风水术”相符。古代风水术相信“水过西东，财宝无穷”、“山环水绕，四面拱卫”、“沼止池湖，真龙憩息”等这些说法。
最近，很多人相信内蒙古鄂尔多斯高原鄂托克旗的千里山附近发现的可能是成吉思汗真正的墓地。此墓地距离鄂尔多斯市内的成吉思汗陵不足200公里。这是因为离此地几十公里处的阿尔寨石窟、百眼井、驼羔梁等遗迹是成吉思汗晚年活动的重要遗迹。在鄂托克旗阿尔巴斯苏木一马平川的草原上，突起一座数十米高的红色沙石平顶山，山上洞窟鳞次，这就是阿尔寨石窟。在该石窟东南侧的十号石窟，为成吉思汗养伤时所住。石窟前方500米以外，据说竖有成吉思汗的箭靶。在第二十八号窟中，西面墙上有一幅壁画，有人认为是“蒙古族丧葬图”，也有人认为这幅壁画应该是“成吉思汗安葬图”。在第三十一号窟内西侧壁上，亦有一幅场面宏大的壁画，为一个地位尊贵者接受众人跪拜尊崇的大家庭。画中人物繁多，极其耐人寻味。关于这幅画，不少人认为，图中所描绘的极有可能就是成吉思汗及其家族主要成员。更值得一提的是，这幅壁画中部，成吉思汗家族与密宗法王之间，蓝黑色背景之上，绘有一座赭红色平顶山，颇似阿尔寨石窟山。
无论是蒙古学者，还是俄罗斯图瓦地区的学者，只要一提起成吉思汗的墓地一事，都会不约而同地说到一个地方，那就是孛儿只斤部落的故乡，现蒙古国和俄罗斯图瓦共和国以及布里亚特共和国交界的地区。在图瓦共和国民间至今还流传着这样一个说法：在共和国中部一个日索斯诺夫卡的村庄里，安葬着一位曾跟随成吉思汗征战南北的统帅，墓碑上刻有古图瓦文字。
根据文字的介绍，这位统帅就出生在本地，他把成吉思汗的遗体运回到了自己的家乡安葬，并由乌梁海人中与成吉思汗有血缘关系的一支部族守护。最为有趣的是，在图瓦共和国的东部和中部，有不少高山环绕着的山谷，这恰好就是文字中描述的孛儿只斤部落的发源地。
更为凑巧的是，图瓦境内有一个地名，叫成吉，附近有一条河流，名叫成吉思泰加。传说中，成吉思汗曾嘱托讲图瓦语的萨满人看守自己的坟墓。时至今日，在蒙古国所有为成吉思汗举行宗教祭祀仪式的，正是这些讲图瓦语的萨满人。
除了中国和俄罗斯人外，美国人也加入到了探寻成吉思汗陵墓的大军中来了。2001年7月底，一支由美国商人莫里·克拉维茨率领的美国寻找成吉思汗真陵研究小组，在蒙古国首都乌兰巴托东北方约320公里处的巴特希热特附近，发现了不下60处未被发掘的坟墓，可惜后来证明这是一处假坟地。根据图瓦人的传说，这种假坟地在成吉思汗最后的归宿地孛儿只斤部落的故乡有许多。
到目前为止，各国考古专家关于成吉思汗墓地确切位置的圈定，比较认同四个地点：一是位于蒙古国境内的肯特山南、克鲁伦河以北的地方；二是位于蒙古国杭爱山；三是位于宁夏的六盘山；四是位于内蒙古鄂尔多斯鄂托克旗境内的千里山。至今没有发现的主要原因是元朝皇家实行的是密葬制度，即帝王陵墓的埋葬地点不立标志、不公布、不记录在案。
人们费尽心思找寻成吉思汗陵墓，还有一个重要的原因，那就是看看这个陵墓中到底会埋藏些什么。成吉思汗一生征战、一生动荡，生前的生活算不上奢华，尽管他有500多个妻妾。依照蒙古人的习俗，人死后随葬的物品都是生前常用之物，皇帝也不例外。有关史料记载，成吉思汗陵中随葬的有他生前征战用的马鞍、金酒具和美女，但是具体数量不得而知。成吉思汗生前用兵无数，元帝国百战功成，所以他的陵墓中应该有大量兵器随葬，如用过的刀剑、弓弩、铠甲等物。有学者推测，成吉思汗墓葬距离地面至少有十几丈，其内部空间应该至少可以放进一个能容纳百多人的蒙古包，而且很有可能更大。至于成吉思汗使用的独木棺，据推测其材质应该不会像明代或者清代帝王那样使用金丝楠木，而很可能是大兴安岭等地常见的松木等针叶树种。
不过这里有一个问题，那就是如果当时蒙古人就是用一棵普通巨树中间挖空，对成吉思汗进行“简葬”而没有任何陪葬物的话，那么经过近800年与大自然的亲密接触，极有可能灰飞烟灭了。当然，这只是人们的一种猜测，在没有找到真正的陵墓之前，一切都只能是一个谜。