就在北京军警于1919年6月3日、4日大肆逮捕学生的消息传到上海的同时，上海的学生也立刻行动起来，纷纷罢课，通电各省、呼吁援救北京的学生，并分头动员工业界罢工、商业界罢市。于是，1919年6月5日上午，上海的日本内外棉第三、第四、第五纱厂的五、六千名男女工人首先罢工；接着，日华纱厂，上海纱厂，商务印书馆，中华书局，祥生铁厂，还有美商、法商、华商的电车公司，沪宁铁路、杭甬铁路的工人也宣布罢工。同一天，在上海商会的发动下，各商号陆续罢市，到这一天正午十二点，华界、租界大小商店，除了几家外国人开设的洋行之外，已无一家开门营业，各家关门闭户的商店门前大贴各种爱国标语："不诛卖国贼不开市"、"要求政府夺回青岛"、"万众一心，同声呼吁，力抗汉奸，唤醒政府"……这一天，上海各界代表成立了上海商、学、工、报界联合会，对外发出通电："卖国贼存在一日，商学工界即辍业一日，誓不反顾。"
"三罢"烈火在上海燃起之后，很快就烧遍了全中国，京奉铁路唐山、京汉铁路长辛店的工人，南京、苏州、常州、无锡、淞江、镇江、宁波、杭州、汉口、长沙、芜湖、天津、济南等人相继都有工人罢工，此外、河南、江西、福建、广东、四川等省份也纷纷开展了罢课、罢市斗争。风潮激荡，震撼全国，到处都响彻了拒绝和约签字、惩办卖国贼、抵制日货的呼声……
民意难违！暴躁的"北洋之虎"段祺瑞暂时躲到了幕后、不再公开命令这个指挥那个；"段氏屁精"段芝贵不得不引咎辞去北京卫戍司令之职；曹汝霖、陆宗舆、章宗祥这三个"卖国贼"在全国的诛讨声中分别于1919年6月4日、9日再次提请辞职；各地军政大员也纷纷向中央政府进言，要求立刻罢免曹汝霖、陆宗舆、章宗祥，以平息事态……
1919年6月10日，大总统徐世昌连发三道命令，宣布罢免曹汝霖、陆宗舆、章宗祥。"交通总长曹汝霖呈请辞职，曹汝霖准免本职。""驻日本国特命全权公使章宗祥，因病呈请辞职，章宗祥准免本职。""币制局总裁陆宗舆，因病一再呈请辞职，陆宗舆准免本职。"这三道命令发布之后，全国上下，人心大快。可是，段祺瑞却偏偏跑到北海团城，看望了正躲藏在那里的曹汝霖，大骂徐世昌"忘恩负义"，还嚷嚷说"他跟我作难，竟累及你们，良心何在，岂有此理！"
鉴于段祺瑞一派对于他的不满、还有目前内政外交的失败，徐世昌于1919年6月11日，向国会参、众两院提出咨文，请求辞去大总统之职。次日--1919年6月12日，钱能训也连带提出辞去内阁总理之职。中华民国政府一下子就陷入了空前的政治危机之中。看到徐世昌、钱能训如此告饶。段祺瑞与他的心腹徐树铮真是非常得意，可是，他们也很清楚，如果此时将徐世昌与钱能训一起轰下台来，那么，在目前并无合适人选来接替徐世昌空下的大总统之位的情况下，时局会更加动荡、更加难以收拾，将会让他们自己面临更麻烦的处境。于是，在钱能训提出辞职的同一天，参议院议长李盛铎、众议院议长王揖唐就奉段祺瑞之命，来到中南海总统府，送还了徐世昌的辞呈，他们还通电全国，呼吁挽留徐世昌。然后，段祺瑞本人也亲自来到中南海总统府，将徐世昌慰留了一番，大说他将支持徐世昌的大政方针。不过，段祺瑞对于钱能训可一点都不客气，说将他轰下台来就将他轰下台来！
攻倒钱能训内阁，是徐树铮在段祺瑞面前谋划已久的，按照徐树铮的如意算盘，攻倒钱能训之后，他就能更加容易地将在钱能训内阁中担任陆军部长的"面粉世家"靳云鹏给收拾掉了。靳云鹏作为段祺瑞的部下，过去在段祺瑞面前能与徐树铮相抗衡，段祺瑞也总是利用靳云鹏来制约徐树铮。可是，近些年来，段祺瑞已越来越偏向徐树铮。靳云鹏担任钱能训内阁的陆军部总长之后，经常受到与徐树铮关系密切的财政部总长龚心湛、司法部总长朱深等人的围攻，尤其是龚心湛，动不动就在内阁会议上当众与靳云鹏争吵谩骂，而这些事闹到段祺瑞面前之后，段祺瑞却很少支持靳云鹏。就在前不久，靳云鹏又在一次内阁会议上，就各军欠饷问题与龚心湛大吵了一架，在激烈的争吵中，平时用语总是尽量谨慎的靳云鹏一时忘了忌讳，居然吵出了"督办当国"的段祺瑞编练庞大的"参战军"（边防军）所用的巨额经费的秘密来源。这个敏感事件很快就被龚心湛、徐树铮捅到了段祺瑞跟前，段祺瑞登时大怒，立刻就将靳云鹏叫了过来狠狠训斥了一顿。靳云鹏想向段祺瑞解释一番，可是，段祺瑞却什么也不听，只管气得将鼻子向左斜歪过去、指着靳云鹏大骂道："你混蛋！你吃里扒外！"靳云鹏挨了这顿大骂之后，就负气请假，躲在家里，暂避风头。看到靳云鹏如此干瘪，徐树铮一边心中暗喜，一边趁此机会，大搞攻倒钱能训内阁的活动……1919年6月13日，大总统徐世昌被迫下令照准钱能训去职，而由财政部总长龚心湛代理内阁总理一职。龚心湛之所以被推上了代理内阁总理之位，是由于徐树铮向段祺瑞极力建议的结果。可是，龚心湛在就职当天，却发表了一个声明，以显示他极不愿意主持这一"看守内阁"的态度："比者干揆（钱能训字干臣）坚辞引退，心湛迫于主座重委，辞不获己，于本日到院暂时维持，声明十日为期，务希公推贤能继任揆席，斡旋大局，是所至跂。"就在这一天，经龚心湛主持的内阁会议议决照办，中华民国政府特任徐树铮为西北筹边使、兼任西北边防军总司令。徐树铮在去年（1918年）、他三十八岁的时候就由于段祺瑞之力，被加为陆军上将衔，此时，三十九岁的他手握三个师四个旅的重兵，成为节制内蒙古、新疆、甘肃、陕西四省的封建大吏，简直公然以"西北王"自居了！这样一来，直系军阀头子--节制四川、广东、湖南、江西四省的四省经略使曹锟与奉系军阀头子--把持了辽宁、吉林、黑龙江三省军政大权的东三省巡阅使"东北王"张作霖就大为恼怒。尤其是张作霖，他觉得徐树铮从没到前线打过仗，只靠在段祺瑞耳朵边煽风拨火、挑拨使坏就得到了节制四省的势力，超过了他这个"东北王"，实在太可恶了！于是，张作霖连忙往北京发来电报，请求中华民国政府在他的部下吴俊陞、孙烈臣二人中，选择一人任为东北筹边使。徐树铮现在正忙着借段祺瑞的势力、借自己新到手的兵权大肆横行一番，哪里会将张作霖的那点子让他不疼不痒的打击举动放在心上，他只管催着他的幕僚王荫泰快点儿将"西北筹边使官制"给拟具出来，送呈大总统徐世昌和代理内阁总理龚心湛审阅。徐树铮的长子徐审义与王荫泰互为郎舅，徐审义之妻就是王荫泰之妹王荫松；因此，徐树铮吩咐王荫泰时，态度中不仅有上司的厉害、还有"徐老太爷"的威风！