回到第三间石室中，秦粟迫不及待的坐到石床上，开始打坐练气。他默默感受着一缕热气从丹田流出，这缕热气若有若无，时断时续，正是灵慧心法第一层的特征。修炼之人须不断在体内运行真气，将其逐渐壮大，积注于丹田之中。丹田之中的真气积存到一定程度时，这缕真气便会稳定下来，修炼时可明显感觉到真气在体内不间断的流动，此时方可进入到灵慧心法第二层。按照平日修炼的方法，秦粟小心翼翼的引导着微弱的真气流入手太阴肺经，流经六阴六阳共十二经络，终于足厥阴肝经，再流回手太阴肺经。循环数十次之后，这一缕真气经足三阴经流进任脉，注入丹田。接着，秦粟又让真气从丹田流出，再次经历十二经络的循环，然后回到丹田。如此反复多次，一个半时辰很快过去了。秦粟停止了用功，仔细检查丹田中蓄积的真气，并无一丝变化。这效果与他以往练功一样——数个时辰的打坐也不能让丹田之气厚实半分。他微感失望，轻叹一口气，暗想这扶枢灵玉的效用不如想象中强，看来还得苦练。当下和衣而卧，渐渐睡去。
次日清晨，秦粟匆匆洗漱，用过干粮，又开始了修炼。这一日，秦粟几乎所有时间都在石床上打坐练气，然而，及至夜幕再次降临，他还是感觉不到丹田之中的气息变化。接下来三日，依然如此。
第四日清晨，睡梦中醒来的秦粟用手轻轻抚摸着石床，暗自苦笑道，这蒙真留下的扶枢灵玉究竟有用吗？莫不是因为呆在石床中的时间太长，灵气全失？他怏怏不乐的到第二间石室取清泉洗漱。冷水浇在脸上，他脑中突然浮起一个念头，会不会扶枢灵玉并非对所有内功修炼都有助益？也许，它对修炼灵慧心法根本没用？如若蒙真不是存心戏弄后人，那扶枢灵玉至少应该对他自己传下的归虚真藏心法有帮助。想到这里，秦粟一跃而起，快步走回了第三间石室。前几日他一心想借助扶枢灵玉，将灵慧心法突破到第二层，所以根本没花时间去细读《归虚集》，此刻却是迫不及待的打开书，翻到归虚真藏篇仔细阅读。
蒙真的归虚真藏心法与灵慧心法大相庭径，对初学者不求完成十二经络的大循环，只局限于手三阴经，待手三阴经练到一定程度后，接着修炼足三阴经，继而连通任脉与六大阴脉，成阴脉海。按照《归虚集》的说法，到这一步之后，归虚真藏也就练至第四层了。此后，修炼者需练手三阳经和足三阳经六大阳脉，将真气集注于大椎穴，贯通督脉，连通督脉与六大阳脉，成阳脉海，便到了归虚真藏的第八层。最为关键的，则是第九层修炼。当体内阴脉海和阳脉海形成之后，修炼者需通长强、夹脊、玉枕三穴，连接任督二脉，完成小周天循环，将阴脉海和阳脉海的真气最终汇集壮大，成就阴阳海，此所谓“百川归海”之境界。在这一境界，修炼者体内真气空前充盈厚实，一拳一脚都挟有巨大威力。再继续深入修炼，可到第十层，谓之“练实成虚”境界，却是举重若轻，以无形克有形。十层之上，尚有第十一层和十二层，分别谓之“返朴还真”和“退藏于密”境界，其中包含的奥秘，却不是此时的秦粟能够理解的。按照书中的评注，第十层“练实成虚”及其以下，尚属武学修炼的范畴，但练至第十一层和十二层，已是接近于仙神之境，非普通人可企及。若能再突破“退藏于密”境界，便可最终到达仙神之境。然而，如何百尺竿头，再进一步，书中并无记载。
秦粟浏览完归虚真藏篇，心中又燃起了希望。他坐回到石床上，按照蒙真记述的方法开始修炼手三阴经。第一路修炼的经络是手太阴肺经。他缓缓吸气，凝神将一缕微弱真气注入中府穴，过云门、尺泽、列缺、太渊诸穴，流至少商；而后再将这一缕真气原路返回入中府穴。就在那一缕真气重新回到中府穴时，他忽然觉得身下石床传来一股莫可名状的力量，将他整个人向上微微托起。心中一动，他再次将这缕真气送入少商穴，然后重新流回中府穴，如此往复数十次，那身下上托之力渐渐增强，待到真气往复百余次时，他感到自己似乎已经脱离了床面，全靠那股奇异的力量悬浮在空中。
秦粟大感好玩，暗想，这应该便是那扶枢灵玉的功效了罢？若我这般一直练下去，岂非越飞越高？如此想着，他不断催动真气在中府和少商二穴之间流动，过不多久，他感觉到一缕凉意从丹田中突然出现，一闪而逝，然后感到中府穴一跳，原来往复流动的那缕微弱真气霎时壮大了几分。他又惊又喜，看来蒙真所言非虚，这扶枢灵玉果然非同小可，欢欣鼓舞之下，更加勤力催动真气在手太阴肺经中流转。这整整一日，秦粟不饮不食，一直练功到金乌西沉。他数十次感受到丹田中传来的凉意，手太阴肺经中的真气也不断增强，但他的身体终究只是停留在石床之上，与床面微有接触，并未如想象中那样腾空而起。一日终了，将那真气重新纳入丹田时，他微觉异样。秦粟修炼的真气源自灵慧心法，本属阳劲，可经过这一日在手太阴肺经中的成长后，却微微带上阴寒之意。他略一思索，想起归虚真藏篇中的记载：“阴脉海生阴力；阳脉海发阳劲。任督通，阴阳济。百川归海，周天乃成。”看来，按《归虚集》之法修炼，原本体内的真气难免被炼化，去成就归虚真藏。念及此处，秦粟心中略觉难过。他体内灵慧真气虽浅，却是他数年修炼的成果，如今即将转化为另一种真气，终究有些不舍。可惜，这扶枢灵玉只助修炼归虚真藏，对灵慧心法全然无用。思来想去，也只有割舍灵慧心法了。