正月，纪晓岚迁礼部尚书、充经筵讲官。
五月，高宗驻跸避暑山庄时发现文津阁所贮《四库全书》错误甚多，令随从大臣详校，并令在京大臣校阅文渊、文源二阁书。
纪晓岚被罚令陪写，并校文津阁所贮《四库全书》，冬，校书至避暑山庄。
十二月，改定乡会试条例。
是年，清廷继续镇压林爽文起义，并派福康安总统其事。
乾隆五十三年戊申1788年
正月，台湾林爽文起义失败，清在台推行残酷镇压政策。
三月，申禁考试舞弊。
六月，安南内乱，国王黎维祁求救，命两广总督孙士毅筹办安南事。至十二月攻入东京，恢复安南局势。
七月，廓尔喀巴勒布侵入西藏，驻藏大臣率军抵抗。湖南耒阳县增生贺世盛作《笃国策》指斥开捐之事被杀。
十月，许词臣及士子赴翰林院抄阅《四库全书》底本。
是年，纪晓岚获赐紫禁城骑马，充武会试正考官。秋，以校勘《四库全书》至避暑山庄。
乾隆五十四年已酉1789年
是年正月，安南再次内乱，至十月封郑光平为国王而定。廓尔喀巴勒布再次入侵西藏，至三月始定，七月，遣使内附。
是年夏，纪晓岚以校勘《四库全书》再至避暑山庄，并撰成《滦阳消夏录》六卷。
乾隆五十五年庚戌1790年
正月，因高宗寿庆，普免天下钱粮。重刻石鼓文并置国子监及热河文庙。
二月，高宗东巡山东，四月返回。
八月，高宗弘历八十寿辰，举行隆重庆典，穷极奢侈。纪晓岚则写下了大量歌功颂德的逢迎文字，特别是骈体文《祝厘茂典记》，洋洋洒洒，全面歌颂了乾隆皇帝统治的五十五年创下的文治武功，简直是功盖三皇，圣比尧舜，很受乾隆赏识。
十一月，内阁学士尹壮图参劾各地督抚逢迎上司勒派亏空、吏治废弛等状，触怒乾隆，令其指实并往各地查勘，结果，因各地官员挪移弥补并未查出亏空，尹壮图被革职。
乾隆五十六年辛亥1791年
八月，廓尔喀侵后藏，占扎什伦布等地大掠。九月，以西藏行使廓尔喀钱，令开炉铸钱并禁外币。十一月，命福康安赴西藏督师击廓尔喀。十二月，规定西藏事务由驻藏大臣会同达赖喇嘛商议办理，禁噶布伦专擅。
是年正月，刘墉由左都御史为礼部尚书，纪晓岚则补为左都御史。四月二十五日，爱妾沈明轩去世。七月，成《如是我闻》四卷。十一月，乾隆令刻蒋衡所呈手书《十三经》于石，置国子监，并亲为之序，并令嵇璜、纪晓岚校阅，纪晓岚有《恩赐御制石刻蒋衡书十三经于辟雍序墨本恭谢折子》。
乾隆五十七年壬子1792年
是年七月，廓尔喀请降，送还前掠扎什伦布之物，清军撤出廓尔喀。九月，颁金奔巴瓶于西藏。十月，高宗作“十全武功记”。十一月，弛贫民出关就食之禁。
是年三月，纪晓岚获好友刘墉赠黻文砚一方，刘墉记载：“晓岚爱余黻文砚，因赠之，而书以铭曰：‘石理缜密石骨刚，赠都御史写奏章，此翁此砚真相当。壬子二月，石庵’。”四月，以校勘《四库全书》再至避暑山庄，并撰成《槐西杂志》四卷。八月，再为礼部尚书。
乾隆五十八年癸丑1793年
正月，定西藏善后章程，封安南国世子阮光缵为国王。
二月，定西藏与廓尔喀互市规程。
三月，改定达赖、班禅及大呼图克图呼毕勒汗选择用金奔巴瓶抽签法；并于北京雍和宫别颁金奔巴瓶供蒙古各地大呼图克图推择之用。
八月，英国所派马嘎尔尼使团到达北京，并到热河行宫觐见乾隆，提出开埠、租地、减税、驻使等项要求。乾隆派人热情接待，但断然拒绝其要求。所发敕书表明“天朝物产丰盛，无所不有，原不藉外夷货物以通有无”，“天朝尺土，俱归版籍，疆址森然，即岛屿沙洲亦划界分疆，各有专属”的态度。
是年，纪晓岚仍在礼部尚书任。五月，再题桐荫观弈图。七月，《故妄听之》四卷成。
乾隆五十九年甲寅1794年
六月，查禁小钱，命云南贵州停止铸钱。令各省督抚裁革州县衙役。
八月，禁盐官勒派商人供应饭食银及杂费银。以金川旷地给降番耕种，免赋税。
四川大宁谢天绣、湖北竹溪王占魁、陈金玉以传习“邪教”被捕，起解途中被教徒劫走陈金玉，又捕得教首刘松，供出太和刘之协，于是令各省穷搜。十一月，因刘之协被捕后在河南脱逃，革巡抚穆和兰职。
是年，纪晓岚仍在礼部尚书任。二月，乾隆巡幸天津观水围之戏，蠲免所经直隶等地钱粮，并筹划该地赈济，纪晓岚因有恭谢折子(文集卷五)。五月，乾隆因旱祈雨，礼部举行迟误，纪晓岚和相关官员德明、铁保、刘权之、刘耀云等被罚俸二年。
乾隆六十年乙卯1795年
正月，贵州松桃苗民石柳邓、湖南永绥苗民石三保等起义，二月，清廷派云贵总督福康安、四川总督和琳会同湖广督抚率兵镇压苗民起义。
三月，台湾陈周全起义，
旋失败。
六月，命福建浙江会剿洋盗。福建亏空案发，总督伍拉纳、巡抚浦霖被斩，道府州县官获罪者甚多。
是年，纪晓岚仍在礼部尚书任。四月兼署左都御史。元配马氏去世。九月，高宗公开皇十五子永琰为皇太子，于明年元旦为皇帝，改元嘉庆，并轮免各省钱粮。纪晓岚主持禅让大典的筹备礼仪。
嘉庆元年丙辰1796年
正月，高宗弘历退位为太上皇，仁宗永琰继位，铸嘉庆通宝钱。白莲教徒聂人杰等于湖北枝江、宜都起义，清军前往镇压。二月，聂人杰被俘死，姚之富等继续斗争。
六月，苗民首领石三保被俘。查禁新疆产金之地，勿令聚众生事。十一月，苗民首领石柳邓被俘死。
是年，纪晓岚仍在礼部尚书任上。正月，参加高宗禅让大典。四月，为会试正考官，录得门生陈鹤、汪德钺、龚自珍父龚丽正等人，并作《丙辰会试录序》等文。六月，调兵部尚书。秋，阅兵什刹海。十月，调为左都御史。补缺大学士而不得，并与刘墉、彭元瑞一起受到乾隆的申斥。
嘉庆二年丁已1797年
五月，因安南官兵参与海洋劫掠，海盗盛行，谕安南国王协辑洋盗。贵州南笼府仲苗起事，逾七月失败。嘉庆侍高宗秋狝木兰。七月，洋盗首领林发枝投降。
是年，白莲教起义军在王廷诏、姚之富、齐王氏率领下转战河南、陕西、四川，开始大规模的流动作战。
本年，大学士阿桂、着名学者阮沅、王鸣盛、袁枚去世。
春，纪晓岚在左都御史任上。八月，转为礼部尚书，为嘉庆诠释《洛神赋》，有覆奏折子。
嘉庆三年戊午1898年
二月，清军将领明亮因镇压起义军不力而革职治罪。五月，白莲教首领齐王氏、姚之富等战死。八月，白莲教重要首领王三槐被俘，解京磔死。江西宁都教民起义，旋失败。
是年，纪晓岚仍在礼部尚书任上。五月，嘉庆侍高宗秋狝木兰，纪晓岚扈从滦阳，七月成《滦阳消夏续录》六卷。
嘉庆四年已未1799年
正月初三，乾隆帝死于养心殿(有说为乾清宫，误，此据实录及清鉴)。次日，褫和珅军机大臣、九门提督等职，命与福康安昼夜守直殡殿，旋下狱赐死，其党羽贬降有差。命勒保总统攻白莲教军事。二月，弛叶尔羌、和阗玉私售之禁。三月，自莲教首领冷天禄战死。
是月，朝鲜书状官徐有闻进闻见别单称：“和珅专权数十年，内外诸臣，无不趋走，惟王杰、董诰、朱珪、纪昀、铁保、玉保等诸人，终不依附。及珅败后，其党与干连之人，虽不查治，而若其依仗，专在于王杰等。”
四月，前因揭发各省亏空而削职之内阁学士尹壮图，再因揭发陋规一事被婉辞归里。
七月，白莲教首领包正洪战死，八月，龚文玉、卜三聘被俘。清军统帅勒保被革职代以额勒登保。八月，翰林院编修洪亮吉上书指斥时政，以大不敬免死充军伊犁。十月，命各省实力编查保甲。
是年，纪晓岚仍在礼部尚书任上。