中宗没有继承武则天的开明之风，登基以后成了一个不理朝政的昏庸皇帝。皇后韦氏和武则天的侄子武三思掌握了朝政大权。因此，宋璟又与武三思展开了一声场激烈的斗争。
中宗继位不久，京兆人韦月向中宗告发武三思"秽乱宫掖"之罪，中宗大怒，下令处斩韦月。
宋璟以案情不实为由，请中宗将韦月下狱关押。中宗怒道："朕已下令处斩，你为什么要阻拦？"
宋璟答道："韦月状告韦后与三思私通，陛下应进行审问以后再处斩，这样就不会有人私下议论了。"
中宗大怒，宋璟平静地说道："陛下只有将臣斩首，臣才能奉诏。"中宗无法将韦月处以极刑，就将他发配到了岭南。
不久，中宗在韦后等人的挑唆下，将宋璟贬到武三思的封地贝州当刺史。宋璟到达贝州以后，看到当地暴雨成灾，百姓们生活苦不堪言，武三思却不顾他们的死活，向封户强征租税。宋璟出于对百姓的爱护，支持他们抗交租税。手握朝政大权的武三思于是将宋璟一贬再贬。
当时，韦后与武三思狼狈为奸，掌握朝政大权。韦后一心想将不是她亲生的太子李重俊废掉，改立自己所生的安乐公主为皇太女。忍无可忍的李重俊发动政变，杀死了武三思。但是，昏庸的中宗却听信韦后与安乐公主的一面之词，出兵平息了李重俊的政变，李重俊兵败以后被杀身亡。
从此以后，韦后与安乐公主在朝中更加有恃无恐。不久，一心想成为女皇的韦后与安乐公主合谋毒死了中宗。就在韦后认为自己要实现女皇梦的时候，李隆基与太平公主发动政变，将她和安乐公主杀死。相王李旦复位，史称睿宗。
睿宗封宋璟为检校吏部尚书、同中书门下平章事，宋璟再次成为宰相。宋璟与姚崇同心协力，改革朝中的弊政。
中宗时期，外戚与太平公主干预朝政，朝中政治腐败，官吏贪污成风，卖官鬻爵四起，滥封滥赏，很多不法之徒通过贿赂成为了官吏，而那些忠正的人却被陷害除名。面对这样的情景，宋璟非常头疼，在对官员的取舍问题上尽力做到公正平允，于是，很多不称职的官员被罢免。
睿宗登基以后，太平公主因拥立睿宗复位有功，公主党的势力不断扩大，严重威胁了太子李隆基的地位。
一天，太平公主邀集宰相们商议更换太子李隆基一事，所有的人均惊慌失色，只有宋璟镇定自若地说道："太子有功于天下，完全可以成为一个社稷之王，公主为什么会有此议！"
为了确保太子的地位和势力，宋璟和姚崇向睿宗提出了三条对策。第一是命宋王李成器、幽王李守礼到外地担任刺史。第二是让太子掌管岐王李隆范和薛王李隆业所统领的羽林军。第三是将太平公主夫妇迁到东都居住。
李睿最终采纳了宋璟的三条意见，命太子监国。
太平公主不甘心就此失败，她鼓动官僚们反对太子李隆基。太子李隆基为了自保，违心地向睿宗上奏说，宋璟离间皇族之间的关系。睿宗下令将宋璟贬为楚州刺史。
此时，睿宗主动让位于太子李隆基，史称李隆基为玄宗。玄宗继位以后，太平公主的势力严重威胁到了他的安全。不久，有人告发太平公主准备发动政变。玄宗决定先发制人，歼灭太平公主的党羽，赐死太平公主。