经过3天的激烈争夺，12月23日，俄选举委员会公布杜马选举的最后结果，宣布：19日举行的杜马选举合法有效，62%的选民参加了投票，选出了国家杜马450个席位中的440个，6个党派获得了5%以上选票，得以进入杜马。成立仅两个多月的"团结联盟"得票率为23.32％，比俄共仅少一个百分点，加上单名制选区获得的10个席位，共获得74个议席，一跃成为杜马中第二大议会党团。
这一结果无疑给叶利钦和普京吃下了一颗定心丸，整个克里姆林宫充满了喜庆的气氛。选举结束后，叶利钦总统把这一结果称为"真实地表现了人民的意愿"。普京也高兴地说，俄罗斯最终"踏上了稳定的道路"。
新世纪新面孔
1999年12月31日，在距新千年钟声敲响还有12小时的时候，从克里姆林宫传来一声惊雷，叶利钦向全国发表电视讲话。68岁的叶利钦脸色显得有些苍白，他缓慢而庄重地说："今天，我最后一次作为俄罗斯总统向你们发表讲话。我已经决定，在即将过去的一个世纪的最后一天辞去总统职务……根据宪法，我在决定辞职时签署了把俄罗斯总统职权交给政府总理普京的命令。在未来3个月时间里他将是国家元首，3个月之后将举行总统选举。"
叶利钦在解释自己的决定时说："俄罗斯应该由有智慧、精力充沛的新政治家带入新世纪，而我已经执政多年，应该引退。当看到人们怀着极大的希望和信念在杜马选举中投新一代政治家的票时，我明白了，我已完成一生中主要的事业，现在俄罗斯永远不会回到过去，将永远前进，我不应妨碍这一自然的历史进程。"
叶利钦声明，他不是因为健康原因而辞职的，他之所以辞职是因为他已经做了所能做的一切。他说："接替我的人是新一代人，是能够做得更多、更好的一代人。"
叶利钦说："俄罗斯已有一个强有力的人物，有了一个准备做总统的强人。今天几乎所有的俄罗斯人都把自己的希望寄托在他的身上。在这种情况下，我为什么还要执政半年？为什么要妨碍他，还要等半年呢？不，这不合我意，这不是我的性格。"
随后，叶利钦把一支派克金笔、一个控制核武器的密码箱连同1700万平方公里的领土和1.45亿人口的大国，交给代总统普京。叶利钦说了句"要珍爱俄罗斯"，便转身离开克里姆林宫。
叶利钦以这种出人意料的方式退出了政治舞台，将俄罗斯的希望、俄罗斯的未来寄托在这个性格坚定、目光坚毅的小个子身上。
普京深知自己肩上的重任，他马上约见俄罗斯国防部部长谢尔盖耶夫，随后又分别召见了俄联邦安全局局长帕特鲁舍夫、内务部部长鲁沙伊洛、紧急情况部部长绍伊古，与他们举行了会谈，商讨俄罗斯当前存在的一系列迫切问题。
在与几位主要人物会谈以后，普京又紧急召开安全扩大会议，讨论叶利钦辞职后的俄罗斯局势。
散会之后，普京又匆匆赶到政府大厦，召开了5分钟的政府紧急会议。他对出席会议的部长级以上官员们说，由于总统竞选将提前举行，3个月后将举行大选，所以政府的工作将更加紧张，大选将给政府增加额外的负担。他告诫大家，政府不得卷入任何政治活动，所有政府工作人员应该更加紧张地工作，以确保俄罗斯政府正常运转。
1999年12月31日午夜，克里姆林宫救世主钟楼上钟声敲响时，普京出现在电视机上，向全体俄罗斯人发表新年贺词：
今天，在新年之夜，我同你们一样，同亲人和朋友聚在一起。准备聆听俄罗斯总统鲍里斯·叶利钦的新年贺词。但情况却发生了变化。今天，1999年12月31日，俄罗斯首任总统宣布辞职。他请我向全国发表讲话。
亲爱的俄罗斯人，亲爱的同胞们：
今天，我受任代理国家元首的职务。3个月后将选举俄罗斯总统。我要请人们注意，国家将不会有一分钟的权力真空，过去没有，将来也不会有。我想告诫大家，任何超越俄罗斯法律、超越俄罗斯宪法的企图都将被坚决制止。言论自由、信仰自由、舆论自由、个人权利--这些文明社会的基本因素都将得到国家的可靠维护。武装力量、联邦边防部队、维持秩序的机关将按原来的正常状态开展各自的工作。国家过去保卫、今后仍将保卫我们每个人的安全。
总统完全根据国家宪法作出了移交权力的决定。只能过一段时间以后才能恰如其分地评价这个人为俄罗斯所做的许多工作。尽管今天已经清楚，俄罗斯走上了民主和改革的道路，没有离开这条道路，可以宣布自己是一个强大的独立国家，这都是他的伟大功劳。
我想祝愿俄罗斯首任总统鲍里斯·叶利钦身体健康，生活幸福！
新年是俄罗斯最光明、最美好、最喜爱的节日。大家都知道，新年将实现许多愿望，而在这个非同寻常的新一年里，这种愿望更多一些。你们所有美好的愿望一定会实现。
亲爱的朋友们，离2000年只剩下几秒钟的时间了。让我们向亲人和朋友露出笑脸，彼此发出热烈、幸福、友爱的祝愿。让我们为了俄罗斯的新世纪，为了我们每个家庭的爱与和睦，为了我们父母和孩子的健康，干杯！
祝你们新年好，新世纪好！
战火中驾机视察车臣
1999年12月31日午夜，正在俄罗斯民众收看代总统普京的新年贺词时，普京已经和夫人柳德米拉飞到战火纷飞的车臣去慰问正在那里浴血奋战的俄军官兵。
那天普京及夫人一行分乘3架直升飞机前往车臣第二大城市古杰尔梅斯。当天由于能见度极低，飞机无法着陆。普京一行只好调头往回飞，然后再换乘汽车前往目的地。汽车在弹坑累累的路上颠簸了两个多小时。当普京和夫人出现在战士们面前时，他们简直不敢相信这是真的。
此时的普京身着带风帽的翻领滑雪运动服，神采奕奕，他向在车臣战争中英勇作战、表现突出的官兵颁发了奖章，同时将刻有"俄罗斯总理敬赠"字样的猎刀赠送给官兵们。随行的俄罗斯歌舞团为官兵进行了慰问演出。
在车臣首府格罗兹尼附近的一个小镇上，普京对军官和士兵发表讲话，他的妻子站在他的身旁。普京说："我想让你们知道，俄国对你们的所作所为表示高度赞赏。""这不只是一个恢复俄国荣誉和尊严的问题。更重要的是，它事关扼制、结束分裂俄联邦的企图，这是主要任务。俄国感谢你们。""我祝愿你们新年快乐，祝你们幸福健康、家庭美满。"
普京一行与官兵们共度了一个多小时，然后返回。两小时后，他们乘车刚刚经过的那条公路就被炸毁了。
普京对车臣战场的视察和慰问，极大地鼓舞了俄联邦军队的士气。2月6日受到普京亲自嘉奖的部队一鼓作气攻克了车臣首府格罗兹尼。
2月19日夜，普京的恩师、圣彼得堡市的首任市长、此次总统竞选工作的助手索布恰克在加里宁格勒停止了呼吸。21日，索布恰克的遗体被运回圣彼得堡市。市政府准备于24日以首任市长的规格在著名的亚历山大-涅瓦公墓为索布恰克举行隆重的安葬仪式。这个公墓安息着在车臣牺牲的俄罗斯英雄，1999年被暗杀的国家杜马议员，沙皇时期的政界、军界、文学界名人等。普京决定参加这个葬礼。然而，23日中午，俄罗斯RTR国家电视台传出了"车臣恐怖分子准备在葬礼上暗杀代总统普京！"的消息。
原来车臣匪徒头目巴萨耶夫得知普京将要参加索布恰克葬礼的消息后，便通过互联网向散落在俄罗斯各地的车臣恐怖分子发出对普京的"追杀令"，声称："罪犯普京被判处死刑。车臣人的血债要用普京的血来偿还。""追杀令"还注明了暗杀成功后用来联络的电子信箱和传真号码，还声称暗杀者可以用阿拉伯语、英语和俄语联系，以便成功后领取赏金250万美元。
由于时间紧迫，圣彼得堡市和莫斯科警方、安全局、内务部同时行动，根据早已掌握的线索顺藤摸瓜，一举捕获了绝大多数阴谋参加者。同时俄全国各地进入了高度戒备状态。为了防止其他车臣杀手潜入莫斯科和圣彼得堡，俄罗斯下令紧急关闭所有的车臣边境。