1933年，民主党总统候选人富兰克林·罗斯福入主白宫。罗斯福就任总统时，正值经济大萧条的风暴席卷美国的时候，到处是失业、破产、倒闭、暴跌，美国人民的痛苦、恐惧和绝望超过以往任何时候。面对这种形势，罗斯福毫不畏惧，在宣誓就职时，发表了一篇富有激情的演说，他告诉人们：“我们唯一害怕的就是害怕本身。”在1933年3月4日那个阴冷的下午，新总统的决心和轻松愉快的乐观态度，“点燃了举国同心同德的新精神之火”。他提出：“我们这个伟大的国家将会像过去那样生存下去，将会复兴和繁荣起来。”在这样的信念下，罗斯福开始了他的“新政”。
随后的3个月内，罗斯福先后向国会提出了70多个法案，以对付严重的经济危机。国会则以惊人的速度先后通过《紧急银行法》、《联邦紧急救济法》、《农业调整法》、《全国工业复兴法》、《全国劳工关系法》、《田纳西河流域管理法》等。
反垄断依然是美国社会最为关心的话题，在这一点上，罗斯福总统和国会都态度坚决。国会参议院的调查委员会对摩根财团进行了多次听证调查，认定它属于《反托拉斯法》的打击对象。1933年，参议员皮考拉发起一场对摩根家族垄断经营的调查。
国会经过认真的调查发现，杰克·摩根和他的那些大资本家合伙人都在以各种方式逃税，参议院调查委员会为此专门举行了听证会，得出的结论是，今后的美国经济中不能再允许出现像摩根家族这样势力巨大的公司，不能再允许像朱尼厄斯、皮尔庞特和杰克那样的垄断私人银行家在美国的经济界呼风唤雨。于是，从30年代中期开始，一系列针对银行业垄断的法规陆续出台。前述的《农业调整法》和《全国工业复兴法》这两部法律制定了商业主体应遵守的“公平竞争”规则，定出各企业生产的规模、价格、销售范围，从而限制了垄断。
1933年6月16日，《格拉斯-斯蒂格尔法》颁布，此法案又称《1933年银行法》，规定建立由联邦承担责任的联邦储备体系，并且规定所有国家银行和联邦储备银行都不允许同股票经纪机构有任何联系。商业银行不允许从事投资银行业务。这意味着，现有的J.P.摩根公司是非法的，它必须变成一个单纯的商业银行，只从事存款和贷款业务，或是变成一个专门发行股票债券的投资公司，不能在这两个赚钱的领域里横行霸道。《格拉斯-斯蒂格尔法》还规定，投资银行家不能在商业银行的董事会中任职。该法案还对证券发行、阻止代理客户经营中的欺骗以及风险性投资等作了规定。
按照新的银行法，J.P.摩根公司面临着解体。
在无力回天的形势下，杰克无奈作出决定，J.P.摩根公司改组为商业银行，设立一家新的公司，就是今天我们仍然非常熟悉的摩根-士丹利公司，这个公司承办原来的投资银行业务。摩根-士丹利公司由杰克的儿子亨利·摩根和哈罗德·士丹利经营，这个公司很快成为美国最大的投资银行之一。
这一年，杰克就把公司总裁的位子让给了托马斯·拉蒙特，然后到南方去度假了。从1934年开始，67岁的杰克渐渐地从美国金融舞台上消失了。
金钱本身并不坏
从美国开始的经济危机迅速蔓延到整个资本主义世界，工人持续进行罢工斗争，生产下降，社会动荡，仅在1933年美国的罢工人数就达146万人，1930年法国发生了1700次罢工斗争，德国、英国的罢工运动也处于高涨状态。
经济危机促使各个主要资本主义国家纷纷寻找出路，美国通过罗斯福新政使经济走上复苏的道路，但是这种复苏的脚步显然还是太慢了，英国、法国也采取一些有力措施阻止危机的蔓延和加深。另一方面，德国、意大利、日本等国则走上了经济军事化的道路，到30年代末期，欧洲法西斯主义崛起，第二次世界大战的幽灵在全世界范围内徘徊。
1939年9月1日，法西斯德国按照经过长期准备的侵略计划，向波兰发动突然袭击。凌晨4时45分，德国出动大批飞机轰炸了波兰的军事设施、机场、城市，然后，德军56个师150万人，从西、南、北三路向波兰边境全线发动了猛烈的进攻。
9月3日，英国、法国分别对德国宣战，第二次世界大战爆发了。
战争的爆发，纽约股市突然兴旺起来，进入两年来空前的繁荣，债券市场的交易量也达到了创纪录的水平。原因也许是人们还记得第一次世界大战的时候，那场战争使美国经济迅速发展起来，由债务国一跃而成为债权国，美国的商人们再一次激动起来，大量的军事生产可以刺激经济的进一步稳固复苏。
但是，对于摩根家族来说，这次大战不同于第一次世界大战。由于连续的政府听证会和对其在第一次世界大战中发战争横财的指责，J.P.摩根公司向英、法、美政府表示，它将不再从事它在第一次世界大战时为盟国采购军需和筹措资金的生意。
而杰克也进入老年了，他常常受到一些疾病的困扰。他开始考虑自己的后事，特别是财产的处理，他的祖先一踏上美洲的土地，就很明智地处理他们的财产，既解决自己后代的生存问题，又不违反国家的有关法律，当然也巧妙地避免了缴纳更多的遗产税。现在，在杰克的晚年，美国的遗产税税率非常高。1938年，对5000万元的遗产税的征税额达2800万美元，几乎是原值的一半。到1944年税率更高。
为此，杰克开始清理不动产，以便可以随时变卖。其实，杰克本人对金钱有着自己特别的认识。有一次，他和老搭档拉蒙特谈起这个问题。
拉蒙特苦笑地说：“金钱是万恶之源啊。”
杰克挺愉快地回答：“不，汤姆，金钱本身并不坏。我认为，对金钱的热爱才是万恶之源。”
是的，金钱并不是什么坏东西。至少它是一种交换的媒介，假如没有金钱，人们将怎样进行经济领域的活动呢？更重要的是，金钱可以做坏事，也可以做好事，关键在于用之有道，金钱除了满足基本生活花费外，还可用于慈善等事业。洛克菲勒家族，通过赠给金钱，给成千上万的人带来了幸福。杰克的父亲也曾经做过大量的慈善捐赠，杰克自己不是也一直在关注公益的事情吗？
1940年7月16日，希特勒发出了关于制订对英国实施登陆战役的第16号指令，代号为“海狮计划”，希特勒叫嚷着要“清除英国本土对德作战的基地，并且在必要时，全部予以占领”。英国是老牌海军强国，德国不是对手，但德国的空军力量不论在质、还是量的方面都胜过英国，因此，德国计划对英国发动空中“闪电战”，以消灭英国空军，夺取制空权，把英国海军赶出英吉利海峡，为入侵英国扫清道路。
从1940年8月9日开始，德国每天出动数百架次甚至上千架次飞机，对英吉利海峡的英国护航队和英国的重要城市、港口、铁路、桥梁、机场及其他军事设施进行猛烈轰炸。从13日开始，空中袭击的规模进一步升级。
仅在空袭的头三个月里，德国就投下10000多吨炸弹，炸死居民12600多人，受伤和无家可归者不计其数。
作为英国的首都伦敦更是遭到法西斯德国的残酷空袭。当惊恐万状的孩子们被从伦敦疏散出来时，摩根公司义不容辞地承担了责任。
杰克拖着老迈而疲弱的身躯，亲自到码头迎接那些英国孩子，他把这大约四百名“战争客人”接到自己在长岛的别墅安顿下来，让孩子们在和平环境下生存下来，并得到很好的照顾。
第二次世界大战期间。J.P.摩根公司还从事过很多类似的救助项目，帮助过不少处于战争中无助的人们，为此英国政府给予特别嘉奖。
当英国遭到法西斯最猛烈的轰击的时候，杰克从来也没有对英国失去信心，1940年6月14日，德军兵不血刃就占领了法国首都巴黎。6月20日，欧洲陆军强国法国宣布投降德国。当法国宣布投降时，一个英国朋友在华尔街对杰克说，他担心下一个投降的将是英国，杰克情绪激动地从椅子上站起来说：“亲爱的朋友，你一刻也用不着灰心。
我告诉你，英国永远也不会投降，永远不会投降，不会！不会！永远不会！”怀着对英国的热爱，他在战时尽自己最大的努力帮助这个饱受战争摧残的国家的人们。
晚年的时候，杰克同罗斯福总统的关系也有了缓和。罗斯福总统一上台就制定了一系列反垄断的法律，矛头直接对准了摩根这样的大垄断公司，杰克对罗斯福总统也怀着一些怨气。随着时间的推移，很多事情已经过去了，杰克也意识到他一个人不可能阻止国家行为，他只有接受，并且努力遵守国家法律。