肥料化技术是将畜粪和垫草、秸秆、稻壳等固体有机废弃物按一定比例堆积起来，调节堆肥物料中的碳、氮比，控制适当水分、温度、氧气与酸碱度，在微生物的作用下，进行生物化学反应而将废弃物中复杂的不稳定的有机成分加以分解，并转换为简单的稳定的有机物质成分。新鲜或未腐熟畜禽粪便如果直接长期施用于土壤会引起不良后果，堆肥化过程中应让有机物充分腐熟，杀死其中的有害微生物，使它转变为安全、稳定的高品质有机质肥料。一般堆肥腐熟的目的如下：
（1）调整有机物碳氮比。当堆肥材料的碳氮比大，若直接施用于土壤中，在堆肥材料分解初期会造成土壤中有效养分减少，尤其是氮素成分的影响最大，而阻碍了作物生长；当堆肥材料碳氮比过小，直接施用土壤中，产生土壤还原性物质和氮磷的富营养化，从而影响作物的生长。堆肥材料经堆积分解，堆肥材料达到稳定腐熟，即可直接施入土壤。畜禽粪便中的碳氮比一般比较小，因而常常需要另外加入适当的碳源物质（如稻草、玉米秸秆等），以增加整个堆肥的碳氮比。
（2）减少有害成分。畜禽粪便和其他有机物含有糖类、脂肪酸、蛋白质等成分。当微生物分解时会产生高温及局部的缺氧情况，厌氧微生物大量繁殖，有机物分解会产生甲烷、氢气、酚酸、有机酸等有毒物质和土壤还原性物质，对作物生长有害。畜禽粪便若经过堆积腐熟分解可减少有害成分，避免直接施用影响作物生长。
（3）消灭病菌、虫卵、杂草种子。畜禽粪便里面含有许多病原菌、害虫虫卵及杂草种子，堆肥如经适当发酵，温度可达到60℃以上，大部分的病原菌、害虫虫卵及杂草种子在这个温度下可被杀灭。
（4）减少臭味，维护田间卫生。经过适当堆积腐熟的堆肥会降低令人不快的臭味，在田间施用时也可减少蚊蝇滋生，维护环境卫生。
（5）调配堆肥成分，增进肥效。禽畜粪便和其他有机材料所含营养成分差异较大，经过适当的调配，堆积腐熟后可增加有机材料的有效磷与氮素，制成的堆肥成分能适合不同作物生长的需要，可增进作物产量及品质。