沼气池厌氧发酵除了产生气体——沼气以外，沼气池在厌氧发酵制取沼气的过程中所产生形成的液体，统称为沼液，俗称“沼气发酵水”。沼液含有水溶性的多种营养成分，不仅含有较丰富的可溶性无机盐类如氨和铵盐，同时还含有多种沼气发酵的生化产物——吲哚乙酸、赤霉素等物质，是一种速效的肥料。
（1）沼液作为基肥。长期使用沼液作为基肥对改善土壤的理化特性起着积极的作用，能够提高农产品的质量和产量，降低农业生产的投入。用沼液浇灌果树，所结的果大、色鲜，味道鲜美，甜味好；用其肥田，则水稻生长强健，挺拔翠绿，分蘖多，苗高且根系粗壮发达、白根多，有效穗、穗粒数、结实率都有所提高。
（2）沼液作为追肥。用沼液追肥十分方便，在干旱地区，用其泼浇农作物，既能满足作物对水分的需要，又能供给多种营养元素，促进作物生长，增加作物产量，增强作物抗病能力。在施肥量相等，栽培条件基本一致的情况下，施用沼气肥的农作物产量比施用普通粪肥的农作物要高，而且使用沼气肥还可减少病虫害的发生。
沼液经过充分腐熟发酵，其富含多种作物所需营养物质，宜作根外施肥，效果比化肥好。特别是当农作物以及果树进入花期、孕穗期、灌浆期、果实膨大期，喷施效果明显，对水稻、小麦、蔬菜、果树都具有增产作用。沼液可单施，也可与化肥、农药、生长剂混合施。特别是施用于果树上，具有利于花芽分化、保花保果、果实增重快、光泽度好、成熟一致、商品果率提高等优点。