二十五年，皇上为太子选择辅导大臣，朝臣中有推荐汤斌的。皇帝下诏说：“自古帝王教育太子，一定要挑选谨严、恭敬的大臣，统领僚属，以专门辅佐协助太子。汤斌在任翰林院讲官时，一向是行为谨慎，这是我深知的。选任巡抚以后，廉洁对已以率领属下，并实心办事，的确应该提拔，用来感化在位者。”于是授汤斌为礼部尚书，管詹事府事。汤斌要赴京时，苏州百姓哭泣挽留未成，停市三天，满街巷烧香为他送行。原先，靳辅与按察使于成龙争论黄河下游治理事，长时间没有解决。朝臣为迎合明珠的想法，大都推崇靳辅。皇上曾令尚书萨穆哈、穆成额会同汤斌一起调查拿出意见，汤斌主张疏通下游，与于成龙所言相同。萨穆哈等回到京城，没有将汤斌的意见报告皇上。汤斌到京城后，皇上问汤斌，汤斌将实情告诉了皇上，萨穆哈等被罢官离任。
二十六年五月，无雨，钦天监灵台郎董汉臣上疏指责这是由于时事所造成的，语言触及当权者。此疏下到延臣议论，明珠很恐慌，要自承罪责，只有大学士王熙一人表示：“市井小人胡言乱语，应立即斩首，事情可以完结。”汤斌后来也到了朝廷，余国柱将这一情况告诉了他，汤斌说：“董汉臣根据诏旨议论朝政，没有处死的理由。大臣们不讲而小臣敢讲，我们应该自省。”皇上终于免去董汉臣的罪；明珠、余国柱对汤斌更加怨恨，摘录他的一些言论上报，并找出汤斌在苏州发布文告中的话“爱民有心，救民无术”，作为对朝廷的诽谤。皇上传旨责问，汤斌自己表示“天资愚昧，过错很多”，请求严加处分。左都御史囗丹、王鸿绪等接连上疏弹劾汤斌。汤斌先前推荐候补道耿介为少詹事，一同辅导太子，恰逢耿介以年老多病请求辞官，詹事尹泰等弹劾耿介是有目的的请求辞官，并且提到汤斌胡乱推荐，建议革去汤斌的官职，只有皇上让汤斌留任。余国柱传言说，皇上要将汤斌降隶八旗户籍，正好汤斌带病入朝，精神不振，于是传言越传越广，听到的人都哭泣落泪，江甫人住在京师的，要击登闻鼓为汤斌诉冤，后来知道没有那么回事，才散去。
九月，改任工部尚书，不久，病发，皇上派太医会诊治。十月，从通州勘查外地进贡的木料回来，一夜之间便故去，年龄六十一岁。汤斌去世后，皇上曾对廷臣说：“我待汤斌不薄，而对他的怨恨、诽谤却不断，这是为什么？”明珠、余国柱等人特别嫉恨汤斌，不赞成皇上厚待汤斌，汤斌在朝廷中的灾祸一直是无法预料的。
汤斌以孙奇逢为师，学习宋代诸儒的书。他曾说：“对事物要穷究其中的道理，如果囿于事物表象而不悟，对事物的了解既支离破碎又不得其本质；如果离开具体事物而又求了解它，实际上是毁掉了自己的视听，同样是虚妄不实的。”他教育人，认为“必须先弄清义和利的界限，慎重对待诚与伪的关系，研究真正的经学、真正的道学，否则将讲论和实践分离，对社会风气有什么好处呢”？汤斌忠实恪守程、朱之学，同时也不菲薄王守仁。办事身体力行，不崇尚空论，造诣精深。着作有《洛学编》、《潜庵语录》。雍正时，其牌位准入贤良祠。乾隆元年，赠谥号为“文正”。道光三年，随从附祀孔子庙。
【原文】
汤斌，字孔伯，河南睢州人。明末流贼陷睢州，母赵殉节死，事具明史列女传。父契祖，挈斌避兵浙江衢州。顺治二年，奉父还里。九年，成进士，选庶吉士，授国史院检讨。
方议修明史，斌应诏言：“宋史修於元至正，而不讳文天祥、谢枋得之忠；元史修於明洪武，而亦着丁好礼、巴颜布哈之义。顺治元、二年间，前明诸臣有抗节不屈、临危致命者，不可概以叛书。宜命纂修诸臣勿事瞻顾。”下所司。大学士冯铨、金之俊谓斌奖逆，拟旨严饬，世祖特召至南苑慰谕之。时府、道多缺员，上以用人方亟，当得文行兼优者，以学问为经济，选翰林官，得陈爌、黄志遴、王无咎、杨思圣、蓝润、王舜年、范周、马烨曾、沈荃及斌凡十人。
斌出为潼关道副使。时方用兵关中，徵发四至。总兵陈德调湖南，将二万人至关欲留，斌以计出之，至洛阳譁溃。十六年，调江西岭北道。明将李玉廷率所部万人据雩都山寨，约降，未及期，而郑成功犯江宁。斌策玉廷必变计，夜驰至南安设守。玉廷以兵至，见有备，却走；遣将追击，获玉廷。
斌念父老，以病乞休，丁父忧。服阕，闻容城孙奇逢讲学夏峰，负笈往从。康熙十七年，诏举博学鸿儒，尚书魏象枢、副都御史金鋐以斌荐，试一等，授翰林院侍讲，与修明史。二十年，充日讲起居注官、浙江乡试正考官，转侍读。二十一年，命为明史总裁官，迁左庶子。二十三年，擢内阁学士。江宁巡抚缺，方廷推，上曰：“今以道学名者，言行或相悖。朕闻汤斌从孙奇逢学，有操守，可补江宁巡抚。”濒行，谕曰：“居官以正风俗为先。江苏习尚华侈，其加意化导，非旦夕事，必从容渐摩，使之改心易虑。”赐鞍马一、表里十、银五百。复赐御书三轴，曰：“今当远离，展此如对朕也！”十月，上南巡，至苏州，谕斌曰：“向闻吴阊繁盛，今观其风土，尚虚华，安佚乐，逐末者多，力田者寡。尔当使之去奢返朴，事事务本，庶几可挽颓风。”上还跸，斌从至江宁，命还苏州，赐御书及狐腋蟒服。
初，余国柱为江宁巡抚，淮、扬二府被水，国柱疏言：“水退，田可耕，明年当徵赋。”斌遣覆勘，水未退即田，出水处犹未可耕，奏寝前议。二十四年，疏言：“江苏赋税甲天下，每岁本折五六百万。上命分年带徵漕欠，而地丁钱粮，自康熙十八年至二十二年，五年并徵。州县比较，十日一限。使每日轮比，则十日中三日空闲，七日赴比。民知剜补无术，拌皮骨以捱徵比；官知催科计穷，拌降革以图卸担。恳将民欠地丁钱粮照漕项一例，於康熙二十四年起，分年带徵。”又疏言：“苏、松土隘人稠，而条银漕白正耗以及白粮经费漕賸五米十银，杂项差徭，不可胜计。区区两府，田不加广，而当大省百馀州县之赋，民力日绌。顺治初，钱粮起存相半，考成之例尚宽。后因兵饷急迫，起解数多，又定十分考成之例。一分不完，难逭部议。官吏顾惜功名，必多苟且。参罚期迫，则以欠作完；赔补维艰，又以完为欠。百姓脂膏已竭，有司智勇俱困。积欠年久，惟恃恩蠲。然与其赦免於追呼既穷之后，何若酌减於徵比未加之先。恳将苏、松钱粮各照科则量减一二成，定适中可完之实数，再将科则稍加归并，使简易明白，便於稽核。”又请蠲苏、松等七府州十三年至十七年未完银米，淮、扬二府十八九两年灾欠，及邳州版荒、宿迁九厘地亩款项，并失额丁粮，皆下部议行。九厘地亩款项，即明万历后暂加三饷，宿迁派银四千三百有奇，至是始得蠲免。
淮、扬、徐三府复水，斌条列蠲赈事宜，请发帑五万，籴米湖广，下俟诏下，即行咨请漕运总督徐旭龄、河道总督靳辅分赈淮安。斌赴清河、桃源、宿迁、邳、丰诸州县察赈，疏闻，上命侍郎素赫助之。先后奏劾知府赵禄星、张万寿，知县陈协濬、蔡司沾、卢綖、葛之英、刘涛、刘茂位等。常州知府祖进朝以失察属吏降调，斌察其廉，奏留之。又疏荐吴县知县刘滋、吴江知县郭琇廉能最着，而徵收钱粮，未能十分全完，请予行取。下部皆议驳，特旨允行。
斌令诸州县立社学，讲孝经、小学，修泰伯祠及宋范仲淹、明周顺昌祠，禁妇女游观，胥吏、倡优毋得衣裘帛，毁淫词小说，革火葬。苏州城西上方山有五通神祠，几数百年，远近奔走如骛。谚谓其山曰“肉山”，其下石湖曰“酒海”。少妇病，巫辄言五通将娶为妇，往往瘵死。斌收其偶像，木者焚之，土者沉之，并饬诸州县有类此者悉毁之，撤其材修学宫。教化大行，民皆悦服。
方明珠用事，国柱附之。布政使龚其旋坐贪，为御史陆陇其所劾，因国柱贿明珠得缓；国柱更欲为斌言，以斌严正，不得发。及蠲江南赋，国柱使人语斌，谓皆明珠力，江南人宜有以报之，索赇，斌不应。比大计，外吏辇金於明珠门者不绝，而斌属吏独无。
二十五年，上为太子择辅导臣，廷臣有举斌者。诏曰：“自古帝王谕教太子，必简和平谨恪之臣，统率宫僚，专资辅翼。汤斌在讲筵时，素行谨慎，朕所稔知。及简任巡抚，洁己率属，实心任事。允宜拔擢，以风有位。”授礼部尚书，管詹事府事。将行，吴民泣留不得，罢市三日，遮道焚香送之。初，靳辅与按察使于成龙争论下河事，久未决。廷臣阿明珠意，多右辅。命尚书萨穆哈、穆成额会斌勘议，斌主濬下河如成龙言。萨穆哈等还京师，不以斌语闻。斌至，上问斌，斌以实对。萨穆哈等坐罢去。
二十六年五月，不雨，灵台郎董汉臣上书指斥时事，语侵执政，下廷议，明珠惶惧，将引罪。大学士王熙独曰：“市儿妄语，立斩之，事毕矣。”斌后至，国柱以告。斌曰：“汉臣应诏言事无死法。大臣不言而小臣言之，吾辈当自省。”上卒免汉臣罪。明珠、国柱愈恚，摘其语上闻，并摭斌在苏时文告语，曰“爱民有心，救民无术”，以为谤讪，传旨诘问。斌惟自陈资性愚昧，愆过丛集，乞赐严加处分。左都御史璙丹、王鸿绪等又连疏劾斌。会斌先荐候补道耿介为少詹事，同辅太子，介以老疾乞休。詹事尹泰等劾介侥幸求去，且及斌妄荐，议夺斌官，上独留斌任。国柱宣言上将隶斌旗籍，斌适扶病入朝，道路相传，闻者皆泣下。江南人客都下者，将击登闻鼓讼冤，继知无其事，乃散。
九月，改工部尚书。未几，疾作，遣太医诊视。十月，自通州勘贡木归，一夕卒，年六十一。斌既卒，上尝语廷臣曰：“朕遇汤斌不薄，而怨讪不休，何也？”明珠、国柱辈嫉斌甚，微上厚斌，斌祸且不测。
斌既师奇逢，习宋诸儒书。尝订：“滞事物以穷理，沉溺迹象，既支离而无本；离事物而致知，隳聪黜明，亦虚空而鲜实。”其教人，以为必先明义利之界，谨诚伪之关，为真经学、真道学；否则讲论、践履析为二事，世道何赖。斌笃守程、朱，亦不薄王守仁。身体力行，不尚讲论，所诣深粹。着有洛学编、潜庵语录。雍正中，入贤良祠。乾隆元年，谥文正。道光三年，从祀孔子庙。