中国对美国的导弹防御计划的研究和部署意向向来持强烈的反对态度。里根政府1983年3月提出“星球大战”计划，中国就明确表示反对。邓小平曾经说过，“星球大战”计划将导致军备竞赛，搞不得。[45]1985年，邓小平对来访的美国前总统尼克松说，“星球大战”计划会将军备竞赛引入太空，这是中国坚决反对的。他还建议中国和欧洲联合反对“星球大战”计划。[46]此外，“星球大战”计划一旦付诸实施，美国建立起可以有效拦截进攻性战略核武器的“天网”，不仅将对苏联占有巨大的战略优势，打破美苏之间的恐怖均势，客观上也将使得中国的有限核武器失去威慑力。[47]
90年代克林顿政府的导弹防御计划同样受到了中国政府和人民的猛烈批评和坚决反对。其原因综合起来说有以下几个方面：首先，中国认为，NMD计划的部署将会危及世界的战略平衡、战略稳定和国际安全。中国非常希望今天的国际安全能够出现稳定和建设性的局面。其次，中国认为NND部署将会损害国际军控事业，挑起新的军备竞赛。第三，NMD将会削弱国际防扩散努力的发展。第四，TMD在东亚的部署将会促动东亚地区紧张局势的发展。第五，无论是NMD还是TND都将直接威胁中国的国家安全。第六，美国的导弹防御计划不符合冷战后国际安全与和平发展的基本潮流，不利于多极化世界格局的发展。
从目前台湾当局对于统一的基本态度和美日加强在东亚的军事同盟关系、力图维持两岸分裂现状的政策来看，TMD一旦与台湾挂钩，将会对两岸关系产生以下极为消极的作用。
（1）TMD会大大加强台湾现有的军事装备和技术能力，增强台湾当局以武力对抗统一的信念，从根本上不利于两岸接触、对话的和平进程。
90年代中期之前，台湾对抗统一进程，有两张“牌”好打：一是经济牌，二是所谓民主牌。但1996年3月中国在台湾海峡进行的导弹试射之后，台湾当局利用鼓吹“中国威胁论”的国际势力，大打“安全牌”。所谓“安全牌”的下限是台湾受到来自大陆的“巨大威胁”，在这样的“威胁”面前，台湾无法以“自主”的方式就两岸关系和未来前途通过和平谈判来获得平等的解决。台湾因为受到“威胁”，所以不能以自己的“意愿”来进行谈判。其上限是主张台独者荒谬地认为的：台湾是一个“独立的主权国家”，来自中国大陆的“威胁”就是台湾“将要受侵略”的“威胁，；因此，台湾从”主权“地位出发对抗统一就是合理合法的”对抗侵略威胁“台湾强兵自保，甚至走向”独立“都是自然的、”合理合法“的。目前，台湾某些人鼓吹的”中国威胁论“和国际上部分反华势力所鼓吹的”中国威胁论“事实上正在相互利用、相互补充。在TMD问题上两岸的分歧，深刻反映了祖国大陆”一国两制、和平统一“但面对台湾岛内的分离主义倾向又不得不保持军事压力实行”以压促统的政策，与台湾目前不惜以任何手段偏安自保、甚至挟洋自重的对抗统一政策之间的矛盾。
如果TMD扩展到台湾，台湾获得了当前世界上最先进的导弹防御技术，客观上会大大增强台湾现有的军事实力，使台湾在获得“安全感”的同时进一步争取两岸关系保持现状或者向实质性台独方向转化。从1991—1999年，台湾向海外订购了200亿美元的军火，其中180亿美元用来购买了美国的武器。这一数字使得台湾在冷战结束后的10年中排在沙特阿拉伯之后成为世界上第二大军火买家。[48]而且，台湾近年来的军费水平虽然一直维持在80多亿美元左右，但许多台湾的军购费用往往是由台湾立法院单独通过的，并不在日常军费预算之内。因此，台湾的实际军费水平要比台湾公布的年度军费数字要高得多。在台湾当局长期整军备战思想的影响下，台湾的常规军事力量在技术和装备上对祖国大陆具有一定的优势。美国1999年2月公布的“台海安全情势报告”中承认，台湾现有武器技术装备在质量上“领先于中国大陆”。[49]TMD只会使得台湾在常规武器和局部军事技术和装备上进一步扩大同中国大陆的差距，造成有利于台湾“自保”的军事态势上的“台湾优势”。因此，TMD不是保障台湾“安全”的防御性武器，而是纵容台湾分离主义势力发展的工具；TMD现实增强的不是台湾的“安全”，而只是台湾对抗统一的“偏安”。TMD入台给台湾的不是“安全的空间”，而是岛内分离主义势力进一步发展“台独”的空间。
（2）TMD会增强美国等其他国家支持台湾维持现状、对抗统一的政治效应，不利于孤立和压制台湾的分离主义势力，不利于中国争取广泛的国际支持解决台湾问题，并进而促使台湾产生心理上的安全感，助长台湾的分离主义倾向。
台湾当局目前对抗统一的立场非常顽固。从李登辉的“两国论”到陈水扁的“未来的一个中国”，完全是台湾力图维持与祖国分离局面的挡箭牌。为此，台湾不惜以“务实外交”、“金元外交”和“采购外交”等手段开拓国际空间、挟洋自重，力图削弱来自中国大陆的统一压力和影响。以《与台湾关系法》为代表的部分国际势力，确实也在为台湾对抗统一“打气撑腰”。两岸关系的背后，存在着各自的外交和政治影响力此消彼长的问题。台湾获得国际势力的支持越大，台湾对抗统一的态度就会越顽固。如何在国际舞台上缩小对台湾分离主义的支持，是我们一项长期而又艰巨的战略性任务。目前美国以《与台湾关系法》架构为代表的对台湾的支持势力，是我国实行统一政策最为严峻的外部挑战。美国国会屡次通过的有关将TMD扩展到台湾的立法，既是国际势力支持台湾的新行动，也是台湾借国际势力对抗统一的新砝码。如果美国行政部门最终作出将台湾纳入TMD系统的决定，这不单是一项简单的在军事上加强台湾军事防御能力的决策，由此而产生的政治和外交影响力将同样是非常深刻的。
一方面，它会重新加强美国对台湾现状承担的所谓“义务”，虚化近年来中美关系通过首脑互访在解决台湾问题争议上所取得的进展，特别是会虚化1998年6月克林顿访华期间宣布的在台湾问题上的“三不”政策。克林顿的“三不”对在台湾问题上约束美国遵守中美“三个联合公报”原则，逐步促使稳定、建设性的中美关系朝着有利于中国统一的方向发展具有重大意义，也是自1982年“八·一七公报”签署16年以来，中美在台湾问题上所取得的又一次积极进展。虽然TMD入台与克林顿“三不政策”没有直接的关系，但却会造成美国在政治和外交上继续支持台湾对大陆中国实行强硬政策的“认识”，至少将会平衡克林顿“三不政策”使台湾所面临的压力。另一方面，TMD扩展到台湾，会使得大陆对台湾的所谓“军事威胁”，特别是“导弹威胁”，成为一个起码在美国方面受公认的事实，两岸关系从一个侧面也就自然被宣布成了一种“威胁”与“被威胁”的关系，台湾近几年来大打的“安全牌”就有了更大的余地。这在政治上和外交上非常不利于我们对台湾所开展的“和平统一”攻势。美国学者也表示，即便TMD入台不会给台湾提供实质性的导弹防御系统，但却会实质性地弱化中国大陆阻止台湾走向独立的能力。[50]
保持对台湾适度的军事压力，既是为了以压促统，更多地则是要威慑台湾的分离主义势力，希望台湾不要在分离主义的道路上越走越远。对这一点，美国不是没有意识到。2000年3月18日台湾“大选”之前，两岸关系非常紧张。尽管如此，美国方面还是表示，不存在发生战争的可能性。美国目前最担心的是两岸真的被迫走到兵戎相见的地步。因此，美国不会轻易作出刺激两岸任何一方的事情来，美国同样不想充当“麻烦制造者”。但问题是，对台军事压力与“和平统一”政策如何巧妙地协调，是一个非常有技巧性的问题。
（3）TMD所带来的台湾军事力量的长足进展，很有可能诱发两岸军备竞赛，促使台湾海峡局势进一步动荡。
如果台湾在获得TMD武器技术后在两岸军事态势上处于战略优势，而台湾岛内政治局势的发展又很可能趋向台湾独立，这两者的结合可能导致的前景将必然是中国必须认真思考的问题。台湾现在竭力想购买美国的“宙斯盾”战舰，就是为了防范中国大陆的巡航导弹。2000年2月，第一艘“现代级”驱逐舰已经交付中国海军。台湾目前将该类型战舰视为对台湾海军海峡防御能力的威胁。而“宙斯盾”战舰一旦在台湾成军，台湾认为不仅可以为加入NTW或者NAW做准备，而且也将有利于台湾获得对大陆海军实力加强后的平衡能力，利用“宙斯盾”军舰上的“标准”导弹系统，压制“现代级”战舰对台湾的海上“威胁”。两岸军备竞赛的升级只会促使两岸的军事对峙进一步增强，中国大陆方面将不得不采取针对性的行动，加强对台湾进攻性武器的部署。其结果，军事因素而不是接触与谈判的和平因素在两岸关系中进一步发挥主导作用。军事因素在两岸关系中的地位上升，和平谈判的进程自然就会受到最大的冲击。由此带来的问题是，两岸在建立军事互信和军事交流等方面的建设性举措就会更难以成行。两岸激烈的军事对峙甚至可能引发“擦枪走火”之类的突发性事件产生，从而危害台湾海峡地区和整个东亚和平。为此，中国外交部发言人明确提出，TMD入台“将直接影响到台湾海峡地区的安全”[51]
更进一步来说，台湾获得TMD也将迫使中国政府不得不考虑和作出某些新的选择，以便为了维护领土和主权应付今后可能出现的各种变化。其中的选择之一就是采取某种“预防性”的行动，或以中国自己的方式提前解决台湾问题。[52]而真到了这一步，对两岸关系绝对是一种灾难。但这种灾难的起因却是由台湾和美国所挑起的。台湾媒体也引用中方人士的话报道说，台湾加入TMD，很可能导致中国大陆不得不加大对台湾的军事部署，提高用武力解决台湾问题的可能性。[53]
（4）如果因为TMD扩展到台湾，台湾将进一步密切与美日东亚安保体系的关系，并在无形中成为美日安保机制的一部分。中国在台湾问题上有可能的政策选择将会被大大压缩，在统一问题上主动权就会被进一步削弱。
台湾当局深知，无论它自己如何整军备战，其整体的军事力量的发展终究是有限的。台湾为了偏安，90年代以来的一贯做法一是强化自身战斗力，摆出一副愿意“全力一搏”的架势，用军事力量来提升当局考虑大陆政策的底气；二是企图依靠美国的政治与军事支持，分化和离间中美关系，以便“挟洋自重”。然而，台湾在外交上并不能确定美国是否真正会为了台湾而卷入未来有可能的台海军事纷争，于是就想拼命挤进美日在东亚的联合安保体制，设法将两岸统一问题变成东亚区域安全问题，借美日之力来遏制中国，降低大陆对台“动武”的可能性。台湾当局对构想中的“东亚多边安全机制”一直心怀憧憬。李登辉近年不断放话，支持美日加强双边军事同盟，支持日本通过修订后的中期防卫指针，支持美日安保的“周边事态”定义涵盖台湾。为了取悦于日本，李登辉甚至不惜对日本媒体说，中国要求日本正视历史问题、就过去侵华战争向中国人民道歉为“过分举动”。[54]
台湾现在想要加入TMD，一大政治性的考虑就是能够挤进美日东亚安保体系。TMD并非是一项单纯的武器技术，而是具有整个区域效应的武器系统。美国研制和在东亚部署TMD是美国加强在东亚军事同盟体制、协调和强化与东亚盟友军事合作、为未来美国直接卷入东亚地区危机作相应军事准备的战略性步骤。1998年9月底美国国会通过的“国防授权法”以附议的形式，要求美国国防部研究将TMD扩展到“亚太盟友”。参、众两院的协商意见规定，美国的“亚太盟友”包括日本、韩国与中国台湾。目前，日本已经参与了TMD美日联合研制。台湾加入TMD，将大大提高台湾在美国东亚军事战略态势构筑中的地位，也是美日将其安保体制延伸到台湾的具体化。为此，台湾加入TMD，将有可能进一步形成美台之间“准军事同盟”关系。[55]其后果，不但会使台湾当局钻进美日东亚安保体系的企图得逞，也会使中国的统一政策面临来自美日等国的更大压力。客观上，中国对台湾分离主义的威慑力将会受到限制，台湾问题和东亚区域安全问题之间的界限就更难以分清。
（5）TMD入台的庞大军费预算不利于台湾经济的发展和社会的繁荣，事实上是劳民伤财的举动。
台湾当局下决心要挤人美国的TMD东亚部署，以此来获得台湾所需要的导弹防御、美台关系以及抗衡大陆军事压力等各方面的利益。但是，即使台湾现在在为加入TMD做准备工作，其费用也已经非常庞大了。根据台湾当局已经宣布的对美军购清单，PEC-3要花14亿美元，4艘“宙斯盾”军舰的单舰造价为8亿美元，再加上升级的“宙斯盾”综合防空系统（Aegis-derived Evolved Advanced Combat System，EACS），总计要花65亿美元；[56]“PAVE”远程雷达要花2.2亿美元。仅这几项加在一起，就超过了82亿美元。几乎占据了整个90年代台湾对外军购总额的一半，接近于台湾一年的“国防开支”总额。如果台湾要装备NTW或者NAW，其费用将进一步提高。按照台湾现有的TMD系统装备构想，到台湾建立其海军高空层战区导弹防御能力，台湾在TMD项目上的总预算将超过200亿美元，是台湾两年半的军费预算总值。台湾目前一年的海军军费大约为200亿—250亿新台币，而4艘“宙斯盾”军舰的造舰价格就达到了1040亿新台币，相当于台湾4年的海军军费总额。这样庞大的TMD支出，必然挤占台湾其他建设经费，使得目前整体经济正处于低潮的台湾发展受到消极影响。台湾学者已经指出，台湾当局在TMD问题上的大笔经费开支，投入一个“防御效果无法确定的国防支出，势必对国家财政和经济发展产生一定的负面影响，而此正是令人堪虞与质疑之处”[57]。
综上所述，中国根本无法接受美国有可能将TMD扩展到台湾的任何决定。如果台湾执意要挤进美国的TMD计划，也只能给台湾海峡局势和两岸关系带来灾难性的后果。使TMD与台湾脱钩，是我们的统一政策、国家安全战略和中国的外交实践在新世纪到来之际所面临的最为严峻的战略性考验之一。TMD一旦同台湾挂钩所带来的负面效应，远远不会简单局限于两岸关系和我们现有的尽早完成祖国统一大业的有关部署，而且对整个中国的政治、外交和国家安全战略都将带来短时期内难以消除的消极后果。江泽民主席在1999年3月初会见美国国务卿奥尔布赖特时已经严正声明，如果美国把TMD延展到台湾，将使中美关系面临“重大倒退”。[58]朱镕基总理在1999年3月举行的中国九届人大二次会议后的记者招待会上也明确表示：“我们反对TMD，尤其是坚决反对把台湾纳入TMD，因为TMD不但违反了有关导弹的国际协议，也干涉了中国的内政，是对中国领土和主权完整的侵犯。”[59]