火绳枪的射程、精度是提高了，但是存在重大缺点：
首先，它使用起来很不方便。据记载，其使用分以下步骤：倒药（将火药倒入定量的药管中，每管装一发的药量）、装药（将火药从枪口倒入）、压火（用捣杆将药压实）、装弹（装入弹丸，再用捣杆将弹压入火药中）、装门药（打开药池盖，将发火药装入药池，再盖上药池，以防受潮）、将火绳装入蛇形夹内，准备点火待发。射击时，打开火门盖，点燃火绳，扣动扳机发射。这种发射程序实在是太复杂了，以至于1638年德国魏玛公爵的火绳枪兵在维滕贝格的战斗中，从中午到晚上8个小时，每个士兵只打出7发子弹！
其次，携带也太麻烦了。请看当时人们对火绳枪兵的描写：“他扛着很不顺手的笨重火绳枪，装有粗火药的扁瓶挂在身上，还有装精细黑火药的药盒，一串子弹丸是放在皮带里的，同时手里拿着枪支架和缓燃火绳以及送弹棍等。”没办法的情况下，火绳枪兵只好雇用“随从”帮忙，当时叫“侍童”，职责是扛枪架、拿火绳，雨天还得由侍童把火绳放在高帽子中，以防熄火。
更重要的是，它一遇到潮湿天气往往就会打不响，直接影响战斗进程和结局。明万历四十七年（1619年），明军与后金的努尔哈赤决战于萨尔浒，大量装备火绳枪的明军，因时逢雨雪，火药受潮无法发射，被歼4.5万人，马4万匹，辎重器械无数，从此一蹶不振。
上述问题，成为人们对火绳枪不断改进的基本动因。