慢性支气管炎控制感染时合理应用抗菌药，应注意的问题有：
（1）严格掌握适应症。病毒感染或发热原因不明者不应轻易应用抗菌药物治疗，尤其上呼吸道感染有一半是单纯病毒感染，对症治疗和服用清热解毒中成药更为有效。
（2）合理选择。一般感染应用的抗菌药物的抗菌谱不宜太广，剂量充足而不过大，疗程不宜太长以免致二重感染。
（3）联合用药应有明确指征。联合用药的目的是防止细菌发生急性耐药，治疗已知的严重混合感染，增加抗菌活性，扩大抗菌谱。不能盲目增加抗菌药物的剂量。
（4）及早确立病原学的诊断。如有条件应做病原学检查和细菌药物敏感度（药敏）测定，以指导抗菌药物的选择。
（5）肝肾功能减退时抗菌药物的应用。肝病及肝功能减退患者，应慎用在肝内代谢、经肝胆系统排泄或对肝脏有损害的药物。多数抗菌药物主要经肾脏排泄，肾功能不全患者应根据药物代谢过程、毒性大小、排泄途径调整剂量或给药间隔时间。慎用氨基糖苷类药物。
（6）尽量避免预防性用药。实践证明预防性应用抗菌药物预防呼吸道感染并不能达到预期目的，反而会引起耐药菌株的感染和二重感染。因为呼吸系统感染的致病菌很多，企图以一种或两种抗生素来阻止多种细菌侵入往往是不可能的。因此，呼吸系统感染的预防应着重于提高机体免疫力和防御功能。
（7）尽量避免局部用药。经皮肤或黏膜局部应用抗菌药物，往往不能达到预期效果，反而会出现耐药菌的产生或变态反应。