“院系调整对原来的清华大学造成了巨大损失，同时清华大学对当时我国高等教育事业的大发展作出了重要贡献。”
1.这是当时“一边倒”学习苏联、大规模推进经济建设（工业化）的历史进程决定的，适应计划经济、产品经济的需要，学校基本是对口专业的集合。
2.积极效果是
①高等教育事业迅速发展，质量基本保证；高等学校在全国的布局得到很大改善，持续调动了中央有关部门办学的积极性。
②到1966年为止，培养了大批适应经济建设的人才，是支撑近半个世纪来我国建设事业的基础和骨干力量，锻炼出各条战线不少栋梁之材。
（以上两点可以有足够的正式统计数字为依据）
3.高等教育和学校发展中的缺陷和损失的原因如下：既有教育体制和学校内部组织和专业结构的原因（这和院系调整有关系），也有由1957年以后占主导地位的“左”的路线的原因。知识分子群体（包括干部）的定位问题一直没有正确解决，延续了二十余年，直到被扭曲为异己力量或专政对象。长时期学校不能以提高教育质量和学术水平为中心，教师不能起主导作用。由此造成的损失更重大，这是基本的，和院系调整无关。
4.我们现在要自主建设发展高等教育事业。要研究历史，自有现代高等教育雏形开始到近20余年，把教育体制全面的真实情况和整个历史环境的变化背景结合起来研究。积极研究和吸取国外的经验也采取同样的方法。
关于院系调整的是非得失，倡导在不同视点上仁者见仁、智者见智，不必要求认识一致。这对于自主发展我国高等教育事业才有好处。