回回医术中，眼科有悠久的传统和良好的疗效。蒙古国时期，有阿拉伯人白敬宇来华，定居于定州(今河北定县)，以行医卖药为生，所制眼药疗效显着。
外科是回回医术的擅长科目。据载，元时大都有一儿童，患头疼不可忍。有一回回医官，用刀划开额上，取出一小蟹，坚硬如石，尚能活动，顷刻即死，儿童头疼亦愈。平江(今江苏苏州)阊门，有一过客之马腹膨胀倒地，店中有一老回回见之，于左腿内割取小块出，其马随起即骑而去（《南村辍耕录》卷二二，《西域奇术》。）
回回人入居中原后，有的努力学习中国传统医术，取得了很大成就。元代回回医学家萨德弥实，字谦斋。曾为御史，出为建昌太守，任内有政声。着《瑞竹堂验方》十五卷，惜明中叶后流传极少。清修《四库全书》时，据《永乐大典》所载，搜采编辑，分列二十四门，合为五卷，原书十之五六已亡阙。《四库全书总目·瑞竹堂经验方》提要如下：
谨依方诠次，分立二十四门，厘为五卷。中间如调补一门，不轻用金石之药，其处方最为醇正。又女科之八珍散，即四君子汤、四物汤之并方，其用尤广，明薛己医药已详着之。至疮科所载返魂丹，与今世疡医所用梅花点舌丹、夺命丹相类。内托千金散以治痈毒，亦见殊功，是皆可资利济之用。惟幼科之褐丸子与苏沈良方中列褐丸，名目相类，治疗亦同，特彼用乌头、桂、香附、干姜、陈皮配合，攻补兼行，颇为周密。此乃用黑牵牛、京三陵、蓬莪术诸品，殊病其过于峻利。盖金元方剂往往如斯，由北人气禀壮实，与南人异治故也。
该书现存185方，科目较齐全。这部医书还传到日本，并予刊行。
3.药物
《回回药方》和忽思慧《饮膳正要》中有许多治疗医方和营养方，这些方剂中所用药物多来自中亚、西亚或南海地区。现择其要者，简介如下。
阿月浑子。为漆树科的一种树或灌木，约有六种，产于伊朗和西亚地区。阿月浑子的果实是波斯和中亚常见的食品。唐时传入中国，段成式《酉阳杂俎》云：“胡榛子、阿月生西国，蕃人言与胡榛子同树，一年榛，二年阿月。”陈藏器《本草拾遗》云：“阿月浑子，气味辛温，清无毒。主治诸痢，去冷气，令人肥健。阿月浑子生西国诸蕃，与胡榛同树，一岁胡榛子，二岁阿月浑子也。”可见唐时已知此植物“主治诸痢”，是一种药物。
必思答。即阿月浑子，系波斯语Pista的元代音译。忽思慧《饮膳正要》：“必思答，味甘无毒，调中顺气。其果出回回田地。”《大明一统志》译为“苾思檀”。
葫荽。一名芫荽。波斯语gosniz的汉译。原产于亚洲西部及埃及一带，波斯亦产，并传入世界各地。唐时传入中国，见唐人孟诜所撰《食疗本草》和陈藏器《本草拾遗》。元忽思慧《饮膳正要》云：“芫荽，味辛温，微毒，消谷，补五脏不足，通利小便。一名胡荽。”
回回葱。原产波斯和中亚地区。传入中国后，最早见于隋孙思邈《千金食治》，称为“蒜葱”或“胡葱”。《饮膳正要》云：“回回葱，味辛温，无毒，温中，消谷下气，杀虫，久食发病。”明李时珍《本草纲目》称“胡葱即蒜葱也。”
齐。波斯语bīrzai的汉译。唐段成式《酉阳杂俎》云：“齐出波斯，拂林呼为顸勃梨他。长一丈余，围一尺许。皮色青薄而极光净。叶似阿魏，每三叶生于条端，无花实。西域人常八月伐之，至腊月，更抽薪条，极滋茂。若不剪除，反枯死。七月断其枝，有黄色叶，其状如蜜，微有香气，入药疗病。”齐又称白松香，原产于叙利亚，唐朝时中国始知之。
阿魏。波斯语āngnyan的汉译。阿魏树脂是一种菜蔬产品，含有树脂、树胶和油料。原产于波斯和乌浒河、阿剌海和里海东岸诸地。可作药物，助消化、健胃，治皮肤红肿。中国史书《隋书》《北史》《酉阳杂俎》《诸蕃志》等书皆有记载。段成式《酉阳杂俎》云：“阿魏出伽阇国，即北天竺也。伽阇呼为形虞。亦出波斯国，波斯国呼为阿虞截。树长八九丈，皮色青黄，三月生叶，叶似鼠耳，无花实。断其枝，汁出如饴。久乃坚凝，名阿魏。拂林国僧弯所说同摩伽陀国僧提婆，言取其汁为米豆屑，合成阿魏。”元忽思慧《饮膳正要》据波斯语kasni译成“哈昔泥”，云：“哈昔泥，味辛温，无毒，主杀诸虫，去臭气，破症瘕，下恶除邪，解蛊毒。即阿魏。”
稳展。即阿魏树根，为“回回茶饭”所用香料之一，又称“回回香料”。《饮膳正要》云：“稳展，味辛温，苦无毒，主杀虫，去臭。其味与阿魏同，又云即阿魏树根。腌羊肉香味甚美。”
无食子。波斯语muzak的汉译。原产波斯、叙利亚、小亚细亚等地。为一种球状树瘤，由于黄蜂在几种橡树上戳刺树枝、树叶或花苞，产卵于其上而长成。用于工艺和医药。中国史书上首次记载无食子者为《隋书》。唐时传入中国，《酉阳杂俎》云：“无石(食)子出波斯国，波斯呼为摩贼树，长六七丈，围八九尺，叶似桃叶而长，三月开花，白色，花心微红，子圆如弹丸。初春熟乃黄，百虫食成孔者正熟皮，无孔者入药用。其树一年生无石(食)子，一年生跋屡子，大如指，长三寸。”《大明一统志》也提到无食子，出大食国及各番邦。
八担（八担，波斯语，杏也；突厥语承之。今维语仍称杏为八担。中原“八担杏”即由西域传来。）仁。原产波斯。唐时称为“婆淡”，《酉阳杂俎》云：“偏桃出波斯国，波斯国呼为婆淡树，长五六丈，围四五尺，叶似桃而阔大，三月开花，白色，花落结实，状如桃子而形扁，其肉苦涩不可噉，核中仁甘甜，西域各国并珍之。”元时译为“八担”，《饮膳正要》云：“八担仁，味甘，无毒，止咳下气，消心腹逆闷。其果出回回田地。”
莳萝。波斯语Zira的汉译。原产于波斯，即小茴香、葛缕子。可能是唐时由陆路和海路分别传入中国。唐陈藏器《本草拾遗》称，莳萝出佛哲(今苏门答腊)；五代李珣《海药本草》云，莳萝出波斯；宋人苏颂称莳萝出岭南。元时广泛种植，忽思慧《饮膳正要》云：“莳萝，味辛温。无毒，健脾开胃，温中，补水藏(五脏)，杀鱼肉毒。”
苦鲁麻。即“波斯枣”。唐段成式《酉阳杂俎》译为“窟莽”(波斯语xurman)，《唐书》译为“鹘莽”(波斯语gurman)，元时译为“苦鲁麻”。陶宗仪《南村辍耕录》卷二十七《金果》条载：“成都府江渎庙前，有树六株，世传自汉唐以来即有之。其树高可五六十丈，围约三四寻，挺直如矢，无他柯干，顶上馋生枝叶，若棕榈状，皮如龙鳞，叶如凤尾，实如枣而加大。每岁仲冬，有司具牲馔祭毕，然后采摘。金鼓仪卫迎入公廨，差点医工，以刀逐个劙去青皮，石灰汤淖过，入熬熟，冷蜜浸五七日，漉起控干，再换熟蜜，如此三四次，却入瓶缶，封贮进献。不如此修制，则生涩不可食。泉州万年枣三株，识者谓即四川金果也。番中名为苦鲁麻枣，盖凤尾蕉也。”
波薐。唐时传入中国。明李时珍《本草纲目》等书引《唐会要》云，太宗贞观二十一年(647年)尼波罗国(今尼泊尔)献波薐菜，类红蓝，实如蒺藜，火熟之能益食味。忽思慧《饮膳正要》称为“波薐”。此菜即今之菠菜。
莙荙。即菾菜(甜菜)，为地中海和西亚植物，波斯语称为gundar或gundur，段成式《酉阳杂俎》译为“莙荙”，《太平寰宇记》译为“军荙”。忽思慧《饮膳正要》云：“莙荙，味甘寒，无毒，调中下气，去头风，利五藏。”李时珍《本草纲目》把菾菜和莙荙鉴定为同一种植物。
齐墩。原产波斯、拂林，为波斯语zeiten的音译。唐时传入中国。段成式《酉阳杂俎》云：“齐墩树出波斯国，亦出拂林国。拂林呼为齐。长二三丈，皮青，白花似梅，极芳香。子似杨桃，五月熟。西域人压为油以煮饼果，如中国之用巨胜也。”清乾隆《钦定西域同文志》将齐墩列入“外国果实类”。
阿勃参。原产阿拉伯南部，移植至巴勒斯坦一带。唐时传入中国。由拂林的阿剌迈克语apursāma音译为“阿勃参”。段成式《酉阳杂俎》云：“阿勃参出拂林国，长一丈余，皮色青白，叶细，两两相对，花似蔓菁，正黄，子似胡椒，赤色。斫其枝。汁如油，以涂疥癣，无不瘥者。其油极贵，价重于金。”
葫芦巴。原产波斯、美索不达米亚沙漠和小亚细亚一带。为阿拉伯语hulba的汉译。野生，药材用。宋时传入中国，首见于宋掌禹锡《本草》，说此种药材栽种于广东、贵州。苏颂《图经本草》云：“今出广州，或云种出海南诸番，船客将种莳于岭外，亦生，然不及番中来者真好。”
押不芦。原产于亚洲西部。为阿拉伯语yabrnh或abrnh的汉译。首见于宋周密《志雅堂杂钞》，书称：“回回国之西数千里，产一物极毒，全似人形，如人参之状，其名押不芦。生于地中深数尺，或从伤其皮则爌，毒之气着人则死。”又云：“取之之法，则先开大坑，令四旁可容人，然后轻手以皮条结络之。其皮条之前，则系于大犬之足，既而用杖打犬，犬奔逸，则此物拔起。犬感此气即毙，然后别埋他土中，经岁取出暴干，别用药，以制其性，以少许磨，酒饮，人即通身麻痹而死，虽刀斧加之，不知也。然三日别以少药投之，即活。”这显然是一种麻醉药。
咱夫兰。即蕃红花。由蕃红花的橘黄色柱头和一部分心茎制成。晒干的柱头长约3厘米，深红色，有香味，细小，有球根状多肉的地下茎，草绿色叶，秋天开紫花。可做调味品、香料、药物和染料。原产西亚地区，宋时传入中国，称“蕃栀子”，见《岭外代答》。元时译为咱夫兰，为阿拉伯语za′fern的音译。忽思慧《饮膳正要》云：“咱夫兰，味甘平，无毒，主心忧郁，积气闷不散，久食令人心喜。即是回回地面红花，未详是否。”李时珍《本草纲目》称蕃红花，元时以入食馔用。
蔓青。即沙吉木儿，为阿拉伯语aljam之音译。原产阿拉伯国家，由突厥人从波斯传入中国。忽思慧《饮膳正要》云：“蔓青，味苦温，无毒，主利五藏，轻身益气。蔓青子明目。”又说：“沙吉木儿，味甘平，无毒，温中，益气，去心腹冷痛。即蔓青根。”
回回豆。原产于波斯。辽时传入中国，元时多为野生。忽思慧《饮膳正要》云：“回回豆子，味甘，无毒，主消渴，可与盐煮食之。出在回回地面，苗似豆。今田野中处处有之。”李时珍《本草纲目》称回回豆又名“回鹘豆”“胡豆”等，由西胡传入汉地，汉名“豌豆”。清《本草纲目拾遗》卷八引《五杂俎》：“出西域，状如椿子，磨入面中，极香，能解面毒。”
回回青。元代由西域传入。《饮膳正要》云：“回回青，味甘，寒，无毒。解诸药毒，可治热毒疮肿。”李时珍《本草纲目》归于“石青”类，称“西夷回回青”，在诸石青中“回青尤贵”。
马思答吉。为乳香树所产的树胶。阿拉伯语mastaki的汉译。又称“回回香料”“西域香料”。忽思慧《饮膳正要》称：“马思答吉，味甘香，无毒，去邪恶气，温中，利膈顺气，止痛生津，解渴，令人口香。生回回地面，云是极香种类。”明《马氏日抄》称其“状如地榭”。马思答吉是“回回茶饭”中最常用的佐料，也可作汤，有马思答吉汤。
此外，唐宋以来进入中国的许多香料，如芦荟、诃黎勒、破故纸、乳香、没药、血竭、青黛、毕拨、珊瑚、苏合香、苏方木、金钱矾、龙涎香、蔷薇水、木香、丁香、金颜香、安息香、肉豆蔻、檀香……其中也有不少是药物，可配入方剂中。
4.营养与食补
营养学是医学的组成部分。我国医学的发展也促进了营养学的发展。元代回回人忽思慧，延佑年间任饮膳太医，天历三年(1330年)进《饮膳正要》三卷，系统地总结了营养理论，对养生避忌、妊娠食忌、乳母食忌、饮酒避忌、聚珍异馔、五味偏走、食疗诸病、服药食忌、食物利害、食物相反、食物中毒等作了专门论述。他说：天之所生，地之所养，天地合气，人以禀天地气生，并而为三才，三才者天地人，人而有生，所重乎者心也。心为一身为主宰，万事之根本，故身安则心能应万变。主宰万事，非保养何以能安其身。保养之法，莫若守中，守中则无过与不及之病，调顺四时，节慎饮食，起居不妄，使以五味调和五脏，五脏和平则血气资荣，精神健爽，心志安定，诸邪自不能入，寒暑不能袭，人乃怡安。
他把身心与保养的辩证关系，通过保养来调和五脏，使心志安定，作了高度概括。他所撰写的《饮膳正要》，收集了各种奇珍异馔，汤膏煎造达238方，日用谷、肉、菜230余种，介绍了各种食物的性质、烹饪及饮食卫生要求，所载汤方及食物大多具有补益和治疗作用。