元顺帝站在大都的皇宫里，看着殿外稀稀拉拉地雨丝，心中更加愁苦。不断有坏消息从宫外传来。他的军队对大明的军队毫无招架之地，山东全部地区眼看就要落入明军之手。原本自己还是能够对付明军的，但是一个月前当他下圣旨，要太傅、中书左丞相扩廓贴木儿率领其所属的十万精兵，赶往山东东昌去对明军进行阻击的时候，这个家伙竟然不听从自己的命令，居然按兵不动，从而让常遇春如入无人之境般，攻下了东昌，山东就这样都落入了明军的手里。
元顺帝气得肺都要炸了，然而正当用人之际，他也不好发作；而且明军就要兵犯河南，顺帝明白河南不能再丢了，地处中原的河南如果失守，大都便没了屏障。为此他忍气吞声，对他的左丞相丝毫没有责备，又发了一道圣旨，要扩廓贴木儿带兵急赴开封，保住河南不被明军占领。
可是半个月过去了，依然没有扩廓贴木儿大军到达开封的消息。为此，元顺帝今晨派太子爱遒识里达去了解情况，现在已是下午了，太子还没有回报，他显得异常烦躁不安。
太子总算返回皇宫了，他已被雨淋得像只落汤鸡，进得官门顾不得擦去脸上的雨水，捶胸顿足地哭诉说：“父皇，扩廓贴木儿仍然是按兵不动啊！”
“他，他竟然这样不听调遣，这又与反叛何异。”元顺帝万万没想到，手下的大臣会如此藐视他的权威。
“父皇，你不能再无动于衷了。”
“咳，朕不想放过他又能如何，他重兵在握，朕也奈何不得他呀。”
“父皇，您可以撤他的职，让他成为一个白丁。”
“而今朕的圣旨，还不是一纸空文，你撤职他也不听，还不是照常统领他的十万大军。”
“那也不能便宜他。”
“如今是用人之际，明军来势汹汹，山东业已落入敌手，河南堪堪不保，朕的皇位危矣。”
“越是危急之时，越要维系皇权，若是群臣纷纷效仿，父皇的话全当耳旁风，那还不大厦倾覆在即。”
“这样吧，”元顺帝无奈之下作出选择，“朕传旨免去扩廓贴木儿太傅左丞相的职务，只保留他河南王的封爵，而由我儿总制天下兵马。”
“谢父皇重用。”太子有几分得意，“其实早该如此，打仗亲兄弟，上阵父子兵嘛。”
“但愿那些统兵将帅能够听从你的调遣。”元顺帝忧心忡忡。
太子立即对兵马重新做了分派，扩廓贴木儿的前军改由他的弟弟脱因贴木儿统领，后军由白索珠统领，左军由中书平章李克彝统领，右军由和尔齐统领，这样扩廓贴木儿仅剩中军五万人马，实力大为削弱。他遂领五万人马，退守山西泽州以求自保。
明军徐达、常遇春据有山东后，便移师杀奔河南。太子调兵无力，元顺帝亲自颁诏，要陕西行省左丞相图鲁总统军马，李思齐、张良弼等为副，出兵河南抵御明军，但李思齐等拥兵自保均不奉命。
眼看河南形势危在旦夕，太常使陈祖仁等上书元顺帝，请求重新起用扩廓贴木儿。顺帝无奈，降旨加封扩廓贴木儿为都元帅，归还原领人马，并将关保五万人马归他节制。而太子对此大为不满，他担心一旦扩廓贴木儿兵权在手，会对自己进行报复，便密召关保，要其在合兵时偷袭扩廓贴木儿，然后十五万大军统由他指挥。
关保受命之后，自有他的打算。他趁扩廓贴木儿受职都元帅后，其守地泽州空虚，带兵攻进泽州，并顺势打下潞州，使得扩廓贴木儿失去了老巢。他闻报大怒，在太原城大开杀戒，将朝廷封下的所有官吏残杀殆尽，据有太原后，根本不向河南出兵。
朱元璋抓住元军内讧的大好时机，加紧调度兵力。命康茂才北上，会同大将邓愈进攻南阳，与徐达形成南北合击之势。同时派汤和的舟师自郓城溯黄河而上，直趋汴梁东北的门户陈桥，水陆同时对陈桥摆出了进攻的态势。
陈州守将左君弼见明军大兵压境，哪里还有抵抗的勇气，接到徐达的劝降书信，立即开城投降。而远在汴梁的中书平章政事李克彝，则将城中金银装满一百辆大车，早早退往府城洛阳，将汴梁拱手让于明军。
徐达兵不血刃占领汴梁，交部将陈德守城，自带大军追击李克彝，经由虎牢关直逼洛阳。元军毕竟还有忠勇之将，元将詹同和脱因贴木儿，在塔儿弯列开阵势，五万大军在洛水之北十五里分为三层阻击明军。双方对阵之后，詹同发二十骑持槊向明营冲杀过来，意图在声势上压倒明军。
徐达见状，也欲以二十骑对战。常遇春摘下弓箭说：“大将军何需许多人马，看我单人独骑胜他。”一箭射出，元军首骑先锋应声倒地。常遇春大吼一声，执枪冲杀过去，在元军阵中左冲右突，但见三四骑敌人先后落马。
徐达乘着常遇春得势，将令旗一挥，一万精骑呼啸跟进。时值南风骤发，烟尘蔽空，明军呼声震天动地，恰似惊雷滚过。元军阵脚大乱，脱因贴木儿哪里还能节制部下，被席卷着败下阵去。路上收拾残兵不足一万人马，逃往陕州去了，而李克彝慌张之下则窜至陕西行省。
徐达驱兵抵达洛阳城北，对洛阳形成了进攻的态势。慑于明军的气势，元河南行省平章梁王阿鲁温亲自打开城门，向徐达投降。在他的带动下，嵩州元将李知院，孟县守将参政李成以及福昌、钧州、许州、汝州、郏县等相继归降。徐达并不满足已有的胜利，遣同知冯胜会同康茂才两路大军进攻陕州。脱因贴木儿闻风而逃，冯胜紧追不舍进逼潼关。
元军守将李思奇守着天险却不敢接战，弃城而逃，冯胜遂于四月二十七日占领潼关。
朱元璋接到捷报，欣喜异常。传旨下去，要亲临前线指挥对元朝廷的最后战斗。他在路上行走二十七天，于五月二十二日到达汴梁。当即改其名称为开封，并以阳宪为省督，何文辉为河南指挥使，同时召开军事会议，商讨如何攻取元顺帝的老巢大都。
他先问徐达说：“大将军，今取大都，计将安出？”
徐达早有成竹在胸说：“万岁，臣自平齐鲁下河南，即已着眼对大都的攻占。今潼关已在我手，李思奇西窜，元将只有王保保尚有实力与我军对垒，然其亦不足为虑，臣想下大都只在两月之间。”
“卿所言极是，但亦不可轻敌。大都城外平旷利于骑战，而元军素以马军为主，不可无备。应以精兵为先锋，大将军督师与其后，由邺趋赵，转临清而北，多备山东米粟，围大都三门而放其一，彼外援断绝，城中缺粮，元帝内溃自生，必弃城出逃，则大局定矣。”
“万岁，留一门促元帝出逃，然其遁人大漠，则如鱼之入水，当留下无穷后患，臣意派一支精骑穷追不舍，务将其生擒或击毙，以绝后患。”
“元帝以马军为胜，其战力颇强。有道是穷寇莫追，如穷追则彼必死战，即便我胜也要付出较大代价。其窜至漠北，已属残余，不足为虑。下大都后，当攻云中、太原及关陇，全力扫平内地，而元帝只需防其扰边塞矣。”
“臣谨遵圣命。”徐达这才明了皇上的部署，难怪他要亲临前线。
朱元璋在开封，为取得攻元的最后胜利，传旨令浙江、江西及苏州等九府赶运粮食三百石到开封，以确保北攻大都的粮食供应。一切部署完毕，圣驾即将回返南京。徐达也将要发兵，七月二十四日，朱元璋回京前夕，再次召见徐达，殷殷告诫说：“大将军，元运将终，君有罪民无辜，当严饬部下，破城时万毋妄加杀戮焚掠。必使市不易肆，民安其生，上答天心，下慰人望。有违者，罪无赦。”
“臣遵旨。”徐达与皇帝拜别。
七月三十日，北伐元都的战役正式开始。徐达逐一发布将令，命右丞薛显，参政傅友德，左丞赵庸，平章曹良臣、俞通源，都督副使顾时，右丞梅思祖各领兵马一万准备北渡黄河。同时传令都督同知张兴祖、平章韩政、指挥使高显等，统领所辖益都、徐州、济宁的部队，也即时北上，与大军在临清会师。明军渡河后，接连攻占卫辉、彰德，磁州、邯郸、广平，真个是所向披靡势如破竹，各路军马会聚于临清。徐达又与常遇春在德州会师。
至此，已有三十万大军，对元大都形成了进攻的态势。
处于风雨飘摇中的元朝廷，依然是政令不通指挥不灵。将领们虽说是表面上还奉元顺帝为君，但没有一个人听从元顺帝的旨意。败走凤翔的李思奇与关保等合兵，拥甲十万之众，仍然打着元顺帝的旗号，征讨晋宁的扩廓贴木儿，意欲将他的兵马吞过来，扩大自己的实力。岂料扩廓贴木儿避实就虚，不与关保正面交手，而是乘夜偷袭其大本营，关保兵败被擒，李思奇也只有退兵。扩廓贴木儿上表元顺帝，指责关保擅自动兵意在谋叛，请求严厉惩处关保。元顺帝现下已无所依靠，借机恢复了扩廓贴木儿的官职，并准其将关保斩杀，但降旨要他带兵护驾，移兵至通州抵御明军。
扩廓贴木儿将关保依旨斩首，但他并不肯为元顺帝卖命，在山西晋宁按兵不动，以观胜败。同样，李思奇也不愿以自己仅有的实力去与明军硬碰，也在凤翔按兵不动。这样一来，就给徐达一个有利的局面。明军二十日进取长芦，继而兵趋清州，再向直沽，元丞相伊苏望风而逃，元朝上下大为震动。明军进逼河西务，一举击败守城元军，生擒将校三百余人。又乘胜追击，于七月二十五日兵临大都外围重镇通州，在城下安营扎寨。
元顺帝已然慌神，急忙升殿召开御前会议。文武大臣七嘴，八舌莫衷一是，有人要降有入主战。知枢密院布延帖木儿挺身而出说：“万岁不必惊慌，明军也非铁打，也是人生父母养，待微臣领十万精兵，前往通州迎敌，定将明军打败。”
“爱卿忠勇可嘉，朕先赏黄金千两，胜后还会厚加封赏。”元顺帝为保皇位已是不惜一切。
“万岁，臣料能够阻止明军的进攻势头，但要想击退明军，还需万岁再调遣几支人马。”
“京城之内，所有人马随卿调动。”
“万岁，速派得力大臣，分别前往扩廓贴木儿和李思奇处，要他们两支军马急速赴京救援。到时对明军形成三面夹击之势，何愁明军不败。”
元顺帝对于调兵没有底气说：“好吧，卿且去前线迎敌，朕即派重臣为钦差，催促两路人马驰援。”
布延帖木儿在京城点齐十万人马，怀忠勇之心杀往通州前线。明军大将郭英亲率两万人马与之交战。双方大战一个时辰，明军不敌，向南溃逃。
布延帖木儿大喜，将令旗一挥说：“明军大败，我军士气正盛，全力追击，扩大战果。”
元军首尝胜果，紧咬着明军猛追下去。追出约五里路远近，突然道路两侧连天炮响，百十面旗帜竖起，东侧汤和，西侧常遇春，各引五万伏兵齐出。而败逃的郭英则会合了徐达的五万大军，调转头来痛击元军。遭遇埋伏的元军，顿时阵脚大乱，哪里还能抵抗，纷纷抱头鼠窜，落荒而逃。明军肆意追杀，直杀得尸横遍野，甲仗辎重兵器到处遗弃，死伤有数万人。布延帖木儿逃回大都，收拢的败兵仅有一万多人，余下尽已逃散。
布延帖木儿败得这样快，败得这样惨，是元顺帝与满朝文武始料不及的。整个朝野大为震动，人们完全失去了信心。当夜，元顺帝在清宁殿召集御前会议，商讨局势和对策。绝大多数臣僚已是吓破胆，主张向明军投降。
元顺帝不肯说：“想我大元建朝已历百年，疆土广大，受命于天，岂能向一放牛小子称臣，这是万万不可的。”
左丞相失烈门见状言道：“万岁所论极是，堂堂大元，岂能降为阶下囚。想我大都，城高池深，且城内粮草颇丰，足可坚持数月。待各路勤王兵到，明军粮草难以为继，其必败无疑。”
知枢密院事黑厮也是主战派说：“我军虽败，然城内尚有人马十数万，足可守城，以待援兵。”
布延帖木儿依然反对投降说：“万岁，微臣轻敌中伏致遭败绩，然臣愿统兵守城，可保三月内城池不失。二钦差已是出京，料援军月内可至。届时内外夹击明军，我军定可转败为胜。”
元顺帝长叹一声说：“说什么援军月内可至，扩廓贴木儿与李思奇若早听朕的旨意，怎会有今日的糟糕局面。朕料他二人十之有九不会奉旨，只是自保而已。朕不能留在城中，坐等当徐达的俘虏。后宫更不能受明军之辱，朕要及早离开大都，保住大元这面旗帜，也好东山再起。”
“万岁，不能啊。”失烈门以头触地，啼血劝谏，“万岁坚守，大元犹存，万岁逃离，人心即失，大都不能丢呀！”
“是啊，大都不能轻易为明军所占。”元顺帝降旨，“着淮王帖木儿不花监国，庆同为左丞相，同守京师大都。”言罢，再也不听群臣的奏谏，万分留恋地看看清宁殿，掩面下殿去了。
夜半时分，元顺帝将后宫主要的嫔妃，及贵重金宝等装上百余车，拉上百余人，连夜出宫出城，离大都直趋漠北。淮王等人目送御驾去远，一个个无不摇头叹息，都明白前程就像这无边的黑夜一样，看不出路在何方。而有的人，在天明之前即已提前逃走。眼看离城的人越来越多，淮王不得不下令关闭大都所有城门。
八月初二，徐达大军兵临大都城下。当即派人送进劝降信，淮王自料大都尚可坚守数月，将送信的明军脊杖二十打出城去。徐达见招降无望，便于次日向大都的齐化门发起了攻击。
宽宽的护城河，首先是攻城的最大屏障。明军人众，徐达下令，每人背一袋沙土，倾入护城河中，两个时辰之后，护城河即被填满。明军呼叫着扑向城墙，竖起几百架云梯，争先恐后向城上爬去。
元军早无斗志，不待明军接近城头，即已弃城而逃。淮王与庆同都在城头督战，但二人管不了偌大的战线。眼前的兵士死战，远处的自己逃生。明军源源攻上城头，常遇春跳上来挺枪刺向淮王，只听噗的一声响，淮王被扎个透心凉。而那边汤和手起刀落，庆同的人头也已滚落在地。主帅一死，士卒们顿作鸟兽散，大都转眼之间落于明军之手。
徐达首先冲入宫中，把大元的王子六人俘获，还一并缴获了玉玺、图书、金印以及无数的宝物。徐达下令把所有的宫女都赶到大殿中集中看管，还把所有的府库都加封，并对兵马进行了部署，对大都进行防御，防止元军的残留部队进行反扑。等一切安排妥当之后，具表派快马到南京向洪武帝报捷。
由此，统治了中国九十九年的元帝国，宣告完结。一个新的王朝又开始了它崭新的一页。