却说辅公佑弃城而走，想南奔越州，因左仙游己就任越州总管，所以有心投奔之。偏巧唐将李靖、张一妹夫妇早领兵入丹阳堵截，徐茂公不肯放松，连夜带领飞骑追袭而来。辅公佑逃奔至华容，随从护骑只有五百人，到了日薄西山，投宿常州，闻知部将吴骚等，正想擒拿于他献与唐军，便连忙斩关急急逃跑，随身妻子，一并弃去，只有心腹数十人，走至武康，为山上强盗所攻击，西门君仪战死，辅公佑被擒拿，送到丹阳，立即斩首，将头颅传送至长安。又出兵抓捕余党，凡自左仙游以下部将，多半捕杀，约计辅公佑称帝，仅有六七个月，即被歼灭之。江南皆平定，高祖李渊大喜，手抚长髯道：“李靖原是萧铣、辅公佑得力干将，只因二人不识将才而充之未用；虽古时名将韩信、白起、卫青、霍去病，也不过如此。”
于是授命李孝恭为东南道行台右仆射，李靖为行台兵部尚书。不久行台罢撤，孝恭改任扬州大都督，李靖为都督府长史，唯有张善安押解送到京都，当廷讯问时将罪责推委于诸将，自称无辜；高祖却也赦免，旋即由丹阳住宿搜得叛逆书函，由李孝恭尽行上送至廷前御览，张善安与辅公佑通书，无可抵赖，方才伏罪被诛杀。
只有辅公佑伪造的杜伏威诈降之书函，也由高祖一一检视，遂怀疑为实事，旋即追除杜伏威名籍，没收全部家产。阚陵恃功自傲，为李孝恭所恶，也把他所有田产，一并没收。阚陵不服，竟然愤起与李孝恭争辩，惹得李孝恭敬怒火烧心，也诬告他与辅公佑通谋，杀死了事。杜伏威受枉屈，阚陵尤觉含冤。李孝恭之过，百口难辞其咎。秦王李世民、平阳公主等颇知杜伏威、阚陵二人含冤，及至太宗即位初年，始为昭雪，发还家产，这是后话暂且慢述。
话说唐高祖（李渊夺得隋江山）武德七年，中原大势，己归统一，所有从前揭杆而起的--包括三十六路烽火、七十二路烟尘等割据州县的称孤道寡之辈，尽被扫灭；只有梁师都尚占据阴山漠北，未曾平定。高祖暂息兵争，整顿国治，于是正官阶，定学制，修刑法，官阶分作数级，以太尉、司徒、司空为三公；次尚书、门下、中书、秘书、殿军、内侍等为六省；又次为御台史，又次为太常、光禄、卫尉、宗正、太仆、大理、鸿胪、司农、太府，共九等；又次为将作监，又次为国子学，又次为天策上将府属；又次为左右卫至左右领卫为十四卫；东宫置三师即太师、太傅、太保。三少即少师、少傅、少保。詹事，王公置府佐国官，公主置职司，并为京职事官；州县镇戍，为外执事官。
文官自从一品起，至从九品，分为二十八阶；武官自从一品起，至从九品，分三十一阶，大致是参照隋制，互有损益；学制有国子学（三品以上之子孙入之）、太学（四五品以上之子孙入之）、四门学（六七品之子孙及寻常百姓之优秀者入之）、律学（八品九品之子孙及寻常百姓优秀法令者入之）、书学（习文字者入之）、算学（习计数者入之）等六种，均属国子监。唯崇文馆弘文馆等，为皇室宗亲及功臣子弟入学，不归国子监统辖。此外如各州县乡，一律置学，限年毕业，按次递升，与选举法并行，学校以习经（中秀才）为主要科；选举（中举人）以命策为主要科，各有进阶，不相混杂。刑法多从隋旧，十恶不赦--谋反、谋大逆、谋叛、恶逆、不道、大不敬、不孝、不睦、不义、内乱。五刑--笞、杖、徒、流、死。八议等俱依隋制及租、庸、调三法与隋制互有异同；士大夫既经食禄，不得与民争利，征取有制，四海升平……
正在整顿国治的时候，忽然庆州闹出了一大骇闻，乃是都督杨文戟造反，全州俱被占领了。原来杨文戟曾卫戍东宫，与太子李建成最相亲近。建成与秦王世民有隙，常与杨文戟密谋，欲害世民，李元吉亦也暗中参与之，且冲建成道：“欲杀世民，但教小弟一举手，便可了事，何必多设谋划呢。”杨文戟点头赞成。一天，世民跟随高祖造访元吉府弟，元吉便命护卫长宇文宝等死士，埋伏室内，因而暗地告诉建成，欲履行前言。建成摇手劝止。元吉不悦道：“我不过为兄设法，与我何关得失呢？”建成道：“弟不闻投鼠忌器吗？父皇己老，倘或受惊吓，岂非罪有不孝。”元吉乃止。
太子建成私下招募了壮士二千余人，为东宫卫士，更调入了幽州健儿三百余骑，分置东宫练兵场，一面荐举杨文戟为庆州总管，暗令募选骁勇骑士，送入长安。高祖幸临仁智宫，建成担任守护职责，世民、元吉皆随行，建成对元吉道：“秦王此行，且遍见宫廷诸妃，必赠予重金，诸妃得了厚赂，总会替秦王帮忙，我怎能箕踞受祸？安危大计，决诸今日。”元吉笑道：“兄前日若依了小弟之言，此人已早除去了。”建成道：“今日父皇出行，可以举事。”元吉问计将安出？建成附耳道：“如此如此。”元吉抚掌道：“此计甚妙。”遂与建成别去，建成即暗令中郎将朱焕，校尉乔公山，秘密运送甲仗，前往杨文戟大营，令他迅速起兵接应。朱焕等人行至中途，恐怕事泄招来杀身之祸，径向高祖前告密。高祖大怒，立马派遣司农宇文颖快马驰往杨文戟招安；元吉闻知，心中捏着一把冷汗，忙嘱咐宇文颖传话与杨文戟，令勿入京。杨文戟既得宇文颖密语，便道：“一不做，二不休，我不如造反罢！”于是领五万精兵袭击宁州；高祖又亲书手诏，催促召见建成，建成大为恐惧，不敢随行。手下谋士赵弘智，力劝建成单骑前往请罪。建成左思右想，也无别法，不得己只身往抵行宫，拜见高祖，便投身伏地，接连磕头。高祖责骂一番，命武士拘禁废太子建成于大牢。那宁州警报，己似雪片般到来，初说被反兵围攻，继而城被攻陷。高祖忙召见秦王世民、公主三娘问计，欲待讨平反兵后立世民为太子。二人道：“杨文戟那逆子有何畏惧，地方有兵马，如不能剿灭。但派遣一将前往征讨，自可立马平定。”于是世民、三娘领兵十万，快速驰援宁州。杨文戟部众，闻报己是惊惧万分，旋即刺杀杨文戟，出城迎降。宇文颖也被擒住，送往长安，审明后而依法斩首……至唐大军报捷长安，高祖也己还朝，却不再提及立太子之事，世民等料知中变，付诸一笑罢了……