莉莲对沃尔特的宏大目标总是感到担心，但当他取得成功之后，她会感到非常骄傲；当沃尔特受人尊敬时，她会非常开心。沃尔特和罗伊的关系也越来越近了，兄弟俩的合作比以前和谐多了。此时的罗伊也老了，有了退休的打算，但沃尔特则坚决不允许，没办法，罗伊只好推迟了自己退休的计划。
沃尔特得到了很多荣誉，但让他感到最为满足的还是用他的名字命名的三个学校：一个在宾夕法尼亚州的杜利镇，第二个在他的故乡马瑟琳，第三个就在迪士尼乐园的附近。他为这些学校投入了不少心血和财力，但他认为这些都是值得的。他一向对公益事业充满热情，现在他有能力做这些事了，他为此感到自豪。
虽然身体和精力明显不如从前了，但好像还是有很多事情需要他去做。每天他要去视察沃伊迪公司，准备拍摄影片《最快乐的百万富翁》，还要参加一些慈善活动，主持电视节目，等等。这时候的沃尔特依旧很忙。
有空的时候，沃尔特就开着自己的那架小飞机去旅行。在7月份的时候，他还租了一条长140英尺的游船，要带领全家穿越大不列颠哥伦比亚水域。
就是在这次旅行中，沃尔特的身体情况进一步恶化了，但他依旧坚持工作。
旅行回来后，他没顾得上休息，就去视察迪士尼乐园在新奥尔良广场的开幕式会场，结果因为实在难以忍受身体的疼痛，才不得不到医院做检查，医生告诉他，他的颈钙化严重，只有做手术才能减轻痛苦。沃尔特执意认为他需要先安排好自己的工作，等到年底再进行手术。
沃尔特每天有许多的事情要忙。1966年9月19日，沃尔特和当时的加州州长布朗在矿王谷举行了一次记者招待会。10月初，沃尔特来到迪士尼乐园召开了一场会议。10月下旬，沃尔特接受了一位记者的采访，再次向他描述了“未来城市”的规划。
10月29日，沃尔特乘坐飞机来到东部，在威廉斯堡接受美国森林协会的奖章，奖励他对美国资源的保护。
回到加州后，沃尔特的病情更加严重了，他意识到自己动手术的事情不能再拖延了。11月2日，沃尔特再次被送进医院，X光透视发现他左肺有核桃大的阴影。医生告诉他，手术必须马上进行。
悄悄离去
生命是有极限的，自古至今没有万寿无疆的人。死亡是生命的必然结果，也是大自然的客观规律，谁都无法抗拒。生命对任何一个人来说都是宝贵的，但是对于那些充满了创造力，为人类带来无限希望的人来说，死亡还是令人遗憾的。
沃尔特在医院躺了两周，就有些厌烦了。手术后没多久，他就出院了。他出院的第一件事就是去察看他的制片厂。所有人见到他后都非常吃惊，他看起来太虚弱了，以至于大家都担心他随时会倒下去。当时，有一部影片《黑胡子幽灵》正在拍摄，沃尔特又去看了一下，和工作人员进行了交流，叮嘱他们一定要把片子做好，把最好的东西奉献给观众。
在生命的最后几周里，特别是1966年11月6日到12月6日之间，沃尔特的病情开始恶化，他的心脏供血已经不能正常循环了，身体情况越来越不好，有时甚至神志不清。
1966年12月14日下午，一直守护在沃尔特身边的莉莲惊喜地发现，沃尔特的状态大有好转，神志清醒，笑容满面。她打电话告诉黛安妮，沃尔特已经起床了，她相信他会好起来的，他会康复的。之后，罗伊又来到医院看望他的弟弟，沃尔特此时最大的忧虑还是奥兰多的迪士尼世界，罗伊答应他会不惜一切代价，一定让迪士尼世界成功开幕。罗伊的承诺让沃尔特如释重负。当天晚上，兄弟俩一起度过了一个愉快的夜晚，他们回忆了在仙鹤农场时期快乐的童年时光，也想到了兄弟两人因为经济困难合吃一盒饭的艰难日子，还说到了他们各自的幸福家庭。第二天，也就是12月15日，是沃尔特的65岁生日，但是他的身体太羸弱了，无法欢度自己的寿辰，他的力气越来越小，声音也更加沙哑和微弱。
罗伊看得出，他的弟弟已经到了最后时刻，但是沃尔特依旧坚强和自信，他的安静和镇定让人吃惊，亲人们围着他，祝他生日快乐，也祝他早日康复。
当天早晨9点30分，沃尔特·迪士尼停止了呼吸，终年65岁。根据死亡证明，他是因为急性心脏循环衰竭而去世的。
1966年12月16日，沃尔特去世的第二天，在博班克附近的利特尔教堂举行了一个私人追悼会，来参加的人仅限于沃尔特的直系亲属，然后在加州好莱坞山丘的林间墓地举行葬礼，他的家人没有送花，而是以向加州艺术学校捐款来代替。
按照沃尔特的遗嘱，莉莲被指定为受托管理产业和遗嘱的执行人，并接管他所有的个人财物。她继承了沃尔特全部财产的一半，这些财产在沃尔特去世时约值350万美元，这些是他在一生的最后10年里的收入。
按照沃尔特的遗嘱，另一半财产分为三份托管。第一份：45%归莉莲、黛安妮和休伦；第二份：45%归沃尔特·迪士尼基金会；第三份：10%给三个侄女（沃尔特三个哥哥的女儿）和妹妹露丝，这样一来每人可分得2.5%，沃尔特没有留什么给哥哥雷蒙特和罗伊，他认为男人应该奋斗，应该以自己的能力获得财富和地位。
在归属基金会的财产中，5%要用于资助按基金会的意见运作的其他慈善组织，95%归加州艺术学院。
他的永生
沃尔特走了，那个给人们带来过无尽欢乐的人永远地离开了，人们无法接受这样残酷的事实，哀恸笼罩着整个美国。世界各国的报纸都在报道沃尔特·迪士尼逝世的消息，称其为“人类的损失”。一些国家元首也致电哀悼。各地的评论员都对沃尔特取得的成就给予高度评价。
《洛杉矶时报》评论道：“白手起家的沃尔特，凭着自己的绘画天赋和丰富的想象力成为好莱坞最富有传奇色彩的企业家，也是世界上最有名的娱乐专家。”
《伦敦时报》称他的作品“具有无人能比的艺术技巧和动人的美感”。
荷兰的一家报纸称沃尔特是一个“发展儿童娱乐世界几十年的国王”。
墨西哥一家报纸说全墨西哥的儿童都为之悲伤，而且“成年人的眼中也会很容易地看到眼泪”。
沃尔特的朋友、美国前总统艾森豪威尔说：“他的面容和影响力是全球性的，而不仅仅在美国这片土地上，因为他奏响了全人类的交响曲。”
后来美国哥伦比亚广播公司《晚间新闻》的评论，把美国人失去沃尔特的心情更确切地表达出来：
……
沃尔特·迪士尼影响了无数人，虽然他去世已经有半个世纪了，但他一直活在人们的心中。观看他的经典影片的观众越来越多。遭受过失败的《爱丽丝梦游仙境》、米老鼠系列的重映，在新一代观众中引起了很大的反响。即使沃尔特只拍摄卡通或真人影片，在历史上也会名垂青史，但他做得更多。他不但创建了迪士尼乐园，还为“未来城市”创建了雏形。
沃尔特·迪士尼说过这样的话：“人要活在现实与梦想之间，梦想的目的是要把你带到悬崖边，再将你一脚踢下去，这样你才会展开飞翔的翅膀。”
我们这个时代需要像沃尔特这样的人，我们同样也需要在现实与幻想之间穿梭。对于芸芸众生来说，沃尔特·迪士尼就是那在悬崖边踢我们一脚、让我们展开梦想之翼的人。
卓越的罗伊·迪士尼
对于整个迪士尼公司来说，沃尔特的去世都是一个致命性的打击。在迪士尼工作室、沃伊迪公司以及迪士尼乐园等各个地方都再也见不到沃尔特的身影了。无论是新来的员工还是与沃尔特共事三十几年的老同事，都深切地感觉到，现在公司的重任落到了罗伊身上，他将要继承沃尔特开创的事业，继续引领公司走向辉煌。
此时的罗伊已经73岁了，沃尔特的离世使他不得不放弃退休的念头，承担起公司的所有事务，让公司按照沃尔特的方式继续运行。对于沃伊迪公司的事务，他也努力地去了解。同时还成立了一个八人委员会来负责电影生产工作，其中有米勒和小罗伊，这些人曾是与沃尔特密切合作的人，也是沃尔特最信任的人。在罗伊看来，对于管理这么大的一个公司而言，委员会并不是最佳的经营方式，但是暂时必须这样，直到新的领导者出现了再说。