杨昌济把与学生智育发展相适应的教育方法称为“教授”，即给学生传授知识技能，养成发达智力。同时指出活动于学生智育发展方面的“教授”与活动于学生德育方面的“训练”有着不可分割的联系。“吾人为教授之时，同时为训练；为训练之时，同时为教授”。但两者的目的和侧重点有所不同，“教授”在于“授予智识、发达心身之能力”，“训练”主要是端正意志和性格的发展方向，养成优良的品性。他把课堂教学的基本模式称之为“教授之形式阶段”，简称为“教段”。当时西欧、日本教育家提出三段、四段、五段教学法，他进行分析比较，认为德国赖因的“五段教学法”即“预备、提示、比较、总括、应用”最为合理，因为它适合心理学与论理学的原理“先使得具体的观念，后使构成抽象的概念，适合心理发展之次序。先提示，次比较，次综合，由特殊而普通，此论理学上之归纳法也。综合之后，复有应用之一段，由普通而特殊，此论理学上之演绎法也。教者苟深明此中之妙而善用之，则教授可以收完全之效果矣”。他把教学方法称为“教授之方式”，简称为“教式”。教式“大别为两种：其一，唯教师活动，或讲演，或说明，被教育者唯取受动的态度，以收纳知识，通例谓之注入的教式；其二，教师自问答法，使被教育者活动，使被教育者发明关于某事项之知识，通例谓之开发的教式。”、“注入的教式”（即注入式）又分为“示教的教式”、“示范的教式”、“讲演的教式”三种；“开发的教式”（即启发式）分为“课题式”、“问答式”两种。杨昌济主张多采用启发式，但反对废止注入式。他说：“此两种教式，各有其相当的价值，固无优劣之殊，但现在学校所用之教式，多偏于注入的。与其偏于注入的，不如偏于开发的，其弊害较少也。”、“人有排斥注入的教式而以开发的教式为万能者，此谬见也。”同时，他注重个别教育，主张勤抄、熟记，博览群书。
