小菇蕾死亡的原因很多，较常见的有以下几种情况：
第一，在采菇和整理菇床时，出现一部分小菇死亡，这主要 是由震动或机械损伤造成的。
第二，遇到持续高温，菇房内温度升到22℃以上，又停止喷 水，就会造成小菇成批死亡。
第三，菇房通风不良，严重缺氧，尤其是在高温、高湿的情 况下，小菇更容易闷死烂掉。
第四，长期喷水漏入培养料，造成菌丝窒息而死，小菇成批 死亡。
第五，发生病虫害，特别是一些危险的病虫害，也会造成小 菇大批死亡。
第六，滥用农药，产生药害，造成小菇死亡。
第七，土粒含盐分高，经喷水淋洗，盐分沉积到土粒和培养 料接触处，形成一层“高渗隔离层”，使菌丝生长和输送养 分受到阻碍，甚至萎缩，造成小菇成批死亡。